Protein–RNA interactions for Protein: P56180

TPTE, Putative tyrosine-protein phosphatase TPTE, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPTEP56180 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
TPTEP56180 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
TPTEP56180 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
TPTEP56180 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
TPTEP56180 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
TPTEP56180 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
TPTEP56180 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
TPTEP56180 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
TPTEP56180 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
TPTEP56180 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
TPTEP56180 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
TPTEP56180 COL6A3-202ENST00000347401 8625 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
TPTEP56180 COL6A3-209ENST00000472056 8628 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
TPTEP56180 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
TPTEP56180 ZNF135-205ENST00000511556 2253 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
TPTEP56180 KRT74-201ENST00000305620 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
TPTEP56180 TMEM130-201ENST00000339375 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
TPTEP56180 CTTN-201ENST00000301843 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
TPTEP56180 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
TPTEP56180 C21orf62-AS1-201ENST00000382375 2453 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
TPTEP56180 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
TPTEP56180 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
TPTEP56180 AC015802.6-201ENST00000640006 5654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
TPTEP56180 PARVB-201ENST00000338758 5429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
TPTEP56180 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
TPTEP56180 MSH6-214ENST00000616033 3429 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
TPTEP56180 NFATC4-226ENST00000556279 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
TPTEP56180 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
TPTEP56180 DNM1-213ENST00000628346 3835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
TPTEP56180 KCNMA1-232ENST00000638306 3811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
TPTEP56180 GSE1-202ENST00000393243 7140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
TPTEP56180 CYTH1-203ENST00000585509 3315 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
TPTEP56180 MNT-201ENST00000174618 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
TPTEP56180 HELLS-202ENST00000348459 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
TPTEP56180 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
TPTEP56180 SLC9A8-201ENST00000361573 6094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
TPTEP56180 CX3CL1-204ENST00000565912 5796 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TPTEP56180 LAMP2-203ENST00000434600 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TPTEP56180 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TPTEP56180 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
TPTEP56180 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
TPTEP56180 MCRIP1-212ENST00000576730 2979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
TPTEP56180 MKRN1-201ENST00000255977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TPTEP56180 ATXN2L-225ENST00000570200 3635 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TPTEP56180 ZFYVE27-201ENST00000337540 2927 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
TPTEP56180 MKX-201ENST00000375790 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TPTEP56180 GLP1R-201ENST00000373256 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TPTEP56180 AL031714.1-202ENST00000568106 3107 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
TPTEP56180 BTNL8-201ENST00000231229 2229 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TPTEP56180 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TPTEP56180 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TPTEP56180 CNTNAP1-201ENST00000264638 5276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TPTEP56180 TMEM233-201ENST00000426426 3081 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
TPTEP56180 AC108002.1-201ENST00000520572 5684 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TPTEP56180 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TPTEP56180 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
TPTEP56180 HRC-201ENST00000252825 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TPTEP56180 LPO-204ENST00000543544 2350 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
TPTEP56180 PIK3R1-213ENST00000521657 3891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
TPTEP56180 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TPTEP56180 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
TPTEP56180 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
TPTEP56180 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TPTEP56180 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TPTEP56180 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TPTEP56180 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
TPTEP56180 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TPTEP56180 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
TPTEP56180 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
TPTEP56180 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TPTEP56180 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
TPTEP56180 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
TPTEP56180 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
TPTEP56180 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
TPTEP56180 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
TPTEP56180 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
TPTEP56180 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
TPTEP56180 KLHL9-201ENST00000359039 5710 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
TPTEP56180 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
TPTEP56180 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TPTEP56180 ITGA2B-201ENST00000262407 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TPTEP56180 CALCOCO1-218ENST00000550804 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TPTEP56180 TRPM5-201ENST00000155858 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TPTEP56180 CHD5-201ENST00000262450 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TPTEP56180 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
TPTEP56180 WDFY1-201ENST00000233055 4660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TPTEP56180 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TPTEP56180 SUPT20HL1-201ENST00000436466 2618 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
TPTEP56180 NCS1-201ENST00000372398 4991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TPTEP56180 PLCB3-201ENST00000279230 4197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TPTEP56180 FAM76A-204ENST00000373954 3567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TPTEP56180 KDM2B-215ENST00000542973 3170 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
TPTEP56180 ARHGEF2-201ENST00000313667 2958 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TPTEP56180 SLCO2B1-203ENST00000428359 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TPTEP56180 SLC38A7-215ENST00000570101 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TPTEP56180 INPP5J-201ENST00000331075 3347 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
TPTEP56180 SCN2B-201ENST00000278947 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
TPTEP56180 AC015712.2-201ENST00000560351 3688 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
TPTEP56180 ARHGAP33-204ENST00000378944 4219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
TPTEP56180 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52 ms