Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3F1

Putative TAP2-associated 6.5 kDa polypeptide, humanhuman

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Length 56 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9Y3F1 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q9Y3F1 AC022080.1-201ENST00000366255 781 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Q9Y3F1 RPL10-203ENST00000406022 748 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q9Y3F1 AF274858.1-201ENST00000406288 372 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Q9Y3F1 AL035413.1-201ENST00000437898 507 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q9Y3F1 ZMIZ1-AS1-202ENST00000440151 814 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q9Y3F1 FAM138B-202ENST00000446648 1130 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q9Y3F1 FAM138C-202ENST00000449442 1126 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q9Y3F1 CASP3-205ENST00000517513 964 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q9Y3F1 NDRG1-209ENST00000518176 888 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q9Y3F1 KNOP1P1-201ENST00000542108 989 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Q9Y3F1 AC073569.2-201ENST00000551995 354 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q9Y3F1 MIR4326-201ENST00000582203 59 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Q9Y3F1 AC008982.2-201ENST00000600473 493 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q9Y3F1 RNF103-CHMP3-202ENST00000604011 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q9Y3F1 AC018695.6-201ENST00000614011 534 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Q9Y3F1 FAM138F-201ENST00000631376 1183 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q9Y3F1 ESR1-214ENST00000638569 132 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q9Y3F1 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q9Y3F1 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q9Y3F1 LINC02396-202ENST00000550636 2324 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q9Y3F1 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q9Y3F1 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q9Y3F1 LGALS4-201ENST00000307751 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q9Y3F1 PAK3-208ENST00000446737 2550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q9Y3F1 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q9Y3F1 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q9Y3F1 ATP5A1-201ENST00000282050 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q9Y3F1 HSPA8P5-201ENST00000456928 2069 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Q9Y3F1 UGP2-207ENST00000467648 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q9Y3F1 MARK2-206ENST00000425897 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q9Y3F1 PLEKHB2-206ENST00000409612 2210 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q9Y3F1 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q9Y3F1 UBA1-202ENST00000377269 2497 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q9Y3F1 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q9Y3F1 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q9Y3F1 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q9Y3F1 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q9Y3F1 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q9Y3F1 PTGER4P2-201ENST00000328411 252 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Q9Y3F1 MAL-204ENST00000354078 831 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q9Y3F1 RPL10-202ENST00000369817 1284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q9Y3F1 IFNLR1-203ENST00000374418 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q9Y3F1 IL18BP-206ENST00000393707 1037 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q9Y3F1 ZNF286A-201ENST00000395893 654 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q9Y3F1 GGTLC4P-201ENST00000402176 664 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Q9Y3F1 AL080243.1-201ENST00000423293 1060 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Q9Y3F1 AL929302.1-201ENST00000426556 871 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Q9Y3F1 ARSEP1-202ENST00000430152 499 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q9Y3F1 RPL3P5-201ENST00000441645 1232 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Q9Y3F1 AC069208.1-205ENST00000456299 576 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q9Y3F1 PTGER4P3-201ENST00000458150 252 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Q9Y3F1 AC092903.1-201ENST00000466506 262 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Q9Y3F1 TMEM222-204ENST00000466759 368 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q9Y3F1 LRRC75A-AS1-214ENST00000487066 763 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q9Y3F1 RN7SL147P-201ENST00000487345 298 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Q9Y3F1 RN7SL288P-201ENST00000490496 291 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Q9Y3F1 PAX5-210ENST00000520281 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q9Y3F1 AC105219.2-201ENST00000527908 299 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q9Y3F1 AC009065.6-201ENST00000568795 456 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q9Y3F1 ZNF737-204ENST00000596797 569 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q9Y3F1 AL078590.3-205ENST00000606039 465 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q9Y3F1 MIR8071-1-201ENST00000616769 65 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Q9Y3F1 MIR8071-2-201ENST00000616772 65 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Q9Y3F1 AL139424.3-202ENST00000641619 917 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Q9Y3F1 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q9Y3F1 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q9Y3F1 SALL4P6-201ENST00000429385 1691 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Q9Y3F1 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q9Y3F1 SC5D-201ENST00000264027 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q9Y3F1 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q9Y3F1 SLC38A4-201ENST00000266579 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q9Y3F1 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q9Y3F1 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q9Y3F1 SHCBP1-201ENST00000303383 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q9Y3F1 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q9Y3F1 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q9Y3F1 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q9Y3F1 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q9Y3F1 AC007388.1-204ENST00000449569 2517 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q9Y3F1 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q9Y3F1 ADK-205ENST00000539909 1866 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q9Y3F1 DDC-AS1-201ENST00000454521 1776 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q9Y3F1 CHRNA2-201ENST00000240132 1735 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q9Y3F1 IFT22-210ENST00000517481 1657 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q9Y3F1 PHKG1-201ENST00000297373 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q9Y3F1 GSTM4-204ENST00000369836 1412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q9Y3F1 PRL-201ENST00000306482 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q9Y3F1 SFXN4-201ENST00000355697 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q9Y3F1 FLAD1-202ENST00000295530 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q9Y3F1 HIST1H2AE-201ENST00000303910 509 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q9Y3F1 HBB-201ENST00000335295 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q9Y3F1 BUD23-204ENST00000423497 1219 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q9Y3F1 AC093609.1-201ENST00000434020 952 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q9Y3F1 NME6-208ENST00000435684 599 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q9Y3F1 DLEU2-205ENST00000443587 705 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q9Y3F1 BX072579.1-201ENST00000449453 344 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q9Y3F1 UBR5-AS1-202ENST00000520820 800 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q9Y3F1 C9orf135-205ENST00000527647 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q9Y3F1 RPAIN-205ENST00000536255 1057 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
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