Protein–RNA interactions for Protein: P56704

WNT3A, Protein Wnt-3a, humanhuman

Predictions only

Length 352 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WNT3AP56704 TMEM45A-202ENST00000403410 1910 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
WNT3AP56704 GNAI2-207ENST00000451956 1486 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
WNT3AP56704 AC007952.5-201ENST00000572818 1486 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
WNT3AP56704 OR2V1-202ENST00000641318 2665 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
WNT3AP56704 PRCP-201ENST00000313010 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
WNT3AP56704 PAK1IP1-201ENST00000379568 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
WNT3AP56704 FSD1L-206ENST00000481272 1804 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
WNT3AP56704 ODF2L-204ENST00000370566 2155 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
WNT3AP56704 AC023794.5-201ENST00000564380 2157 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
WNT3AP56704 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
WNT3AP56704 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
WNT3AP56704 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
WNT3AP56704 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
WNT3AP56704 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
WNT3AP56704 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
WNT3AP56704 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
WNT3AP56704 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
WNT3AP56704 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
WNT3AP56704 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
WNT3AP56704 KRT18P15-201ENST00000458108 1291 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
WNT3AP56704 HOXB-AS3-206ENST00000474040 741 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
WNT3AP56704 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
WNT3AP56704 NDRG1-209ENST00000518176 888 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
WNT3AP56704 AC044849.1-201ENST00000519737 1188 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
WNT3AP56704 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
WNT3AP56704 AC009779.1-201ENST00000551138 283 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
WNT3AP56704 AC013355.1-201ENST00000562625 723 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
WNT3AP56704 AC127024.2-201ENST00000581019 789 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
WNT3AP56704 NFIC-204ENST00000586919 1221 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
WNT3AP56704 AL132994.2-201ENST00000603120 687 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
WNT3AP56704 ZDHHC8-201ENST00000320602 3072 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
WNT3AP56704 CUL1-201ENST00000325222 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
WNT3AP56704 H6PD-203ENST00000602477 5590 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
WNT3AP56704 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
WNT3AP56704 GAS2L2-202ENST00000604641 3014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
WNT3AP56704 GTPBP1-201ENST00000216044 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
WNT3AP56704 RIC8B-202ENST00000392837 5135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
WNT3AP56704 HIF3A-202ENST00000244303 2250 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
WNT3AP56704 KCNC2-202ENST00000350228 3344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
WNT3AP56704 CYB5D2-203ENST00000575251 1588 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
WNT3AP56704 VSIR-201ENST00000394957 4689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
WNT3AP56704 MTG2-201ENST00000370823 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
WNT3AP56704 RSPH9-202ENST00000372165 2586 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
WNT3AP56704 SMYD5-202ENST00000389501 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
WNT3AP56704 INPPL1-213ENST00000541756 4649 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
WNT3AP56704 PLCB3-202ENST00000325234 3946 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
WNT3AP56704 PPRC1-203ENST00000413464 4580 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
WNT3AP56704 ALG3-205ENST00000445626 1533 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
WNT3AP56704 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
WNT3AP56704 MFAP3-201ENST00000322602 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
WNT3AP56704 TDRD5-201ENST00000294848 3525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
WNT3AP56704 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
WNT3AP56704 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
WNT3AP56704 TAF9-202ENST00000328663 1461 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
WNT3AP56704 AC012184.2-203ENST00000443119 2110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
WNT3AP56704 GPN2-202ENST00000374135 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
WNT3AP56704 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
WNT3AP56704 FOXM1-203ENST00000361953 3370 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
WNT3AP56704 PLSCR1-214ENST00000487389 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
WNT3AP56704 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
WNT3AP56704 AFDN-205ENST00000392108 6812 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
WNT3AP56704 L3MBTL1-206ENST00000427442 3157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
WNT3AP56704 CIC-207ENST00000575354 5473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
WNT3AP56704 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
WNT3AP56704 ZFYVE27-202ENST00000357540 2765 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
WNT3AP56704 ZFYVE27-204ENST00000370610 2769 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
WNT3AP56704 IER3-201ENST00000259874 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
WNT3AP56704 FUNDC2P2-201ENST00000331369 1223 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
WNT3AP56704 LCMT1-202ENST00000380966 989 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
WNT3AP56704 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
WNT3AP56704 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
WNT3AP56704 LINC00441-201ENST00000433480 1143 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
WNT3AP56704 NKAIN1P1-201ENST00000435754 582 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
WNT3AP56704 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
WNT3AP56704 AC011603.2-203ENST00000547387 897 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
WNT3AP56704 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
WNT3AP56704 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
WNT3AP56704 AC099811.3-201ENST00000586351 425 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
WNT3AP56704 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
WNT3AP56704 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
WNT3AP56704 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
WNT3AP56704 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
WNT3AP56704 PIP5K1B-208ENST00000541509 2664 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
WNT3AP56704 KLHL25-201ENST00000337975 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
WNT3AP56704 SPOCK3-202ENST00000357545 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
WNT3AP56704 ZNF362-201ENST00000373428 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
WNT3AP56704 MST1-202ENST00000449682 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
WNT3AP56704 TPD52L2-206ENST00000358548 2275 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
WNT3AP56704 FAM90A1-203ENST00000538603 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
WNT3AP56704 GRIN1-206ENST00000371559 3577 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
WNT3AP56704 CPNE2-204ENST00000565874 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
WNT3AP56704 SOX21-AS1-201ENST00000438290 3287 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
WNT3AP56704 GRIN2C-201ENST00000293190 4261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
WNT3AP56704 SAMD4B-201ENST00000314471 4519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
WNT3AP56704 CDK20-201ENST00000325303 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
WNT3AP56704 PAX2-202ENST00000361791 3193 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
WNT3AP56704 NEDD4L-238ENST00000635997 4402 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
WNT3AP56704 FGFR3-201ENST00000260795 4132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
WNT3AP56704 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
WNT3AP56704 EBLN3P-202ENST00000625445 4520 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.5 ms