Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y366

IFT52, Intraflagellar transport protein 52 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT52Q9Y366 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
IFT52Q9Y366 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
IFT52Q9Y366 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
IFT52Q9Y366 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
IFT52Q9Y366 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
IFT52Q9Y366 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
IFT52Q9Y366 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
IFT52Q9Y366 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
IFT52Q9Y366 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
IFT52Q9Y366 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
IFT52Q9Y366 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
IFT52Q9Y366 SMG8-201ENST00000300917 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
IFT52Q9Y366 AC020658.7-201ENST00000624274 2442 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
IFT52Q9Y366 ZNF609-202ENST00000416172 3863 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
IFT52Q9Y366 VPS9D1-202ENST00000561976 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
IFT52Q9Y366 SUV39H2-201ENST00000313519 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
IFT52Q9Y366 CLPB-209ENST00000538039 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
IFT52Q9Y366 PRELP-201ENST00000343110 5747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
IFT52Q9Y366 TRHDE-AS1-201ENST00000426250 3684 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
IFT52Q9Y366 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
IFT52Q9Y366 FGGY-203ENST00000371212 1640 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
IFT52Q9Y366 LRRFIP2-202ENST00000354379 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
IFT52Q9Y366 ELN-211ENST00000414324 3139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
IFT52Q9Y366 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
IFT52Q9Y366 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC13.56□□□□□ -0.24
IFT52Q9Y366 SSTR3-201ENST00000610913 4100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
IFT52Q9Y366 ITGB4-202ENST00000449880 5689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
IFT52Q9Y366 CARHSP1-218ENST00000614449 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
IFT52Q9Y366 PRR30-201ENST00000335524 2008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
IFT52Q9Y366 SPHK2-201ENST00000245222 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
IFT52Q9Y366 SDR16C5-202ENST00000396721 2399 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
IFT52Q9Y366 TMPRSS12-202ENST00000551456 3336 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
IFT52Q9Y366 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
IFT52Q9Y366 CLEC12A-AS1-201ENST00000420905 3956 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
IFT52Q9Y366 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
IFT52Q9Y366 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
IFT52Q9Y366 AC004241.5-201ENST00000623870 2448 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
IFT52Q9Y366 AL031595.1-201ENST00000623969 4709 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
IFT52Q9Y366 CDIP1-205ENST00000563332 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
IFT52Q9Y366 CCSER2-203ENST00000372088 7657 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
IFT52Q9Y366 AC099548.2-204ENST00000481651 2106 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
IFT52Q9Y366 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
IFT52Q9Y366 MMAB-210ENST00000545712 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
IFT52Q9Y366 ZBTB1-201ENST00000358738 4119 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
IFT52Q9Y366 MCM9-202ENST00000316316 5101 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
IFT52Q9Y366 SHCBP1-201ENST00000303383 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
IFT52Q9Y366 PDYN-AS1-201ENST00000446562 1802 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
IFT52Q9Y366 TRIM80P-201ENST00000455685 2848 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
IFT52Q9Y366 ISY1-203ENST00000393295 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
IFT52Q9Y366 ATXN2L-215ENST00000564304 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
IFT52Q9Y366 CTBP1-AS-201ENST00000625256 3886 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
IFT52Q9Y366 PTPN23-201ENST00000265562 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
IFT52Q9Y366 METTL13-203ENST00000367737 2865 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
IFT52Q9Y366 DMBT1P1-203ENST00000636837 4628 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
IFT52Q9Y366 ZFP36L2-201ENST00000282388 3696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
IFT52Q9Y366 AC244197.3-201ENST00000422081 2635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
IFT52Q9Y366 ABCB9-203ENST00000346530 3399 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
IFT52Q9Y366 MYADM-201ENST00000336967 3047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
IFT52Q9Y366 CBFA2T3-201ENST00000268679 4477 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
IFT52Q9Y366 RAB11FIP1-206ENST00000524118 1959 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
IFT52Q9Y366 PDK2-203ENST00000503176 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
IFT52Q9Y366 SPAG8-209ENST00000484764 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
IFT52Q9Y366 ELOA2-202ENST00000620522 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
IFT52Q9Y366 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
IFT52Q9Y366 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
IFT52Q9Y366 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
IFT52Q9Y366 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
IFT52Q9Y366 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
IFT52Q9Y366 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
IFT52Q9Y366 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
IFT52Q9Y366 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC13.55□□□□□ -0.24
IFT52Q9Y366 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
IFT52Q9Y366 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
IFT52Q9Y366 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
IFT52Q9Y366 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
IFT52Q9Y366 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
IFT52Q9Y366 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
IFT52Q9Y366 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
IFT52Q9Y366 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
IFT52Q9Y366 AC005586.2-201ENST00000563946 837 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
IFT52Q9Y366 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
IFT52Q9Y366 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
IFT52Q9Y366 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
IFT52Q9Y366 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
IFT52Q9Y366 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
IFT52Q9Y366 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
IFT52Q9Y366 SCFD1-203ENST00000458591 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
IFT52Q9Y366 FAM90A12P-201ENST00000519497 2375 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
IFT52Q9Y366 FAM90A24P-201ENST00000520792 2369 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
IFT52Q9Y366 GPR88-201ENST00000315033 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
IFT52Q9Y366 NUP210-201ENST00000254508 7193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
IFT52Q9Y366 ZNF251-201ENST00000292562 2807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
IFT52Q9Y366 KCNMA1-287ENST00000640632 2808 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
IFT52Q9Y366 DCHS1-201ENST00000299441 10765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
IFT52Q9Y366 ABCA2-201ENST00000265662 8154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
IFT52Q9Y366 YWHAEP7-202ENST00000620903 2455 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
IFT52Q9Y366 MFSD2B-201ENST00000338315 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
IFT52Q9Y366 MPP2-214ENST00000523501 2121 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
IFT52Q9Y366 CACNA2D2-204ENST00000424201 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
IFT52Q9Y366 DDC-AS1-201ENST00000454521 1776 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.2 ms