Protein–RNA interactions for Protein: P49768

PSEN1, Presenilin-1, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSEN1P49768 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PSEN1P49768 MTND5P31-201ENST00000419366 1374 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PSEN1P49768 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PSEN1P49768 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PSEN1P49768 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PSEN1P49768 SPOCK3-207ENST00000504953 2900 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PSEN1P49768 PCGF2-202ENST00000611883 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSEN1P49768 UBTF-205ENST00000526094 2459 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSEN1P49768 DAXX-213ENST00000620164 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSEN1P49768 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSEN1P49768 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSEN1P49768 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSEN1P49768 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSEN1P49768 CLIP2-203ENST00000395060 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSEN1P49768 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSEN1P49768 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSEN1P49768 CDC45-205ENST00000437685 2072 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSEN1P49768 CDYL2-203ENST00000562812 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSEN1P49768 CDYL2-204ENST00000563890 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSEN1P49768 CDYL2-205ENST00000566173 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSEN1P49768 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSEN1P49768 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSEN1P49768 CCNG2-205ENST00000509972 1549 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSEN1P49768 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSEN1P49768 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSEN1P49768 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSEN1P49768 ZRANB2-AS2-201ENST00000411721 518 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSEN1P49768 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSEN1P49768 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSEN1P49768 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSEN1P49768 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PSEN1P49768 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PSEN1P49768 AC004918.1-201ENST00000467537 770 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSEN1P49768 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PSEN1P49768 FSBP-201ENST00000481490 1158 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSEN1P49768 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSEN1P49768 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSEN1P49768 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSEN1P49768 AC015727.1-201ENST00000572792 512 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSEN1P49768 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSEN1P49768 AC092474.3-201ENST00000603022 568 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PSEN1P49768 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSEN1P49768 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSEN1P49768 POU2F2-216ENST00000560558 3282 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSEN1P49768 CYB5D1-203ENST00000571846 1870 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSEN1P49768 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PSEN1P49768 IKBKB-217ENST00000520810 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSEN1P49768 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSEN1P49768 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSEN1P49768 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSEN1P49768 NEFH-201ENST00000310624 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSEN1P49768 GPR132-202ENST00000392585 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSEN1P49768 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSEN1P49768 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSEN1P49768 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSEN1P49768 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSEN1P49768 IL3RA-201ENST00000331035 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSEN1P49768 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSEN1P49768 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSEN1P49768 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSEN1P49768 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSEN1P49768 ALDH3B1-201ENST00000342456 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSEN1P49768 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSEN1P49768 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSEN1P49768 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSEN1P49768 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PSEN1P49768 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSEN1P49768 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSEN1P49768 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSEN1P49768 LDLRAD2-201ENST00000344642 4012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSEN1P49768 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSEN1P49768 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSEN1P49768 LINC02346-201ENST00000383019 1967 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSEN1P49768 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSEN1P49768 HIST1H1A-201ENST00000244573 648 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSEN1P49768 PIGF-202ENST00000306465 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSEN1P49768 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSEN1P49768 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSEN1P49768 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSEN1P49768 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSEN1P49768 AL035706.1-201ENST00000439186 683 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSEN1P49768 AL391415.1-201ENST00000439844 400 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSEN1P49768 SMIM30-204ENST00000441359 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSEN1P49768 AC104457.2-201ENST00000446055 467 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSEN1P49768 PTP4A2-201ENST00000457805 1032 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSEN1P49768 AC022274.1-201ENST00000467082 490 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSEN1P49768 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSEN1P49768 RASA2-IT1-201ENST00000507770 612 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSEN1P49768 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSEN1P49768 AC023194.3-201ENST00000522679 277 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSEN1P49768 AC011632.1-203ENST00000522914 454 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSEN1P49768 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PSEN1P49768 AC027544.2-201ENST00000539313 630 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSEN1P49768 AC243972.2-201ENST00000541653 991 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PSEN1P49768 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSEN1P49768 AC090772.3-201ENST00000583267 735 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSEN1P49768 E2F3P1-201ENST00000589887 1230 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PSEN1P49768 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSEN1P49768 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSEN1P49768 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.4 ms