Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCN3

TMEM8A, Post-GPI attachment to proteins factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 771 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM8AQ9HCN3 NOP58-201ENST00000264279 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM8AQ9HCN3 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM8AQ9HCN3 COL6A2-202ENST00000310645 3446 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM8AQ9HCN3 YWHAQ-201ENST00000238081 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM8AQ9HCN3 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM8AQ9HCN3 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM8AQ9HCN3 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM8AQ9HCN3 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM8AQ9HCN3 BCAR1-205ENST00000420641 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM8AQ9HCN3 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM8AQ9HCN3 ZBED1-203ENST00000381223 4510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM8AQ9HCN3 DACH1-204ENST00000620444 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM8AQ9HCN3 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM8AQ9HCN3 SUOX-201ENST00000266971 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM8AQ9HCN3 SUOX-208ENST00000548274 2352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM8AQ9HCN3 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM8AQ9HCN3 IL18BP-205ENST00000393705 1549 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM8AQ9HCN3 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM8AQ9HCN3 LINC00665-206ENST00000590622 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM8AQ9HCN3 CLTCL1-212ENST00000622493 1714 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM8AQ9HCN3 SAR1A-204ENST00000373241 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM8AQ9HCN3 ST3GAL5-203ENST00000393805 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM8AQ9HCN3 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM8AQ9HCN3 AL928654.5-201ENST00000624831 2501 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM8AQ9HCN3 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM8AQ9HCN3 MTRF1L-202ENST00000367231 3539 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM8AQ9HCN3 MRPL32-201ENST00000223324 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM8AQ9HCN3 EDF1-202ENST00000371648 809 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM8AQ9HCN3 HNRNPA1P41-201ENST00000397777 928 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM8AQ9HCN3 CRCP-204ENST00000398684 492 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM8AQ9HCN3 AC016700.1-201ENST00000429424 312 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM8AQ9HCN3 AC011742.3-201ENST00000439053 820 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM8AQ9HCN3 SEPT7P2-209ENST00000450436 601 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM8AQ9HCN3 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM8AQ9HCN3 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM8AQ9HCN3 RN7SL277P-201ENST00000481521 288 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM8AQ9HCN3 AC132803.1-201ENST00000504204 493 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM8AQ9HCN3 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM8AQ9HCN3 AC093752.3-201ENST00000567343 901 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM8AQ9HCN3 AC145207.3-201ENST00000576784 529 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM8AQ9HCN3 AL645941.3-201ENST00000580587 577 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM8AQ9HCN3 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM8AQ9HCN3 HDDC2-204ENST00000608295 879 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM8AQ9HCN3 AL022334.2-201ENST00000610000 484 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM8AQ9HCN3 ITGA9-AS1-213ENST00000614028 913 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM8AQ9HCN3 ALKBH2-208ENST00000619381 895 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM8AQ9HCN3 AL805961.1-203ENST00000641078 1258 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM8AQ9HCN3 NIT1-203ENST00000368009 1362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM8AQ9HCN3 TBC1D1-214ENST00000508802 4119 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM8AQ9HCN3 CYP4B1-202ENST00000371919 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM8AQ9HCN3 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM8AQ9HCN3 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM8AQ9HCN3 SDF2-201ENST00000247020 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM8AQ9HCN3 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM8AQ9HCN3 AC004997.1-205ENST00000447976 1851 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM8AQ9HCN3 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM8AQ9HCN3 DENND1C-202ENST00000543576 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM8AQ9HCN3 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM8AQ9HCN3 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM8AQ9HCN3 AC010327.5-201ENST00000586923 3061 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM8AQ9HCN3 SLC46A3-201ENST00000266943 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM8AQ9HCN3 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM8AQ9HCN3 GPRASP1-205ENST00000537097 5980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM8AQ9HCN3 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM8AQ9HCN3 NRAS-201ENST00000369535 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM8AQ9HCN3 SGK3-208ENST00000521198 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM8AQ9HCN3 ZNF362-201ENST00000373428 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM8AQ9HCN3 MST1-202ENST00000449682 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM8AQ9HCN3 EFHC1-227ENST00000637089 2133 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM8AQ9HCN3 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM8AQ9HCN3 STK26-204ENST00000481105 1835 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM8AQ9HCN3 ZCCHC17-204ENST00000546109 1705 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM8AQ9HCN3 FAM45A-201ENST00000361432 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM8AQ9HCN3 BTBD8-201ENST00000342818 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM8AQ9HCN3 MYL6-219ENST00000551589 1438 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM8AQ9HCN3 KIF6-201ENST00000229913 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM8AQ9HCN3 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM8AQ9HCN3 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM8AQ9HCN3 GPRC5B-209ENST00000569479 2984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM8AQ9HCN3 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM8AQ9HCN3 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM8AQ9HCN3 SMYD5-202ENST00000389501 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM8AQ9HCN3 FLOT2-210ENST00000585169 2585 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM8AQ9HCN3 CEP131-202ENST00000374782 3505 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM8AQ9HCN3 METAP2-205ENST00000546753 1862 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM8AQ9HCN3 GAK-214ENST00000511163 4280 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM8AQ9HCN3 MTG2-201ENST00000370823 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM8AQ9HCN3 CLEC12A-AS1-201ENST00000420905 3956 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM8AQ9HCN3 CORO7-222ENST00000574025 2826 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM8AQ9HCN3 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM8AQ9HCN3 MCC-202ENST00000408903 3476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM8AQ9HCN3 SSBP1-201ENST00000265304 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM8AQ9HCN3 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM8AQ9HCN3 SSR4-203ENST00000370086 643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM8AQ9HCN3 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM8AQ9HCN3 IYD-204ENST00000392255 1180 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM8AQ9HCN3 SLC16A6P1-201ENST00000413214 1059 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM8AQ9HCN3 AK2P2-201ENST00000439142 405 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM8AQ9HCN3 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM8AQ9HCN3 PABPC5-AS1-201ENST00000456187 426 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54 ms