Protein–RNA interactions for Protein: B2RUZ4

SMIM1, Small integral membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 78 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM1B2RUZ4 ZNF460-202ENST00000537645 2037 ntTSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
SMIM1B2RUZ4 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
SMIM1B2RUZ4 LGALS12-204ENST00000415491 1816 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
SMIM1B2RUZ4 KCTD9-201ENST00000221200 3401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
SMIM1B2RUZ4 PTCHD3-201ENST00000438700 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
SMIM1B2RUZ4 PHF21B-201ENST00000313237 3671 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
SMIM1B2RUZ4 PLOD2-202ENST00000360060 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
SMIM1B2RUZ4 USP39-207ENST00000450066 2086 ntTSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
SMIM1B2RUZ4 POU2F2-202ENST00000389341 6901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
SMIM1B2RUZ4 MTMR11-201ENST00000369140 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
SMIM1B2RUZ4 IFT81-202ENST00000361948 3048 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
SMIM1B2RUZ4 C16orf45-202ENST00000452191 1865 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
SMIM1B2RUZ4 SLC2A14-213ENST00000539924 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
SMIM1B2RUZ4 C1QTNF1-204ENST00000392445 2833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
SMIM1B2RUZ4 DIAPH2-202ENST00000355827 3782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
SMIM1B2RUZ4 AC004846.1-201ENST00000554614 3050 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
SMIM1B2RUZ4 STXBP6-202ENST00000396700 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
SMIM1B2RUZ4 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
SMIM1B2RUZ4 LINC01341-202ENST00000421003 2600 ntTSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
SMIM1B2RUZ4 PORCN-204ENST00000361988 1672 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
SMIM1B2RUZ4 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
SMIM1B2RUZ4 CKMT2-203ENST00000437669 1479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
SMIM1B2RUZ4 PLAT-201ENST00000220809 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
SMIM1B2RUZ4 ACIN1-204ENST00000397341 2738 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
SMIM1B2RUZ4 KCNMA1-216ENST00000457953 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
SMIM1B2RUZ4 SLC7A8-205ENST00000453702 1752 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
SMIM1B2RUZ4 C19orf18-201ENST00000314391 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
SMIM1B2RUZ4 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
SMIM1B2RUZ4 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
SMIM1B2RUZ4 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
SMIM1B2RUZ4 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
SMIM1B2RUZ4 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.74□□□□□ -0.85
SMIM1B2RUZ4 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
SMIM1B2RUZ4 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
SMIM1B2RUZ4 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
SMIM1B2RUZ4 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC9.74□□□□□ -0.85
SMIM1B2RUZ4 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
SMIM1B2RUZ4 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC9.74□□□□□ -0.85
SMIM1B2RUZ4 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC9.74□□□□□ -0.85
SMIM1B2RUZ4 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC9.74□□□□□ -0.85
SMIM1B2RUZ4 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
SMIM1B2RUZ4 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
SMIM1B2RUZ4 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
SMIM1B2RUZ4 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
SMIM1B2RUZ4 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
SMIM1B2RUZ4 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
SMIM1B2RUZ4 AC008050.1-201ENST00000554926 632 ntTSL 3 BASIC9.74□□□□□ -0.85
SMIM1B2RUZ4 AC007376.2-201ENST00000556271 540 ntTSL 3 BASIC9.74□□□□□ -0.85
SMIM1B2RUZ4 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC9.74□□□□□ -0.85
SMIM1B2RUZ4 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
SMIM1B2RUZ4 JPT2-214ENST00000569765 782 ntTSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
SMIM1B2RUZ4 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC9.74□□□□□ -0.85
SMIM1B2RUZ4 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC9.74□□□□□ -0.85
SMIM1B2RUZ4 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
SMIM1B2RUZ4 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
SMIM1B2RUZ4 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
SMIM1B2RUZ4 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
SMIM1B2RUZ4 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
SMIM1B2RUZ4 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
SMIM1B2RUZ4 GCOM1-214ENST00000587652 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
SMIM1B2RUZ4 NPC1-201ENST00000269228 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
SMIM1B2RUZ4 ACO1-203ENST00000541043 3618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
SMIM1B2RUZ4 PPP1R13L-201ENST00000360957 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
SMIM1B2RUZ4 AP1B1-202ENST00000357586 4176 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
SMIM1B2RUZ4 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
SMIM1B2RUZ4 C1S-202ENST00000360817 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
SMIM1B2RUZ4 RPL15-213ENST00000611050 2363 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC9.74□□□□□ -0.85
SMIM1B2RUZ4 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
SMIM1B2RUZ4 POU2F2-204ENST00000526816 3218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
SMIM1B2RUZ4 PABPC1-208ENST00000519004 2401 ntTSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
SMIM1B2RUZ4 CAPN14-202ENST00000403897 2197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
SMIM1B2RUZ4 SH2D7-202ENST00000409568 2162 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
SMIM1B2RUZ4 ANKRD30B-202ENST00000358984 4359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
SMIM1B2RUZ4 GUCY1B3-205ENST00000505764 2456 ntTSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
SMIM1B2RUZ4 FCHSD1-209ENST00000522783 2477 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
SMIM1B2RUZ4 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
SMIM1B2RUZ4 RIPK4-201ENST00000332512 3889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
SMIM1B2RUZ4 CACNA1G-233ENST00000515765 6981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
SMIM1B2RUZ4 OGFOD1-209ENST00000568397 1681 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
SMIM1B2RUZ4 ADCY4-202ENST00000418030 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
SMIM1B2RUZ4 BMT2-201ENST00000297145 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
SMIM1B2RUZ4 POLD1-210ENST00000599857 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
SMIM1B2RUZ4 PRKN-205ENST00000366897 2877 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
SMIM1B2RUZ4 NRXN1-207ENST00000404971 7578 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
SMIM1B2RUZ4 MLPH-201ENST00000264605 3823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
SMIM1B2RUZ4 ADCYAP1R1-201ENST00000304166 6487 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
SMIM1B2RUZ4 G6PD-201ENST00000369620 1799 ntTSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
SMIM1B2RUZ4 LINC01671-201ENST00000419628 1775 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
SMIM1B2RUZ4 SUCO-202ENST00000367723 5916 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
SMIM1B2RUZ4 AC115284.2-201ENST00000624646 2054 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
SMIM1B2RUZ4 CYB5A-202ENST00000340533 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
SMIM1B2RUZ4 AGAP2-203ENST00000547588 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
SMIM1B2RUZ4 ASB2-201ENST00000315988 2743 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
SMIM1B2RUZ4 ARHGEF17-201ENST00000263674 7853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
SMIM1B2RUZ4 INTS1-201ENST00000404767 6959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
SMIM1B2RUZ4 MCPH1-AS1-201ENST00000515608 2147 ntTSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
SMIM1B2RUZ4 RERG-204ENST00000536465 2134 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.73□□□□□ -0.85
SMIM1B2RUZ4 AC026271.4-201ENST00000578214 1833 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
SMIM1B2RUZ4 PHB-210ENST00000511832 1509 ntTSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
SMIM1B2RUZ4 COPS7B-223ENST00000611614 2468 ntTSL 3 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms