Protein–RNA interactions for Protein: Q17R60

IMPG1, Interphotoreceptor matrix proteoglycan 1, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMPG1Q17R60 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
IMPG1Q17R60 C15orf39-202ENST00000394987 4430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
IMPG1Q17R60 PUF60-209ENST00000527197 1559 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
IMPG1Q17R60 ABCA17P-202ENST00000469908 4188 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
IMPG1Q17R60 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
IMPG1Q17R60 MKRN2-201ENST00000170447 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
IMPG1Q17R60 ARHGEF1-201ENST00000337665 3171 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
IMPG1Q17R60 MYD88-201ENST00000396334 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
IMPG1Q17R60 USP19-208ENST00000453664 4719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
IMPG1Q17R60 SLC44A1-202ENST00000374723 9640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
IMPG1Q17R60 PCMTD2-204ENST00000369758 3212 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
IMPG1Q17R60 PRKAB1-201ENST00000229328 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
IMPG1Q17R60 TP53I11-222ENST00000616990 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
IMPG1Q17R60 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
IMPG1Q17R60 PPP1R3D-201ENST00000370996 3630 ntAPPRIS P1 BASIC14.07□□□□□ -0.16
IMPG1Q17R60 ANKMY1-208ENST00000405002 3304 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
IMPG1Q17R60 PARP3-203ENST00000431474 2360 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
IMPG1Q17R60 RGS8-204ENST00000483095 1432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
IMPG1Q17R60 PWWP2A-202ENST00000456329 3991 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
IMPG1Q17R60 LINC00882-204ENST00000484698 2718 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
IMPG1Q17R60 HSP90AA1-201ENST00000216281 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
IMPG1Q17R60 SUV39H2-201ENST00000313519 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
IMPG1Q17R60 SRGAP3-201ENST00000360413 8415 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
IMPG1Q17R60 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
IMPG1Q17R60 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
IMPG1Q17R60 AC082651.4-201ENST00000483023 1852 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
IMPG1Q17R60 AHI1-201ENST00000265602 4335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
IMPG1Q17R60 EIF4G1-207ENST00000411531 4683 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
IMPG1Q17R60 MARVELD2-203ENST00000436532 1563 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
IMPG1Q17R60 LDB3-209ENST00000623056 2314 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
IMPG1Q17R60 VDAC1-201ENST00000265333 1953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
IMPG1Q17R60 EPS8L3-202ENST00000361965 1971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
IMPG1Q17R60 FXR1-214ENST00000480918 1996 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
IMPG1Q17R60 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
IMPG1Q17R60 SCAMP5-202ENST00000425597 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
IMPG1Q17R60 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
IMPG1Q17R60 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
IMPG1Q17R60 ACSM2A-202ENST00000396104 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
IMPG1Q17R60 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
IMPG1Q17R60 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
IMPG1Q17R60 SLC6A10P-201ENST00000330048 3846 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
IMPG1Q17R60 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
IMPG1Q17R60 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
IMPG1Q17R60 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
IMPG1Q17R60 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
IMPG1Q17R60 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC14.06□□□□□ -0.16
IMPG1Q17R60 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
IMPG1Q17R60 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
IMPG1Q17R60 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
IMPG1Q17R60 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
IMPG1Q17R60 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
IMPG1Q17R60 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
IMPG1Q17R60 MCRIP1-207ENST00000574190 2775 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
IMPG1Q17R60 L3MBTL1-206ENST00000427442 3157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
IMPG1Q17R60 MAN2B1-203ENST00000456935 3184 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
IMPG1Q17R60 AC111170.3-201ENST00000624282 2464 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
IMPG1Q17R60 FAM193A-201ENST00000324666 4846 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
IMPG1Q17R60 PPP6R2-203ENST00000395741 3304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
IMPG1Q17R60 FRMD8-201ENST00000317568 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
IMPG1Q17R60 GRIN1-202ENST00000371546 4114 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
IMPG1Q17R60 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
IMPG1Q17R60 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
IMPG1Q17R60 MAGEA4-202ENST00000360243 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
IMPG1Q17R60 MAGEA4-203ENST00000370335 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
IMPG1Q17R60 MAGEA4-204ENST00000370340 1773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
IMPG1Q17R60 IL20RA-207ENST00000541547 3382 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
IMPG1Q17R60 ASXL1-201ENST00000306058 6591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
IMPG1Q17R60 CES3-201ENST00000303334 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
IMPG1Q17R60 CNTN1-203ENST00000547702 3033 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
IMPG1Q17R60 SLC1A7-202ENST00000371494 2637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
IMPG1Q17R60 PCCB-215ENST00000482086 1436 ntTSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
IMPG1Q17R60 RMDN1-201ENST00000406452 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
IMPG1Q17R60 SNED1-205ENST00000405547 7986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
IMPG1Q17R60 SCN8A-202ENST00000355133 5820 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
IMPG1Q17R60 CAMKV-202ENST00000463537 2818 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
IMPG1Q17R60 TXLNA-201ENST00000373609 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
IMPG1Q17R60 SETD1B-202ENST00000542440 8185 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
IMPG1Q17R60 MFSD2B-201ENST00000338315 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
IMPG1Q17R60 PRR30-201ENST00000335524 2008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
IMPG1Q17R60 PLPPR1-201ENST00000374874 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
IMPG1Q17R60 PKD1P6-NPIPP1-202ENST00000605794 2902 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
IMPG1Q17R60 SPOCK2-201ENST00000317376 5328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
IMPG1Q17R60 GPR61-204ENST00000527748 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
IMPG1Q17R60 AC012184.2-203ENST00000443119 2110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
IMPG1Q17R60 CEMIP-203ENST00000394685 7357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
IMPG1Q17R60 NLRP2B-201ENST00000434992 3194 ntAPPRIS P1 BASIC14.05□□□□□ -0.16
IMPG1Q17R60 GMEB2-203ENST00000370077 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
IMPG1Q17R60 AL157996.1-201ENST00000624684 2299 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
IMPG1Q17R60 FBXL7-203ENST00000510662 1758 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
IMPG1Q17R60 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
IMPG1Q17R60 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
IMPG1Q17R60 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
IMPG1Q17R60 SYNGR1-204ENST00000381535 1295 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
IMPG1Q17R60 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
IMPG1Q17R60 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
IMPG1Q17R60 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
IMPG1Q17R60 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
IMPG1Q17R60 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
IMPG1Q17R60 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
IMPG1Q17R60 ANO1-AS2-202ENST00000533327 498 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
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