Protein–RNA interactions for Protein: P48230

TM4SF4, Transmembrane 4 L6 family member 4, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM4SF4P48230 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TM4SF4P48230 TUBA1B-202ENST00000336023 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TM4SF4P48230 Z82195.2-202ENST00000458525 1646 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TM4SF4P48230 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TM4SF4P48230 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TM4SF4P48230 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TM4SF4P48230 CLEC10A-206ENST00000576617 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TM4SF4P48230 MPP6-202ENST00000396475 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TM4SF4P48230 FTSJ1-203ENST00000396894 1669 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TM4SF4P48230 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TM4SF4P48230 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TM4SF4P48230 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TM4SF4P48230 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TM4SF4P48230 MPZL3-204ENST00000527472 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TM4SF4P48230 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TM4SF4P48230 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TM4SF4P48230 XRN1-203ENST00000463916 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TM4SF4P48230 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TM4SF4P48230 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TM4SF4P48230 SAP18-201ENST00000382533 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TM4SF4P48230 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TM4SF4P48230 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TM4SF4P48230 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TM4SF4P48230 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TM4SF4P48230 DNAJB6-204ENST00000429029 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TM4SF4P48230 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
TM4SF4P48230 RPSAP6-201ENST00000417882 882 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
TM4SF4P48230 AC093495.1-201ENST00000420253 1067 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TM4SF4P48230 ACTG1P23-201ENST00000437653 1074 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
TM4SF4P48230 RBM14-205ENST00000443702 732 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TM4SF4P48230 C10orf90-207ENST00000480379 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TM4SF4P48230 IQSEC2-205ENST00000498281 673 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TM4SF4P48230 SMAD1-AS1-201ENST00000513542 481 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TM4SF4P48230 AC007610.1-201ENST00000568130 498 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TM4SF4P48230 AC090282.1-201ENST00000572821 534 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TM4SF4P48230 DSCAS-201ENST00000581836 553 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TM4SF4P48230 AC100786.1-201ENST00000583018 513 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TM4SF4P48230 AC010503.4-201ENST00000615487 688 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
TM4SF4P48230 CBR3-AS1-210ENST00000623484 392 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TM4SF4P48230 CBR3-AS1-215ENST00000624086 594 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TM4SF4P48230 ERAS-202ENST00000636362 826 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TM4SF4P48230 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TM4SF4P48230 PNLIP-201ENST00000369221 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TM4SF4P48230 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TM4SF4P48230 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TM4SF4P48230 KDF1-202ENST00000616918 1651 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TM4SF4P48230 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TM4SF4P48230 NAP1L1-226ENST00000552342 1526 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TM4SF4P48230 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TM4SF4P48230 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TM4SF4P48230 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TM4SF4P48230 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TM4SF4P48230 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TM4SF4P48230 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TM4SF4P48230 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TM4SF4P48230 PLEKHG6-202ENST00000304581 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TM4SF4P48230 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TM4SF4P48230 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TM4SF4P48230 COMMD10-201ENST00000274458 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TM4SF4P48230 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TM4SF4P48230 UBIAD1-201ENST00000376804 825 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TM4SF4P48230 AP005273.1-201ENST00000444862 522 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TM4SF4P48230 AC011995.2-201ENST00000452701 574 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TM4SF4P48230 AL161727.1-201ENST00000457409 530 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
TM4SF4P48230 CHIC2-204ENST00000512964 711 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TM4SF4P48230 AP002495.1-205ENST00000529513 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TM4SF4P48230 GLT8D2-204ENST00000547583 862 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TM4SF4P48230 AC091691.1-201ENST00000583587 1018 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
TM4SF4P48230 EMP3-204ENST00000596315 761 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TM4SF4P48230 AC083798.2-202ENST00000609469 553 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TM4SF4P48230 AL162731.1-201ENST00000613248 876 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TM4SF4P48230 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
TM4SF4P48230 CDCA3-207ENST00000538862 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TM4SF4P48230 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TM4SF4P48230 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TM4SF4P48230 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TM4SF4P48230 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TM4SF4P48230 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TM4SF4P48230 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TM4SF4P48230 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TM4SF4P48230 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TM4SF4P48230 AL022313.4-201ENST00000562756 2046 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
TM4SF4P48230 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TM4SF4P48230 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TM4SF4P48230 TP63-206ENST00000392463 1386 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TM4SF4P48230 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TM4SF4P48230 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TM4SF4P48230 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TM4SF4P48230 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TM4SF4P48230 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TM4SF4P48230 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TM4SF4P48230 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TM4SF4P48230 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TM4SF4P48230 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TM4SF4P48230 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TM4SF4P48230 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TM4SF4P48230 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TM4SF4P48230 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TM4SF4P48230 LINC00967-203ENST00000518035 1502 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TM4SF4P48230 NAT8B-201ENST00000377712 765 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms