Protein–RNA interactions for Protein: Q1MSJ5

CSPP1, Centrosome and spindle pole-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPP1Q1MSJ5 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
CSPP1Q1MSJ5 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
CSPP1Q1MSJ5 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CSPP1Q1MSJ5 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CSPP1Q1MSJ5 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CSPP1Q1MSJ5 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CSPP1Q1MSJ5 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CSPP1Q1MSJ5 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CSPP1Q1MSJ5 AC124312.2-201ENST00000546615 427 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CSPP1Q1MSJ5 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CSPP1Q1MSJ5 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CSPP1Q1MSJ5 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CSPP1Q1MSJ5 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CSPP1Q1MSJ5 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CSPP1Q1MSJ5 SELENON-201ENST00000354177 4227 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CSPP1Q1MSJ5 PHTF2-206ENST00000422959 3525 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CSPP1Q1MSJ5 HFE-202ENST00000317896 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CSPP1Q1MSJ5 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CSPP1Q1MSJ5 SPRY1-208ENST00000622283 2352 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CSPP1Q1MSJ5 MANBA-202ENST00000505239 2577 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CSPP1Q1MSJ5 NOX5-201ENST00000260364 8592 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CSPP1Q1MSJ5 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CSPP1Q1MSJ5 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CSPP1Q1MSJ5 FAM200B-201ENST00000422728 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CSPP1Q1MSJ5 AC026790.1-201ENST00000399760 2941 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CSPP1Q1MSJ5 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CSPP1Q1MSJ5 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CSPP1Q1MSJ5 GPR84-202ENST00000551809 2041 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CSPP1Q1MSJ5 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
CSPP1Q1MSJ5 ATG3-202ENST00000402314 3010 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CSPP1Q1MSJ5 MAGI3-202ENST00000369611 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CSPP1Q1MSJ5 NXPH3-202ENST00000513748 1530 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CSPP1Q1MSJ5 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
CSPP1Q1MSJ5 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CSPP1Q1MSJ5 SMAD2-212ENST00000591214 1714 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CSPP1Q1MSJ5 CR382287.2-201ENST00000623370 1942 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CSPP1Q1MSJ5 BAK1-202ENST00000374467 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CSPP1Q1MSJ5 C19orf66-202ENST00000397881 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CSPP1Q1MSJ5 SIRT5-203ENST00000379262 2339 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CSPP1Q1MSJ5 ANKRD42-201ENST00000260047 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CSPP1Q1MSJ5 ATG9A-201ENST00000361242 3130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CSPP1Q1MSJ5 ESPN-201ENST00000377828 3531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CSPP1Q1MSJ5 PPP4R3B-205ENST00000616288 4310 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CSPP1Q1MSJ5 TBL3-208ENST00000615855 2472 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CSPP1Q1MSJ5 PGAP2-201ENST00000278243 2062 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CSPP1Q1MSJ5 ACTL7A-201ENST00000333999 1494 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CSPP1Q1MSJ5 USP51-201ENST00000500968 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CSPP1Q1MSJ5 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CSPP1Q1MSJ5 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CSPP1Q1MSJ5 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
CSPP1Q1MSJ5 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CSPP1Q1MSJ5 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CSPP1Q1MSJ5 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
CSPP1Q1MSJ5 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CSPP1Q1MSJ5 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
CSPP1Q1MSJ5 FOS-206ENST00000555347 1280 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CSPP1Q1MSJ5 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CSPP1Q1MSJ5 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
CSPP1Q1MSJ5 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CSPP1Q1MSJ5 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CSPP1Q1MSJ5 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CSPP1Q1MSJ5 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
CSPP1Q1MSJ5 HIST2H2AA4-201ENST00000607355 564 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CSPP1Q1MSJ5 NDRG4-221ENST00000563799 3014 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CSPP1Q1MSJ5 AC114271.1-201ENST00000612689 2813 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
CSPP1Q1MSJ5 AC020658.7-201ENST00000624274 2442 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
CSPP1Q1MSJ5 MAP3K3-203ENST00000577395 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CSPP1Q1MSJ5 SGTB-201ENST00000381007 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CSPP1Q1MSJ5 FOXF1-201ENST00000262426 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CSPP1Q1MSJ5 ALDH1A3-202ENST00000346623 3104 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CSPP1Q1MSJ5 SOAT1-204ENST00000540564 6861 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CSPP1Q1MSJ5 SLC29A4-203ENST00000406453 2734 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CSPP1Q1MSJ5 AC020915.4-201ENST00000597230 2708 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CSPP1Q1MSJ5 SLC35E2B-205ENST00000617444 6283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CSPP1Q1MSJ5 STK26-202ENST00000394334 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CSPP1Q1MSJ5 PPP1R3D-201ENST00000370996 3630 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CSPP1Q1MSJ5 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CSPP1Q1MSJ5 ZNF34-201ENST00000343459 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CSPP1Q1MSJ5 ZNF34-202ENST00000429371 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CSPP1Q1MSJ5 NUMB-216ENST00000555394 3037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CSPP1Q1MSJ5 PATL2-207ENST00000560775 1913 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CSPP1Q1MSJ5 ARHGEF33-202ENST00000409978 4484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CSPP1Q1MSJ5 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CSPP1Q1MSJ5 L3MBTL1-206ENST00000427442 3157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CSPP1Q1MSJ5 NR4A2-209ENST00000426264 2642 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CSPP1Q1MSJ5 CDIP1-205ENST00000563332 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CSPP1Q1MSJ5 ANKRD36BP2-202ENST00000421951 1899 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CSPP1Q1MSJ5 AC019294.4-201ENST00000561777 2905 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CSPP1Q1MSJ5 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CSPP1Q1MSJ5 AMT-221ENST00000538581 2038 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CSPP1Q1MSJ5 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CSPP1Q1MSJ5 MX1-202ENST00000398598 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CSPP1Q1MSJ5 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CSPP1Q1MSJ5 LINC00299-202ENST00000442956 2342 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CSPP1Q1MSJ5 TSEN2-202ENST00000402228 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CSPP1Q1MSJ5 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CSPP1Q1MSJ5 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CSPP1Q1MSJ5 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CSPP1Q1MSJ5 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CSPP1Q1MSJ5 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
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