Protein–RNA interactions for Protein: P20963

CD247, T-cell surface glycoprotein CD3 zeta chain, humanhuman

Predictions only

Length 164 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD247P20963 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
CD247P20963 C1orf228-218ENST00000458657 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CD247P20963 POTEM-201ENST00000547889 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CD247P20963 C17orf53-203ENST00000585683 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CD247P20963 RPS6KC1-208ENST00000614059 4188 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CD247P20963 CREB3L4-204ENST00000368603 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CD247P20963 MARK2-205ENST00000408948 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CD247P20963 FES-201ENST00000328850 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CD247P20963 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CD247P20963 DDC-207ENST00000444124 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CD247P20963 TRIT1-214ENST00000537440 2026 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CD247P20963 LINC00882-204ENST00000484698 2718 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CD247P20963 PPP3R1-201ENST00000234310 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CD247P20963 PDE2A-218ENST00000540345 3027 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CD247P20963 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CD247P20963 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
CD247P20963 BCL2-201ENST00000333681 3209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CD247P20963 PTCHD3-201ENST00000438700 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CD247P20963 MKRN2-201ENST00000170447 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CD247P20963 FNTB-201ENST00000246166 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CD247P20963 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
CD247P20963 TMUB2-211ENST00000589184 1837 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CD247P20963 VGLL3-202ENST00000398399 10400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CD247P20963 RNF14-201ENST00000347642 4213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CD247P20963 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CD247P20963 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CD247P20963 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CD247P20963 SUOX-202ENST00000356124 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CD247P20963 SIRPA-202ENST00000358771 3996 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CD247P20963 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CD247P20963 PTPN5-203ENST00000396168 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CD247P20963 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CD247P20963 MARVELD2-203ENST00000436532 1563 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CD247P20963 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
CD247P20963 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
CD247P20963 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CD247P20963 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
CD247P20963 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
CD247P20963 NPNT-211ENST00000506666 2187 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CD247P20963 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CD247P20963 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CD247P20963 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CD247P20963 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CD247P20963 AC131902.2-201ENST00000566892 2172 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
CD247P20963 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
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CD247P20963 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
CD247P20963 AL356275.1-201ENST00000638446 7440 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CD247P20963 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CD247P20963 MAPK4-206ENST00000592595 4330 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CD247P20963 RBM6-211ENST00000443081 4010 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CD247P20963 PLXNB2-201ENST00000359337 6335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CD247P20963 MTMR3-204ENST00000401950 6018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CD247P20963 CALD1-205ENST00000422748 2665 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CD247P20963 TCTN2-202ENST00000426174 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CD247P20963 AC072061.1-201ENST00000569710 2234 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
CD247P20963 SIRT2-202ENST00000358931 1912 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CD247P20963 CDH1-201ENST00000261769 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CD247P20963 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CD247P20963 IL11RA-208ENST00000555003 3008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CD247P20963 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CD247P20963 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CD247P20963 PARP1-203ENST00000366794 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CD247P20963 MLPH-201ENST00000264605 3823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CD247P20963 MARK2-206ENST00000425897 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CD247P20963 SATB2-211ENST00000614512 4972 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CD247P20963 OAS3-201ENST00000228928 6719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CD247P20963 TUBGCP6-201ENST00000248846 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CD247P20963 RNF43-205ENST00000581868 2610 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CD247P20963 INO80-202ENST00000401393 5991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CD247P20963 CCNC-210ENST00000520429 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CD247P20963 ATCAY-201ENST00000450849 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CD247P20963 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
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CD247P20963 PPFIA4-203ENST00000367240 6434 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CD247P20963 ANKRD36BP2-202ENST00000421951 1899 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CD247P20963 SMAGP-203ENST00000603798 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CD247P20963 MED14-201ENST00000324817 7984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CD247P20963 PLEKHB2-206ENST00000409612 2210 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CD247P20963 ATN1-201ENST00000356654 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CD247P20963 TMPRSS2-201ENST00000332149 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CD247P20963 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CD247P20963 KCTD9-201ENST00000221200 3401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CD247P20963 GNAI2-203ENST00000422163 2407 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CD247P20963 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
CD247P20963 MTMR9-201ENST00000221086 7481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CD247P20963 VAPA-202ENST00000400000 6815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CD247P20963 RIN3-212ENST00000620541 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CD247P20963 CFAP157-206ENST00000614677 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CD247P20963 BORCS5-202ENST00000314565 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CD247P20963 AL445209.1-201ENST00000607269 3491 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
CD247P20963 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CD247P20963 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CD247P20963 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CD247P20963 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CD247P20963 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
CD247P20963 PGGHG-204ENST00000409655 2963 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CD247P20963 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC13.59□□□□□ -0.23
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