Protein–RNA interactions for Protein: Q96RY7

IFT140, Intraflagellar transport protein 140 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT140Q96RY7 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
IFT140Q96RY7 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
IFT140Q96RY7 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
IFT140Q96RY7 PRDX2-202ENST00000334482 784 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
IFT140Q96RY7 CRCT1-201ENST00000368790 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
IFT140Q96RY7 NAA10-205ENST00000393712 908 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
IFT140Q96RY7 FTLP3-201ENST00000427242 528 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
IFT140Q96RY7 AKR1C6P-201ENST00000432950 983 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
IFT140Q96RY7 IDI2-AS1-204ENST00000437374 896 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
IFT140Q96RY7 POU5F1-202ENST00000441888 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
IFT140Q96RY7 MIR3940-201ENST00000579148 102 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
IFT140Q96RY7 SMIM22-207ENST00000589721 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
IFT140Q96RY7 PCP2-202ENST00000598935 457 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
IFT140Q96RY7 FAM69A-204ENST00000615519 865 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
IFT140Q96RY7 AC099552.4-201ENST00000624248 949 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
IFT140Q96RY7 PIN4-203ENST00000373669 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
IFT140Q96RY7 AC008038.1-201ENST00000634247 1314 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
IFT140Q96RY7 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
IFT140Q96RY7 CASP8-202ENST00000264275 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
IFT140Q96RY7 VRK3-201ENST00000316763 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
IFT140Q96RY7 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
IFT140Q96RY7 LINC01137-201ENST00000424989 1395 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
IFT140Q96RY7 AC245140.2-201ENST00000624054 1939 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
IFT140Q96RY7 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
IFT140Q96RY7 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
IFT140Q96RY7 APEX1-201ENST00000216714 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
IFT140Q96RY7 LIMS4-204ENST00000632897 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
IFT140Q96RY7 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
IFT140Q96RY7 PLAT-211ENST00000524009 1613 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
IFT140Q96RY7 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
IFT140Q96RY7 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
IFT140Q96RY7 STRADA-243ENST00000640086 1925 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
IFT140Q96RY7 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
IFT140Q96RY7 SLC2A11-208ENST00000405847 730 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
IFT140Q96RY7 LINC00484-201ENST00000414768 561 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
IFT140Q96RY7 CLK2P1-201ENST00000416636 1294 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
IFT140Q96RY7 AC000078.1-201ENST00000420617 682 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
IFT140Q96RY7 AC069257.3-201ENST00000431391 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
IFT140Q96RY7 PTPA-219ENST00000435305 530 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
IFT140Q96RY7 AC006001.2-202ENST00000439360 508 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
IFT140Q96RY7 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
IFT140Q96RY7 RAB6B-205ENST00000486858 880 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
IFT140Q96RY7 RN7SL477P-201ENST00000488440 286 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
IFT140Q96RY7 H1FOO-202ENST00000503977 881 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
IFT140Q96RY7 BMS1P8-203ENST00000567036 614 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
IFT140Q96RY7 AL390726.3-201ENST00000567428 635 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
IFT140Q96RY7 MIEF2-206ENST00000578174 589 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
IFT140Q96RY7 NSRP1-213ENST00000584423 482 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
IFT140Q96RY7 AC005609.1-201ENST00000625195 617 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
IFT140Q96RY7 LINC01002-223ENST00000633179 407 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
IFT140Q96RY7 PAX6-247ENST00000638965 979 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
IFT140Q96RY7 AC099795.2-201ENST00000639582 440 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
IFT140Q96RY7 RAB8A-202ENST00000586682 1315 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
IFT140Q96RY7 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
IFT140Q96RY7 RBFOX1-214ENST00000552089 1430 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
IFT140Q96RY7 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
IFT140Q96RY7 SDF2-201ENST00000247020 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
IFT140Q96RY7 SLC25A3-202ENST00000228318 1678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
IFT140Q96RY7 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
IFT140Q96RY7 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
IFT140Q96RY7 MIR100HG-219ENST00000533109 1794 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
IFT140Q96RY7 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
IFT140Q96RY7 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
IFT140Q96RY7 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
IFT140Q96RY7 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
IFT140Q96RY7 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
IFT140Q96RY7 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
IFT140Q96RY7 LYG2-201ENST00000333017 862 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
IFT140Q96RY7 LCE4A-201ENST00000335535 388 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
IFT140Q96RY7 ASPDH-201ENST00000376916 848 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
IFT140Q96RY7 BTF3-202ENST00000380591 1237 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
IFT140Q96RY7 RN7SL789P-201ENST00000478944 293 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
IFT140Q96RY7 HNRNPA1P4-201ENST00000509706 756 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
IFT140Q96RY7 AC009119.3-202ENST00000566773 196 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
IFT140Q96RY7 AC100778.4-201ENST00000581232 582 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
IFT140Q96RY7 AC068675.1-201ENST00000588996 561 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
IFT140Q96RY7 AC093495.1-215ENST00000626655 821 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
IFT140Q96RY7 DEGS1-202ENST00000391877 1345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
IFT140Q96RY7 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
IFT140Q96RY7 SNX19-213ENST00000534726 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
IFT140Q96RY7 TUBD1-202ENST00000340993 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
IFT140Q96RY7 LINC01002-209ENST00000631858 1761 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
IFT140Q96RY7 ATP1B3-201ENST00000286371 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
IFT140Q96RY7 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
IFT140Q96RY7 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
IFT140Q96RY7 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
IFT140Q96RY7 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
IFT140Q96RY7 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
IFT140Q96RY7 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
IFT140Q96RY7 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
IFT140Q96RY7 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
IFT140Q96RY7 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
IFT140Q96RY7 PRC1-204ENST00000442656 2060 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
IFT140Q96RY7 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
IFT140Q96RY7 ADK-205ENST00000539909 1866 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
IFT140Q96RY7 RUSC1-AS1-202ENST00000446880 1836 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
IFT140Q96RY7 HSPA8-221ENST00000533540 1826 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
IFT140Q96RY7 TUBB8P4-201ENST00000511806 1324 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
IFT140Q96RY7 CAV2-202ENST00000343213 776 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
IFT140Q96RY7 POLR3DP1-201ENST00000398689 1176 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.9 ms