Protein–RNA interactions for Protein: P19634

SLC9A1, Sodium/hydrogen exchanger 1, humanhuman

Predictions only

Length 815 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A1P19634 SLC43A2-201ENST00000301335 8136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC9A1P19634 VWF-201ENST00000261405 8838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SLC9A1P19634 TMEM45A-202ENST00000403410 1910 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SLC9A1P19634 SGK3-208ENST00000521198 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SLC9A1P19634 APLP2-203ENST00000338167 3270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SLC9A1P19634 ADAM15-209ENST00000449910 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SLC9A1P19634 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SLC9A1P19634 KIAA0141-201ENST00000194118 2203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SLC9A1P19634 HPGD-209ENST00000510901 1535 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SLC9A1P19634 LINC00339-208ENST00000634934 1518 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SLC9A1P19634 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SLC9A1P19634 USP39-220ENST00000613444 2161 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SLC9A1P19634 OSBPL1A-201ENST00000319481 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SLC9A1P19634 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SLC9A1P19634 TAF9-202ENST00000328663 1461 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SLC9A1P19634 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SLC9A1P19634 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SLC9A1P19634 IL12RB1-203ENST00000593993 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SLC9A1P19634 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SLC9A1P19634 CD59-201ENST00000351554 1775 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SLC9A1P19634 LONP1-202ENST00000540670 3002 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SLC9A1P19634 LGALS12-202ENST00000340246 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC9A1P19634 SH3GLB2-205ENST00000416629 1415 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC9A1P19634 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC9A1P19634 SLC2A11-223ENST00000611880 3264 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC9A1P19634 AC002407.1-201ENST00000636668 3863 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC9A1P19634 SFSWAP-210ENST00000541286 3219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC9A1P19634 TRDMT1-203ENST00000377799 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC9A1P19634 LINC01873-201ENST00000428647 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC9A1P19634 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC9A1P19634 PGBD2-202ENST00000355360 2879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC9A1P19634 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC9A1P19634 CPNE5-202ENST00000393189 2542 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC9A1P19634 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC9A1P19634 AC073869.1-201ENST00000415574 2762 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC9A1P19634 ZNF718-202ENST00000609714 2772 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC9A1P19634 DENND4C-209ENST00000602925 6831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC9A1P19634 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC9A1P19634 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC9A1P19634 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC9A1P19634 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC9A1P19634 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC9A1P19634 VDAC1P1-201ENST00000439229 848 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC9A1P19634 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC9A1P19634 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC9A1P19634 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC9A1P19634 AC011603.2-203ENST00000547387 897 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC9A1P19634 TGIF1-218ENST00000551402 1089 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC9A1P19634 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC9A1P19634 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC9A1P19634 AC005324.6-201ENST00000587972 613 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC9A1P19634 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC9A1P19634 GOLGA8IP-202ENST00000611635 2100 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC9A1P19634 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC9A1P19634 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC9A1P19634 PCBP2-OT1-201ENST00000634357 590 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC9A1P19634 NGEF-201ENST00000264051 3215 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC9A1P19634 KCNAB2-219ENST00000602612 2396 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC9A1P19634 PADI2-202ENST00000375486 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC9A1P19634 KCNV1-201ENST00000297404 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC9A1P19634 SLC4A7-212ENST00000446700 4000 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC9A1P19634 LINC02135-201ENST00000599486 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC9A1P19634 CPT1A-202ENST00000376618 2635 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC9A1P19634 GGT1-203ENST00000400382 2628 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC9A1P19634 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC9A1P19634 TAF6-205ENST00000437822 2318 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC9A1P19634 KIFC3-202ENST00000421376 3128 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC9A1P19634 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC9A1P19634 ADAMTS10-201ENST00000270328 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC9A1P19634 ADCY7-208ENST00000566433 2535 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC9A1P19634 ADAMTS13-205ENST00000371916 4330 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC9A1P19634 CDPF1-203ENST00000404583 1439 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC9A1P19634 VWA8-201ENST00000281496 3475 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC9A1P19634 TSPEAR-AS2-202ENST00000354333 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC9A1P19634 COL8A2-201ENST00000303143 4447 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC9A1P19634 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC9A1P19634 TMPO-202ENST00000266732 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC9A1P19634 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC9A1P19634 COLEC11-203ENST00000382062 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC9A1P19634 CNGA3-204ENST00000409937 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC9A1P19634 AC073548.1-201ENST00000624088 1882 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC9A1P19634 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC9A1P19634 TNFAIP8L1-201ENST00000327473 3814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC9A1P19634 TNFAIP8L1-202ENST00000536716 3845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC9A1P19634 ARRB1-202ENST00000420843 3336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC9A1P19634 GFPT2-201ENST00000253778 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC9A1P19634 RPP30-202ENST00000371703 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC9A1P19634 CD6-201ENST00000313421 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC9A1P19634 PCDH8-201ENST00000338862 3708 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC9A1P19634 KCP-206ENST00000613019 4853 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC9A1P19634 FBXL16-201ENST00000324361 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC9A1P19634 MAGED4B-211ENST00000497164 2482 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC9A1P19634 CCNC-210ENST00000520429 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC9A1P19634 MYADM-203ENST00000391769 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC9A1P19634 BSDC1-205ENST00000446293 1505 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC9A1P19634 EHD1-202ENST00000359393 3618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC9A1P19634 MAPK14-202ENST00000229795 4319 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC9A1P19634 HOXA3-207ENST00000612286 3396 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC9A1P19634 NCLP1-201ENST00000445357 1963 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC9A1P19634 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.8 ms