Protein–RNA interactions for Protein: Q13670

PMS2P11, Putative postmeiotic segregation increased 2-like protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P11Q13670 CALCOCO1-218ENST00000550804 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PMS2P11Q13670 CXCR5-201ENST00000292174 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PMS2P11Q13670 CNTLN-201ENST00000380641 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
PMS2P11Q13670 ZNF34-201ENST00000343459 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PMS2P11Q13670 ZNF34-202ENST00000429371 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PMS2P11Q13670 TRIM80P-201ENST00000455685 2848 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
PMS2P11Q13670 NTRK2-203ENST00000323115 3708 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PMS2P11Q13670 C7orf72-201ENST00000297001 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
PMS2P11Q13670 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PMS2P11Q13670 GFAP-214ENST00000588735 6538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PMS2P11Q13670 ADRA2B-201ENST00000620793 3371 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
PMS2P11Q13670 NLGN3-201ENST00000358741 3046 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
PMS2P11Q13670 GOLGA8IP-202ENST00000611635 2100 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
PMS2P11Q13670 CPLX2-201ENST00000359546 5023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PMS2P11Q13670 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
PMS2P11Q13670 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
PMS2P11Q13670 AP001999.1-201ENST00000513405 3684 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
PMS2P11Q13670 TBX3-201ENST00000257566 4208 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PMS2P11Q13670 TNK2-208ENST00000428187 4235 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PMS2P11Q13670 SPTBN2-210ENST00000611817 2890 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
PMS2P11Q13670 DEK-202ENST00000397239 3427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PMS2P11Q13670 RIN3-212ENST00000620541 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
PMS2P11Q13670 MRPL17-201ENST00000288937 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PMS2P11Q13670 NINL-203ENST00000422516 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
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PMS2P11Q13670 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PMS2P11Q13670 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
PMS2P11Q13670 ZBTB20-206ENST00000464560 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PMS2P11Q13670 KRT33B-201ENST00000251646 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PMS2P11Q13670 ZBTB11-201ENST00000312938 6020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PMS2P11Q13670 PRICKLE3-204ENST00000453382 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
PMS2P11Q13670 PPP3CA-202ENST00000394853 3604 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PMS2P11Q13670 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
PMS2P11Q13670 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PMS2P11Q13670 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
PMS2P11Q13670 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
PMS2P11Q13670 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
PMS2P11Q13670 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
PMS2P11Q13670 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
PMS2P11Q13670 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
PMS2P11Q13670 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
PMS2P11Q13670 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
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PMS2P11Q13670 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC11.61□□□□□ -0.55
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PMS2P11Q13670 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
PMS2P11Q13670 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
PMS2P11Q13670 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
PMS2P11Q13670 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
PMS2P11Q13670 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PMS2P11Q13670 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC11.61□□□□□ -0.55
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PMS2P11Q13670 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
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PMS2P11Q13670 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
PMS2P11Q13670 LINC00384-201ENST00000437721 6852 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
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PMS2P11Q13670 DLGAP1-206ENST00000400155 5257 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
PMS2P11Q13670 ZC2HC1A-201ENST00000263849 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
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PMS2P11Q13670 ALOX15B-202ENST00000380183 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
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PMS2P11Q13670 TMEM173-201ENST00000330794 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PMS2P11Q13670 ACTN1-204ENST00000438964 3043 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
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PMS2P11Q13670 AMER1-202ENST00000374869 3688 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
PMS2P11Q13670 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
PMS2P11Q13670 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
PMS2P11Q13670 NXPH3-202ENST00000513748 1530 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PMS2P11Q13670 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
PMS2P11Q13670 ENO2-214ENST00000545045 1911 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
PMS2P11Q13670 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
PMS2P11Q13670 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PMS2P11Q13670 FTO-214ENST00000636218 2227 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
PMS2P11Q13670 LDHAL6A-201ENST00000280706 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
PMS2P11Q13670 MDM1-201ENST00000303145 2918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PMS2P11Q13670 LCA5-202ENST00000392959 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PMS2P11Q13670 KRT74-203ENST00000549343 2858 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
PMS2P11Q13670 CALD1-205ENST00000422748 2665 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
PMS2P11Q13670 NR4A1-202ENST00000360284 2589 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
PMS2P11Q13670 KLHL7-202ENST00000339077 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PMS2P11Q13670 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PMS2P11Q13670 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PMS2P11Q13670 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PMS2P11Q13670 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PMS2P11Q13670 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PMS2P11Q13670 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PMS2P11Q13670 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
PMS2P11Q13670 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
PMS2P11Q13670 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
PMS2P11Q13670 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
PMS2P11Q13670 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PMS2P11Q13670 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
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