Protein–RNA interactions for Protein: P56915

GSC, Homeobox protein goosecoid, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSCP56915 SCFD1-203ENST00000458591 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GSCP56915 ZNF829-201ENST00000391711 1805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GSCP56915 FLOT2-210ENST00000585169 2585 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GSCP56915 SLC6A9-203ENST00000372306 1926 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GSCP56915 TDRD5-201ENST00000294848 3525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GSCP56915 OFD1-201ENST00000340096 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GSCP56915 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GSCP56915 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GSCP56915 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GSCP56915 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GSCP56915 KRTAP10-3-201ENST00000391620 971 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GSCP56915 CD300A-204ENST00000392625 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GSCP56915 POM121L10P-201ENST00000436994 1285 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
GSCP56915 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GSCP56915 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GSCP56915 PRSS30P-205ENST00000506153 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GSCP56915 PGAM1P5-201ENST00000548011 764 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
GSCP56915 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GSCP56915 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GSCP56915 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GSCP56915 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GSCP56915 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GSCP56915 ALKBH7-202ENST00000596657 603 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GSCP56915 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GSCP56915 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GSCP56915 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GSCP56915 AC004706.3-207ENST00000634823 977 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GSCP56915 POU2F2-216ENST00000560558 3282 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GSCP56915 SERPING1-204ENST00000378324 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GSCP56915 LIG1-202ENST00000427526 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GSCP56915 SGCE-202ENST00000415788 1871 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GSCP56915 MTSS1-216ENST00000524090 2166 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GSCP56915 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GSCP56915 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GSCP56915 TMEM130-203ENST00000416379 2881 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GSCP56915 RARG-203ENST00000425354 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GSCP56915 RAB6C-201ENST00000410061 3075 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GSCP56915 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GSCP56915 RASSF3-204ENST00000542104 3492 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GSCP56915 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GSCP56915 CTSW-204ENST00000528419 1341 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GSCP56915 SH3GLB2-205ENST00000416629 1415 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GSCP56915 GRAMD4-202ENST00000406902 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GSCP56915 HMOX2-216ENST00000613539 1703 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GSCP56915 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GSCP56915 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GSCP56915 CCT3-204ENST00000368259 1815 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GSCP56915 THUMPD3-AS1-212ENST00000520447 1809 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GSCP56915 ASB3-201ENST00000263634 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GSCP56915 SLC4A7-213ENST00000454389 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GSCP56915 LRRC8D-201ENST00000337338 3950 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GSCP56915 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GSCP56915 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GSCP56915 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GSCP56915 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GSCP56915 RAB11FIP1-206ENST00000524118 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GSCP56915 SNX19-213ENST00000534726 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GSCP56915 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GSCP56915 AL024498.2-201ENST00000480294 1589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GSCP56915 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GSCP56915 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GSCP56915 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
GSCP56915 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GSCP56915 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
GSCP56915 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
GSCP56915 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GSCP56915 FADS2-212ENST00000522639 360 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GSCP56915 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GSCP56915 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GSCP56915 AL132709.1-203ENST00000555103 569 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GSCP56915 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GSCP56915 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GSCP56915 GFER-204ENST00000567719 483 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GSCP56915 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GSCP56915 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GSCP56915 AC099684.2-201ENST00000574520 870 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GSCP56915 FADS2-215ENST00000574708 385 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GSCP56915 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GSCP56915 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
GSCP56915 AL591471.1-201ENST00000621855 229 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
GSCP56915 PCBP2-OT1-201ENST00000634357 590 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
GSCP56915 TMPRSS6-203ENST00000406725 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GSCP56915 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GSCP56915 PNKD-203ENST00000273077 3021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GSCP56915 HJURP-207ENST00000441687 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GSCP56915 IGHG1-202ENST00000390548 2619 ntAPPRIS P5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GSCP56915 ZFP82-201ENST00000392161 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GSCP56915 SIRT5-203ENST00000379262 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GSCP56915 TRHDE-AS1-201ENST00000426250 3684 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GSCP56915 CR382287.2-201ENST00000623370 1942 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GSCP56915 PPP4R3B-205ENST00000616288 4310 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GSCP56915 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GSCP56915 PCBP2-215ENST00000549863 1619 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GSCP56915 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GSCP56915 ZSCAN5A-206ENST00000587492 1542 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GSCP56915 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GSCP56915 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GSCP56915 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GSCP56915 GIT1-211ENST00000581348 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GSCP56915 COASY-211ENST00000590958 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.3 ms