Protein–RNA interactions for Protein: H3BUS1

SYS1-DBNDD2, SYS1-DBNDD2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYS1-DBNDD2H3BUS1 F2RL3-201ENST00000248076 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NBPF12-208ENST00000617931 7061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CRHR2-201ENST00000341843 3131 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SEPT9-207ENST00000449803 3996 ntTSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC064801.2-201ENST00000625052 1303 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MED15-201ENST00000263205 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PRKG2-201ENST00000264399 4822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CSPG4P13-202ENST00000567704 4801 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KCNAB2-202ENST00000341524 4207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MRVI1-216ENST00000547195 6155 ntTSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KCNMA1-241ENST00000638606 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KCNMA1-279ENST00000640182 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CTAGE10P-201ENST00000318353 2408 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
SYS1-DBNDD2H3BUS1 VPS33B-202ENST00000535906 2420 ntTSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
SYS1-DBNDD2H3BUS1 IP6K1-202ENST00000395238 4117 ntTSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GRHL2-201ENST00000251808 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EVA1A-201ENST00000233712 1815 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DAB1-207ENST00000420954 1817 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C1orf228-218ENST00000458657 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
SYS1-DBNDD2H3BUS1 IKZF1-203ENST00000346667 5376 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
SYS1-DBNDD2H3BUS1 VSTM4-202ENST00000332853 6392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RTL10-201ENST00000328554 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PLCXD1-201ENST00000381657 5507 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MKRN2-201ENST00000170447 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RGPD5-203ENST00000393283 3304 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TMEM74B-201ENST00000381894 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MME-204ENST00000462745 3590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL391845.2-201ENST00000443930 1954 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TMEM120B-204ENST00000449592 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C7orf57-201ENST00000348904 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZYX-203ENST00000392910 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SMIM27-203ENST00000451672 2382 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NUSAP1-208ENST00000559596 1629 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FMO1-203ENST00000402921 2003 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SIAE-201ENST00000263593 5583 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AKAP8-201ENST00000269701 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ARPP21-213ENST00000428373 3150 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SYNGR1-204ENST00000381535 1295 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC10.3□□□□□ -0.76
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC233724.6-201ENST00000503184 1088 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CR392039.2-201ENST00000623182 509 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PKP4P1-201ENST00000426801 2158 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RAD1-203ENST00000382038 5770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KCNH1-205ENST00000638498 3479 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BRWD1-204ENST00000380800 7605 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC6A1-201ENST00000287766 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CD74-202ENST00000353334 1449 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TXNRD1-202ENST00000388854 4277 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC087164.2-201ENST00000624514 3130 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KRT42P-201ENST00000398469 2864 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TXNDC17-201ENST00000250101 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC004241.1-201ENST00000547799 3299 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PCDHGA12-201ENST00000252085 4747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HDAC7-209ENST00000427332 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TMEM30A-203ENST00000475111 2791 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NUP62-208ENST00000596217 3590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
SYS1-DBNDD2H3BUS1 IQSEC1-204ENST00000613206 3582 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TLN2-202ENST00000472902 2116 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SHPRH-202ENST00000367503 5237 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CKMT2-203ENST00000437669 1479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CHIAP2-201ENST00000369743 2829 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
SYS1-DBNDD2H3BUS1 WIPF3-201ENST00000242140 4184 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AHI1-205ENST00000457866 5549 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZBTB26-201ENST00000373654 2047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HDLBP-204ENST00000391976 4489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HDAC7-202ENST00000354334 4065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HDAC7-201ENST00000080059 4095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC22A6-202ENST00000377871 2151 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TBL1X-203ENST00000407597 5596 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BOLL-201ENST00000282278 2742 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC6A2-205ENST00000566163 1759 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF493-208ENST00000599461 1769 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NBN-201ENST00000265433 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
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