Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z2

CALCOCO1, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 691 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCOCO1Q9P1Z2 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CALCOCO1Q9P1Z2 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CALCOCO1Q9P1Z2 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CALCOCO1Q9P1Z2 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CALCOCO1Q9P1Z2 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CALCOCO1Q9P1Z2 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CALCOCO1Q9P1Z2 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CALCOCO1Q9P1Z2 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CALCOCO1Q9P1Z2 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CALCOCO1Q9P1Z2 OFD1-201ENST00000340096 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CALCOCO1Q9P1Z2 FAM189A1-201ENST00000261275 4705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CALCOCO1Q9P1Z2 EFR3B-202ENST00000401432 5162 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CALCOCO1Q9P1Z2 UMODL1-204ENST00000400427 5442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CALCOCO1Q9P1Z2 FBXL18-201ENST00000382368 3498 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CALCOCO1Q9P1Z2 GOSR2-235ENST00000640269 2190 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CALCOCO1Q9P1Z2 THBS2-206ENST00000617924 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CALCOCO1Q9P1Z2 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CALCOCO1Q9P1Z2 RAB37-202ENST00000392610 2858 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CALCOCO1Q9P1Z2 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CALCOCO1Q9P1Z2 PRR12-203ENST00000615927 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CALCOCO1Q9P1Z2 TRAPPC10-201ENST00000291574 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CALCOCO1Q9P1Z2 C8B-201ENST00000371237 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CALCOCO1Q9P1Z2 LINC01257-201ENST00000376678 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CALCOCO1Q9P1Z2 HJURP-207ENST00000441687 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CALCOCO1Q9P1Z2 ACIN1-204ENST00000397341 2738 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CALCOCO1Q9P1Z2 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CALCOCO1Q9P1Z2 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CALCOCO1Q9P1Z2 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CALCOCO1Q9P1Z2 CBLB-204ENST00000405772 3237 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CALCOCO1Q9P1Z2 FOXM1-210ENST00000627656 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CALCOCO1Q9P1Z2 ST3GAL5-203ENST00000393805 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CALCOCO1Q9P1Z2 PWWP2A-202ENST00000456329 3991 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CALCOCO1Q9P1Z2 NCOR2-208ENST00000429285 8475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CALCOCO1Q9P1Z2 AC012184.2-203ENST00000443119 2110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CALCOCO1Q9P1Z2 TRMT2B-203ENST00000372939 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CALCOCO1Q9P1Z2 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CALCOCO1Q9P1Z2 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CALCOCO1Q9P1Z2 STIM1-220ENST00000616714 4356 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CALCOCO1Q9P1Z2 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CALCOCO1Q9P1Z2 NUP98-204ENST00000397004 3923 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CALCOCO1Q9P1Z2 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CALCOCO1Q9P1Z2 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CALCOCO1Q9P1Z2 KIF21B-204ENST00000461742 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CALCOCO1Q9P1Z2 PPIP5K1-209ENST00000420765 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CALCOCO1Q9P1Z2 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CALCOCO1Q9P1Z2 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CALCOCO1Q9P1Z2 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CALCOCO1Q9P1Z2 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CALCOCO1Q9P1Z2 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CALCOCO1Q9P1Z2 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CALCOCO1Q9P1Z2 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CALCOCO1Q9P1Z2 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CALCOCO1Q9P1Z2 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CALCOCO1Q9P1Z2 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CALCOCO1Q9P1Z2 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CALCOCO1Q9P1Z2 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CALCOCO1Q9P1Z2 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CALCOCO1Q9P1Z2 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CALCOCO1Q9P1Z2 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CALCOCO1Q9P1Z2 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CALCOCO1Q9P1Z2 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CALCOCO1Q9P1Z2 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CALCOCO1Q9P1Z2 UNK-205ENST00000589666 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CALCOCO1Q9P1Z2 IL1RL2-201ENST00000264257 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CALCOCO1Q9P1Z2 SPRY1-208ENST00000622283 2352 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CALCOCO1Q9P1Z2 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CALCOCO1Q9P1Z2 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CALCOCO1Q9P1Z2 MROH2A-208ENST00000610772 5324 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CALCOCO1Q9P1Z2 CALD1-205ENST00000422748 2665 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CALCOCO1Q9P1Z2 SMPDL3B-202ENST00000373894 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CALCOCO1Q9P1Z2 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CALCOCO1Q9P1Z2 CYTH1-215ENST00000591455 3286 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CALCOCO1Q9P1Z2 CASC10-201ENST00000377113 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CALCOCO1Q9P1Z2 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CALCOCO1Q9P1Z2 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CALCOCO1Q9P1Z2 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CALCOCO1Q9P1Z2 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CALCOCO1Q9P1Z2 TICRR-201ENST00000268138 6775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CALCOCO1Q9P1Z2 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CALCOCO1Q9P1Z2 HNRNPH1-202ENST00000356731 3667 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CALCOCO1Q9P1Z2 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CALCOCO1Q9P1Z2 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CALCOCO1Q9P1Z2 ARHGEF10-207ENST00000520359 5472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CALCOCO1Q9P1Z2 SYNRG-217ENST00000612223 8229 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CALCOCO1Q9P1Z2 ISY1-203ENST00000393295 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CALCOCO1Q9P1Z2 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CALCOCO1Q9P1Z2 GDF9-201ENST00000296875 1796 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CALCOCO1Q9P1Z2 PGAP2-201ENST00000278243 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CALCOCO1Q9P1Z2 AHCY-205ENST00000538132 2366 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CALCOCO1Q9P1Z2 COL22A1-201ENST00000303045 6346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CALCOCO1Q9P1Z2 TMEM229B-207ENST00000557006 3941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CALCOCO1Q9P1Z2 PTH2R-201ENST00000272847 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CALCOCO1Q9P1Z2 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CALCOCO1Q9P1Z2 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CALCOCO1Q9P1Z2 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CALCOCO1Q9P1Z2 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CALCOCO1Q9P1Z2 CCDC88C-201ENST00000331194 3104 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CALCOCO1Q9P1Z2 ERG-207ENST00000398919 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CALCOCO1Q9P1Z2 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CALCOCO1Q9P1Z2 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
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