Protein–RNA interactions for Protein: P48681

NES, Nestin, humanhuman

Predictions only

Length 1,621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NESP48681 MIR1587-201ENST00000583319 53 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
NESP48681 AC009041.1-202ENST00000599946 987 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NESP48681 AC136475.9-201ENST00000605240 497 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
NESP48681 Metazoa_SRP.64-201ENST00000611904 268 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
NESP48681 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NESP48681 KRT18P45-201ENST00000515347 1333 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
NESP48681 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NESP48681 GOLGA8G-203ENST00000525590 2009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NESP48681 GOLGA8F-202ENST00000532622 2009 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NESP48681 LINC00882-204ENST00000484698 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NESP48681 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NESP48681 GAPDHS-201ENST00000222286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NESP48681 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NESP48681 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NESP48681 LRP5L-202ENST00000402859 1661 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NESP48681 EPN2-210ENST00000571254 1883 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NESP48681 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NESP48681 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NESP48681 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NESP48681 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NESP48681 SLC25A5-201ENST00000317881 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NESP48681 AC025259.1-201ENST00000550301 647 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NESP48681 HERC2P5-202ENST00000564458 1164 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NESP48681 HERC2P8-203ENST00000564795 1164 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NESP48681 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NESP48681 CD9-212ENST00000610354 1315 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NESP48681 APEX1-201ENST00000216714 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NESP48681 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NESP48681 ATP1B3-201ENST00000286371 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NESP48681 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NESP48681 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NESP48681 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NESP48681 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NESP48681 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NESP48681 ZDHHC8-201ENST00000320602 3072 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NESP48681 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NESP48681 CA6-201ENST00000377436 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NESP48681 CA6-202ENST00000377442 747 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NESP48681 PAX5-204ENST00000377852 1472 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NESP48681 NR0B1-201ENST00000378963 475 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NESP48681 SMARCB1-203ENST00000407082 1182 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NESP48681 ATP5G1P7-201ENST00000444398 400 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
NESP48681 MINDY1-205ENST00000493834 1546 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NESP48681 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NESP48681 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NESP48681 KRT18P8-201ENST00000581937 1246 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
NESP48681 AC024075.2-201ENST00000598112 1473 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
NESP48681 SKINT1L-204ENST00000604015 540 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NESP48681 AL031056.1-202ENST00000635954 2193 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NESP48681 AC022167.5-201ENST00000636296 1250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NESP48681 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NESP48681 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NESP48681 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NESP48681 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NESP48681 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NESP48681 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NESP48681 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NESP48681 LIMS4-204ENST00000632897 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NESP48681 AC005519.2-201ENST00000554532 1367 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NESP48681 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NESP48681 OAZ3-201ENST00000321531 851 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NESP48681 RIBC1-203ENST00000414955 1281 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NESP48681 AL049792.1-201ENST00000424708 1262 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
NESP48681 HNRNPA1P68-201ENST00000425806 979 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
NESP48681 AC105446.1-201ENST00000441882 407 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NESP48681 FHIT-205ENST00000476844 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NESP48681 AL583722.3-201ENST00000553433 503 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NESP48681 AC104759.1-201ENST00000559109 939 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
NESP48681 MED11-203ENST00000575284 652 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NESP48681 NRSN2-206ENST00000608736 712 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NESP48681 MIR6871-201ENST00000613433 56 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
NESP48681 MDC1-209ENST00000613547 830 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NESP48681 GTF3A-209ENST00000640289 1098 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NESP48681 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NESP48681 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NESP48681 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NESP48681 SPAG8-202ENST00000396638 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NESP48681 FAM27E3-201ENST00000418795 1593 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NESP48681 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NESP48681 GMPR2-205ENST00000456667 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NESP48681 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NESP48681 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NESP48681 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NESP48681 VRK3-201ENST00000316763 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NESP48681 AL512422.2-201ENST00000426453 551 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NESP48681 AP000343.1-201ENST00000440602 385 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
NESP48681 BICD1P1-201ENST00000457832 1222 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
NESP48681 FPGT-205ENST00000482102 561 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NESP48681 AC007622.1-201ENST00000488371 535 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
NESP48681 STMN4-203ENST00000519614 1273 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NESP48681 TMEM241-208ENST00000542162 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NESP48681 AC241585.2-202ENST00000621798 1015 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NESP48681 SLC50A1-214ENST00000622581 1245 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NESP48681 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NESP48681 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NESP48681 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NESP48681 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NESP48681 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NESP48681 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NESP48681 PIGB-202ENST00000539642 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.6 ms