Protein–RNA interactions for Protein: P61218

POLR2F, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2FP61218 SLC46A3-201ENST00000266943 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
POLR2FP61218 ALAS2-202ENST00000335854 1795 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
POLR2FP61218 CHEK2-201ENST00000328354 1867 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
POLR2FP61218 BCAN-201ENST00000329117 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
POLR2FP61218 IL12RB1-203ENST00000593993 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
POLR2FP61218 CLOCK-211ENST00000513440 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
POLR2FP61218 NYNRIN-201ENST00000382554 7857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
POLR2FP61218 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
POLR2FP61218 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
POLR2FP61218 FAM200B-201ENST00000422728 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
POLR2FP61218 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
POLR2FP61218 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
POLR2FP61218 KLF2P1-201ENST00000447438 1042 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
POLR2FP61218 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
POLR2FP61218 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
POLR2FP61218 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
POLR2FP61218 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
POLR2FP61218 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
POLR2FP61218 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
POLR2FP61218 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
POLR2FP61218 HNRNPH1-203ENST00000393432 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
POLR2FP61218 KIAA0895-203ENST00000338533 4132 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
POLR2FP61218 SUOX-202ENST00000356124 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
POLR2FP61218 AL662899.1-201ENST00000461287 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
POLR2FP61218 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
POLR2FP61218 LAP3P2-201ENST00000454686 1454 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
POLR2FP61218 TCOF1-207ENST00000504761 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
POLR2FP61218 ZNF747-202ENST00000395094 3504 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
POLR2FP61218 DNAJB6-201ENST00000262177 2527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
POLR2FP61218 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
POLR2FP61218 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
POLR2FP61218 KIAA0895L-201ENST00000290881 3550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
POLR2FP61218 ABI2-215ENST00000430418 1676 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
POLR2FP61218 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
POLR2FP61218 TRPV6-201ENST00000359396 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
POLR2FP61218 SNAP29-201ENST00000215730 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
POLR2FP61218 C7orf57-204ENST00000435376 1925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
POLR2FP61218 C7orf57-206ENST00000539619 1927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
POLR2FP61218 KDR-201ENST00000263923 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
POLR2FP61218 NCLP1-201ENST00000445357 1963 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
POLR2FP61218 ST6GAL1-201ENST00000169298 4645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
POLR2FP61218 ZNF618-201ENST00000288466 9109 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
POLR2FP61218 C19orf66-202ENST00000397881 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
POLR2FP61218 OTOF-202ENST00000338581 4954 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
POLR2FP61218 GNAI2-201ENST00000266027 2169 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
POLR2FP61218 STX18-AS1-207ENST00000610009 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
POLR2FP61218 UBA1-202ENST00000377269 2497 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
POLR2FP61218 ALOX15B-201ENST00000380173 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
POLR2FP61218 TRAF1-201ENST00000373887 6324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
POLR2FP61218 MCRIP1-207ENST00000574190 2775 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
POLR2FP61218 PGBD2-202ENST00000355360 2879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
POLR2FP61218 GPR68-204ENST00000535815 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
POLR2FP61218 LINC01750-202ENST00000438293 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
POLR2FP61218 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
POLR2FP61218 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
POLR2FP61218 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
POLR2FP61218 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
POLR2FP61218 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
POLR2FP61218 AC012507.1-201ENST00000454890 600 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
POLR2FP61218 NDRG1-209ENST00000518176 888 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
POLR2FP61218 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
POLR2FP61218 MSRB3-206ENST00000535664 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
POLR2FP61218 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
POLR2FP61218 AC021016.3-201ENST00000608367 477 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
POLR2FP61218 KIAA0319-204ENST00000537886 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
POLR2FP61218 LIMS4-204ENST00000632897 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
POLR2FP61218 AKNA-204ENST00000374075 5038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
POLR2FP61218 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
POLR2FP61218 OR2A25-202ENST00000641441 1733 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
POLR2FP61218 FXYD6-207ENST00000527717 1799 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
POLR2FP61218 LDB3-207ENST00000542786 1889 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
POLR2FP61218 GTF3C2-214ENST00000622534 1858 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
POLR2FP61218 AC079447.1-201ENST00000424491 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
POLR2FP61218 MBNL1-205ENST00000355460 5941 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
POLR2FP61218 GOLGA8EP-201ENST00000530246 1959 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
POLR2FP61218 PP14571-202ENST00000404891 2017 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
POLR2FP61218 AL137784.3-201ENST00000623858 2288 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
POLR2FP61218 REC8-213ENST00000620473 2405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
POLR2FP61218 RNF145-202ENST00000424310 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
POLR2FP61218 CES3-201ENST00000303334 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
POLR2FP61218 CES3-202ENST00000394037 3817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
POLR2FP61218 SUCO-201ENST00000263688 5556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
POLR2FP61218 CTBP1-AS2-206ENST00000581398 5652 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
POLR2FP61218 FMNL3-205ENST00000550488 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
POLR2FP61218 RLIM-202ENST00000349225 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
POLR2FP61218 S100PBP-203ENST00000373476 3320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
POLR2FP61218 LINC00863-201ENST00000439559 3287 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
POLR2FP61218 SEMA7A-202ENST00000542748 3228 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
POLR2FP61218 PPP3R1-201ENST00000234310 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
POLR2FP61218 TNK1-207ENST00000576812 3023 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
POLR2FP61218 CRACR2A-203ENST00000440314 2697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
POLR2FP61218 ZNF174-201ENST00000268655 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
POLR2FP61218 LMAN2L-202ENST00000377079 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
POLR2FP61218 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
POLR2FP61218 LGALS12-204ENST00000415491 1816 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
POLR2FP61218 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
POLR2FP61218 PPP1R1B-203ENST00000394267 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
POLR2FP61218 ZSCAN5A-206ENST00000587492 1542 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
POLR2FP61218 EPHB3-201ENST00000330394 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
POLR2FP61218 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.8 ms