Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSA2

KCND1, Potassium voltage-gated channel subfamily D member 1, humanhuman

Predictions only

Length 647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCND1Q9NSA2 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KCND1Q9NSA2 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KCND1Q9NSA2 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KCND1Q9NSA2 ESRRAP2-203ENST00000453309 822 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KCND1Q9NSA2 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KCND1Q9NSA2 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KCND1Q9NSA2 PRSS30P-205ENST00000506153 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KCND1Q9NSA2 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KCND1Q9NSA2 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KCND1Q9NSA2 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
KCND1Q9NSA2 PLOD2-202ENST00000360060 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KCND1Q9NSA2 SSBP2-220ENST00000615665 4465 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KCND1Q9NSA2 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KCND1Q9NSA2 TRIM4-203ENST00000355947 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KCND1Q9NSA2 KRT17P5-202ENST00000444070 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KCND1Q9NSA2 NKX2-1-AS1-201ENST00000521292 1775 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KCND1Q9NSA2 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KCND1Q9NSA2 MALL-201ENST00000272462 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KCND1Q9NSA2 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KCND1Q9NSA2 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KCND1Q9NSA2 ELP2-221ENST00000542824 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KCND1Q9NSA2 ROBO4-201ENST00000306534 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KCND1Q9NSA2 C5orf56-206ENST00000612967 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KCND1Q9NSA2 ZNF302-203ENST00000457781 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KCND1Q9NSA2 BSCL2-206ENST00000405837 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KCND1Q9NSA2 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KCND1Q9NSA2 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KCND1Q9NSA2 SLC35F2-203ENST00000525071 3331 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KCND1Q9NSA2 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KCND1Q9NSA2 SLC35A4-203ENST00000612662 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KCND1Q9NSA2 ATXN2L-215ENST00000564304 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KCND1Q9NSA2 MAP7-202ENST00000432797 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KCND1Q9NSA2 ATCAY-201ENST00000450849 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KCND1Q9NSA2 BEND6-202ENST00000370746 2379 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KCND1Q9NSA2 NEK3-205ENST00000610828 2396 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KCND1Q9NSA2 PLA2G6-202ENST00000335539 3060 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KCND1Q9NSA2 LSM14A-201ENST00000433627 3424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KCND1Q9NSA2 KRT17P4-205ENST00000579946 2555 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KCND1Q9NSA2 DPH2-202ENST00000396758 1738 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KCND1Q9NSA2 MARK2P16-201ENST00000605714 1723 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
KCND1Q9NSA2 UBE2I-204ENST00000397515 3109 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KCND1Q9NSA2 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KCND1Q9NSA2 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KCND1Q9NSA2 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KCND1Q9NSA2 STIM1-201ENST00000300737 4038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KCND1Q9NSA2 PGGHG-204ENST00000409655 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KCND1Q9NSA2 AOC4P-203ENST00000566825 2289 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
KCND1Q9NSA2 OSBPL2-203ENST00000439951 3886 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KCND1Q9NSA2 DCAF6-201ENST00000312263 3186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KCND1Q9NSA2 Z98885.3-201ENST00000624882 1757 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
KCND1Q9NSA2 ALG11-204ENST00000616513 1983 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KCND1Q9NSA2 GPX3-201ENST00000388825 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KCND1Q9NSA2 AC124319.4-201ENST00000622931 2161 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
KCND1Q9NSA2 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KCND1Q9NSA2 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KCND1Q9NSA2 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KCND1Q9NSA2 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KCND1Q9NSA2 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KCND1Q9NSA2 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KCND1Q9NSA2 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KCND1Q9NSA2 ANO1-AS2-202ENST00000533327 498 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KCND1Q9NSA2 AL512310.5-201ENST00000551999 515 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
KCND1Q9NSA2 FBXL12-202ENST00000585379 956 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KCND1Q9NSA2 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KCND1Q9NSA2 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KCND1Q9NSA2 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KCND1Q9NSA2 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
KCND1Q9NSA2 NUP54-201ENST00000264883 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KCND1Q9NSA2 DDX12P-201ENST00000432996 2947 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
KCND1Q9NSA2 NPR1-202ENST00000368680 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KCND1Q9NSA2 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KCND1Q9NSA2 HDAC8-207ENST00000373573 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KCND1Q9NSA2 NCS1-201ENST00000372398 4991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KCND1Q9NSA2 ZWILCH-203ENST00000535141 2206 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KCND1Q9NSA2 RBPJ-203ENST00000345843 1682 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KCND1Q9NSA2 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KCND1Q9NSA2 KCNMA1-287ENST00000640632 2808 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KCND1Q9NSA2 COLCA2-202ENST00000526216 1332 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KCND1Q9NSA2 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KCND1Q9NSA2 BX255923.2-202ENST00000620833 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KCND1Q9NSA2 DLX1-201ENST00000341900 2130 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KCND1Q9NSA2 TROVE2-206ENST00000400968 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KCND1Q9NSA2 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KCND1Q9NSA2 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KCND1Q9NSA2 AC087386.2-201ENST00000623212 4637 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
KCND1Q9NSA2 AJUBA-201ENST00000262713 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KCND1Q9NSA2 PLSCR1-214ENST00000487389 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KCND1Q9NSA2 LINC00905-203ENST00000588838 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KCND1Q9NSA2 CD276-202ENST00000318443 3469 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KCND1Q9NSA2 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KCND1Q9NSA2 DCAF5-209ENST00000557386 2883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KCND1Q9NSA2 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KCND1Q9NSA2 SLC5A11-203ENST00000449109 2069 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KCND1Q9NSA2 PAK3-211ENST00000518291 2098 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KCND1Q9NSA2 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KCND1Q9NSA2 PSG4-203ENST00000433626 1887 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KCND1Q9NSA2 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KCND1Q9NSA2 MYMK-201ENST00000339996 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KCND1Q9NSA2 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KCND1Q9NSA2 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms