Protein–RNA interactions for Protein: Q587J7

TDRD12, Putative ATP-dependent RNA helicase TDRD12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD12Q587J7 ABAT-215ENST00000569156 1911 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TDRD12Q587J7 PASK-204ENST00000405260 4942 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TDRD12Q587J7 MYD88-201ENST00000396334 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TDRD12Q587J7 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
TDRD12Q587J7 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TDRD12Q587J7 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
TDRD12Q587J7 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TDRD12Q587J7 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
TDRD12Q587J7 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TDRD12Q587J7 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TDRD12Q587J7 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TDRD12Q587J7 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TDRD12Q587J7 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TDRD12Q587J7 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TDRD12Q587J7 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TDRD12Q587J7 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TDRD12Q587J7 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TDRD12Q587J7 THAP2-201ENST00000308086 5719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TDRD12Q587J7 KCNV1-201ENST00000297404 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TDRD12Q587J7 YWHAQ-201ENST00000238081 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TDRD12Q587J7 SLC22A20-202ENST00000525437 3196 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TDRD12Q587J7 ARAP1-202ENST00000359373 5767 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TDRD12Q587J7 LINC01671-201ENST00000419628 1775 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TDRD12Q587J7 SLC6A2-205ENST00000566163 1759 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TDRD12Q587J7 SLC46A1-208ENST00000618626 5363 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TDRD12Q587J7 TRIM10-204ENST00000449742 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TDRD12Q587J7 IL13RA1-202ENST00000371666 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TDRD12Q587J7 RIPOR3-202ENST00000327979 4377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TDRD12Q587J7 DLGAP4-202ENST00000340491 2392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TDRD12Q587J7 GRHL1-202ENST00000405379 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TDRD12Q587J7 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TDRD12Q587J7 EDEM3-202ENST00000367512 6678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TDRD12Q587J7 NHLH2-202ENST00000369506 7226 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TDRD12Q587J7 SCARF1-201ENST00000263071 3443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TDRD12Q587J7 NCBP2-204ENST00000427641 1946 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TDRD12Q587J7 FBXO34-201ENST00000313833 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TDRD12Q587J7 ATP2B2-210ENST00000638646 3465 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TDRD12Q587J7 ZFYVE28-211ENST00000515312 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TDRD12Q587J7 STK3-218ENST00000617590 2485 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TDRD12Q587J7 NUTM2A-202ENST00000381707 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TDRD12Q587J7 NUTM2B-203ENST00000429828 3292 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TDRD12Q587J7 RREB1-210ENST00000611109 3563 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TDRD12Q587J7 PAIP2-202ENST00000394795 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TDRD12Q587J7 PP14571-202ENST00000404891 2017 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TDRD12Q587J7 DIS3L2-205ENST00000409401 2048 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TDRD12Q587J7 PRIMPOL-211ENST00000515774 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TDRD12Q587J7 UBE2D3-210ENST00000453744 3990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TDRD12Q587J7 ARMCX3-203ENST00000471229 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TDRD12Q587J7 MAP7D3-201ENST00000316077 4567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TDRD12Q587J7 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TDRD12Q587J7 NXPH1-201ENST00000405863 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TDRD12Q587J7 SMAGP-203ENST00000603798 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TDRD12Q587J7 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TDRD12Q587J7 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TDRD12Q587J7 C11orf21-201ENST00000381153 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TDRD12Q587J7 KSR1-204ENST00000398988 7237 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TDRD12Q587J7 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TDRD12Q587J7 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TDRD12Q587J7 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TDRD12Q587J7 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TDRD12Q587J7 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TDRD12Q587J7 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TDRD12Q587J7 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TDRD12Q587J7 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TDRD12Q587J7 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TDRD12Q587J7 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TDRD12Q587J7 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TDRD12Q587J7 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TDRD12Q587J7 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TDRD12Q587J7 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TDRD12Q587J7 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TDRD12Q587J7 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TDRD12Q587J7 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TDRD12Q587J7 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TDRD12Q587J7 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TDRD12Q587J7 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TDRD12Q587J7 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TDRD12Q587J7 STK26-202ENST00000394334 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TDRD12Q587J7 MIER1-202ENST00000355977 3595 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TDRD12Q587J7 UBXN11-202ENST00000357089 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TDRD12Q587J7 TMX4-201ENST00000246024 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TDRD12Q587J7 MBTD1-204ENST00000586178 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TDRD12Q587J7 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TDRD12Q587J7 PRSS16-203ENST00000421826 1949 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TDRD12Q587J7 SCD5-202ENST00000319540 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TDRD12Q587J7 CDHR5-203ENST00000397542 3489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TDRD12Q587J7 ZBTB11-201ENST00000312938 6020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TDRD12Q587J7 AL662899.1-201ENST00000461287 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TDRD12Q587J7 RTFDC1-201ENST00000023939 1745 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TDRD12Q587J7 RFESD-201ENST00000311364 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TDRD12Q587J7 KLHL8-201ENST00000273963 5621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TDRD12Q587J7 ABCB8-202ENST00000358849 4683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TDRD12Q587J7 AP000347.1-201ENST00000417194 5004 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TDRD12Q587J7 DDO-202ENST00000368924 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TDRD12Q587J7 ATG9A-201ENST00000361242 3130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TDRD12Q587J7 IL1RN-201ENST00000259206 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TDRD12Q587J7 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TDRD12Q587J7 ALAD-201ENST00000409155 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TDRD12Q587J7 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TDRD12Q587J7 AXL-202ENST00000359092 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.7 ms