Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY60

GABARAPL3, Gamma-aminobutyric acid receptor-associated protein-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABARAPL3Q9BY60 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
GABARAPL3Q9BY60 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
GABARAPL3Q9BY60 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
GABARAPL3Q9BY60 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
GABARAPL3Q9BY60 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
GABARAPL3Q9BY60 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
GABARAPL3Q9BY60 SNORA50.1-201ENST00000628590 135 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
GABARAPL3Q9BY60 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
GABARAPL3Q9BY60 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
GABARAPL3Q9BY60 TRIB2-201ENST00000155926 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
GABARAPL3Q9BY60 SLC45A2-201ENST00000296589 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
GABARAPL3Q9BY60 HEXA-206ENST00000566304 1795 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
GABARAPL3Q9BY60 PITX2-211ENST00000613094 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
GABARAPL3Q9BY60 PSMC1-201ENST00000261303 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
GABARAPL3Q9BY60 CDK2-201ENST00000266970 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
GABARAPL3Q9BY60 ANXA11-201ENST00000265447 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
GABARAPL3Q9BY60 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
GABARAPL3Q9BY60 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
GABARAPL3Q9BY60 NOBOX-201ENST00000467773 2076 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
GABARAPL3Q9BY60 AGAP2-203ENST00000547588 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
GABARAPL3Q9BY60 AATBC-201ENST00000400385 4598 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
GABARAPL3Q9BY60 DSEL-201ENST00000310045 9531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
GABARAPL3Q9BY60 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
GABARAPL3Q9BY60 TJAP1-204ENST00000372449 2695 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
GABARAPL3Q9BY60 ATP6V0A1-206ENST00000585525 2679 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
GABARAPL3Q9BY60 GCM2-201ENST00000379491 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
GABARAPL3Q9BY60 TMBIM1-202ENST00000396809 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
GABARAPL3Q9BY60 OSBPL3-201ENST00000313367 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
GABARAPL3Q9BY60 USP39-220ENST00000613444 2161 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
GABARAPL3Q9BY60 POU2F2-204ENST00000526816 3218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
GABARAPL3Q9BY60 ZNF395-201ENST00000344423 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
GABARAPL3Q9BY60 FUT6-205ENST00000527106 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
GABARAPL3Q9BY60 AP2M1-207ENST00000439647 1950 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
GABARAPL3Q9BY60 CMTR2-201ENST00000338099 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
GABARAPL3Q9BY60 ABCA7-203ENST00000435683 6211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
GABARAPL3Q9BY60 KLHL13-209ENST00000545703 3322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
GABARAPL3Q9BY60 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
GABARAPL3Q9BY60 LINC01271-201ENST00000441214 2250 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
GABARAPL3Q9BY60 ATAT1-206ENST00000376485 1476 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
GABARAPL3Q9BY60 LAP3P2-201ENST00000454686 1454 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
GABARAPL3Q9BY60 SGMS1-203ENST00000429490 3634 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
GABARAPL3Q9BY60 MAP7D2-201ENST00000379643 3918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
GABARAPL3Q9BY60 GRAMD4-202ENST00000406902 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
GABARAPL3Q9BY60 DAO-201ENST00000228476 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
GABARAPL3Q9BY60 LPCAT1-201ENST00000283415 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
GABARAPL3Q9BY60 SERPINB1-201ENST00000380739 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
GABARAPL3Q9BY60 SIRT2-201ENST00000249396 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
GABARAPL3Q9BY60 SIRT2-204ENST00000392081 2062 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
GABARAPL3Q9BY60 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.05□□□□□ -0.32
GABARAPL3Q9BY60 LINC00339-208ENST00000634934 1518 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
GABARAPL3Q9BY60 RRM2B-211ENST00000621845 3483 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
GABARAPL3Q9BY60 SLC25A29-208ENST00000554912 5169 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
GABARAPL3Q9BY60 TICAM1-201ENST00000248244 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
GABARAPL3Q9BY60 MYMK-201ENST00000339996 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
GABARAPL3Q9BY60 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
GABARAPL3Q9BY60 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
GABARAPL3Q9BY60 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
GABARAPL3Q9BY60 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
GABARAPL3Q9BY60 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
GABARAPL3Q9BY60 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
GABARAPL3Q9BY60 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
GABARAPL3Q9BY60 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC13.05□□□□□ -0.32
GABARAPL3Q9BY60 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
GABARAPL3Q9BY60 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
GABARAPL3Q9BY60 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
GABARAPL3Q9BY60 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
GABARAPL3Q9BY60 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
GABARAPL3Q9BY60 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
GABARAPL3Q9BY60 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC13.05□□□□□ -0.32
GABARAPL3Q9BY60 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
GABARAPL3Q9BY60 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
GABARAPL3Q9BY60 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
GABARAPL3Q9BY60 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
GABARAPL3Q9BY60 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
GABARAPL3Q9BY60 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
GABARAPL3Q9BY60 CARMIL2-202ENST00000545661 4119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
GABARAPL3Q9BY60 CYB5D2-203ENST00000575251 1588 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
GABARAPL3Q9BY60 EFHC2-202ENST00000420999 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
GABARAPL3Q9BY60 ADCY4-202ENST00000418030 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
GABARAPL3Q9BY60 NSF-201ENST00000398238 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
GABARAPL3Q9BY60 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
GABARAPL3Q9BY60 COLCA2-202ENST00000526216 1332 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
GABARAPL3Q9BY60 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
GABARAPL3Q9BY60 SMPDL3B-206ENST00000549094 1611 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
GABARAPL3Q9BY60 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
GABARAPL3Q9BY60 ANGPTL2-201ENST00000373417 2575 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
GABARAPL3Q9BY60 AC020917.4-201ENST00000623994 1999 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
GABARAPL3Q9BY60 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
GABARAPL3Q9BY60 AL031595.1-201ENST00000623969 4709 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
GABARAPL3Q9BY60 AL358781.1-202ENST00000321081 1360 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
GABARAPL3Q9BY60 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
GABARAPL3Q9BY60 SLC26A6-202ENST00000337000 2317 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
GABARAPL3Q9BY60 FAM219A-201ENST00000297620 3588 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
GABARAPL3Q9BY60 PAX8-204ENST00000397647 3633 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
GABARAPL3Q9BY60 PRKAR2A-202ENST00000296446 3318 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
GABARAPL3Q9BY60 Z97192.2-201ENST00000393264 2379 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
GABARAPL3Q9BY60 CFAP74-209ENST00000493964 5247 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
GABARAPL3Q9BY60 SUCO-201ENST00000263688 5556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
GABARAPL3Q9BY60 XRCC6-201ENST00000359308 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
GABARAPL3Q9BY60 EFHC1-221ENST00000636489 2421 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms