Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVR7

TBCCD1, TBCC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 557 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBCCD1Q9NVR7 SLC28A1-203ENST00000394573 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
TBCCD1Q9NVR7 RAB18-207ENST00000535776 4811 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
TBCCD1Q9NVR7 TRDMT1-203ENST00000377799 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
TBCCD1Q9NVR7 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
TBCCD1Q9NVR7 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
TBCCD1Q9NVR7 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
TBCCD1Q9NVR7 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
TBCCD1Q9NVR7 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
TBCCD1Q9NVR7 CPLX4-202ENST00000587244 1916 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
TBCCD1Q9NVR7 LINC00442-202ENST00000456737 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
TBCCD1Q9NVR7 TP53TG5-201ENST00000372726 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
TBCCD1Q9NVR7 SMAGP-203ENST00000603798 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
TBCCD1Q9NVR7 ZMYND10-201ENST00000231749 2896 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
TBCCD1Q9NVR7 PIGT-203ENST00000372689 1971 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
TBCCD1Q9NVR7 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.34□□□□□ -0.27
TBCCD1Q9NVR7 RRBP1-206ENST00000455029 2485 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
TBCCD1Q9NVR7 FAM90A26-201ENST00000512047 2492 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
TBCCD1Q9NVR7 TMPRSS13-201ENST00000430170 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
TBCCD1Q9NVR7 LINC02015-202ENST00000436078 2957 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
TBCCD1Q9NVR7 TMOD1-202ENST00000375175 2516 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
TBCCD1Q9NVR7 NAALADL1-201ENST00000340252 2376 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
TBCCD1Q9NVR7 HACD2-201ENST00000383657 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
TBCCD1Q9NVR7 IL1RAP-211ENST00000439062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
TBCCD1Q9NVR7 DFFB-205ENST00000378209 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
TBCCD1Q9NVR7 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
TBCCD1Q9NVR7 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
TBCCD1Q9NVR7 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
TBCCD1Q9NVR7 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
TBCCD1Q9NVR7 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
TBCCD1Q9NVR7 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
TBCCD1Q9NVR7 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
TBCCD1Q9NVR7 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
TBCCD1Q9NVR7 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
TBCCD1Q9NVR7 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
TBCCD1Q9NVR7 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
TBCCD1Q9NVR7 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC13.34□□□□□ -0.27
TBCCD1Q9NVR7 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
TBCCD1Q9NVR7 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
TBCCD1Q9NVR7 FAM86JP-201ENST00000467239 1910 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
TBCCD1Q9NVR7 RBM15-203ENST00000602849 3368 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
TBCCD1Q9NVR7 GRM1-202ENST00000355289 3874 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
TBCCD1Q9NVR7 OCA2-201ENST00000353809 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
TBCCD1Q9NVR7 ADAM8-201ENST00000415217 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
TBCCD1Q9NVR7 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
TBCCD1Q9NVR7 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
TBCCD1Q9NVR7 SPAG5-AS1-201ENST00000414744 2143 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
TBCCD1Q9NVR7 IKZF1-205ENST00000357364 5925 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
TBCCD1Q9NVR7 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
TBCCD1Q9NVR7 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
TBCCD1Q9NVR7 TRIM56-201ENST00000306085 10952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
TBCCD1Q9NVR7 SNCA-204ENST00000394989 3167 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
TBCCD1Q9NVR7 AC060814.4-201ENST00000594169 2163 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
TBCCD1Q9NVR7 CCDC180-210ENST00000529487 5242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
TBCCD1Q9NVR7 TRIM4-201ENST00000349062 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
TBCCD1Q9NVR7 APLP2-201ENST00000263574 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
TBCCD1Q9NVR7 DLGAP3-201ENST00000235180 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.27
TBCCD1Q9NVR7 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
TBCCD1Q9NVR7 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.27
TBCCD1Q9NVR7 LMBR1L-201ENST00000267102 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
TBCCD1Q9NVR7 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
TBCCD1Q9NVR7 GBP1P1-201ENST00000394662 1740 ntBASIC13.33□□□□□ -0.27
TBCCD1Q9NVR7 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.27
TBCCD1Q9NVR7 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
TBCCD1Q9NVR7 GPSM2-202ENST00000406462 7433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
TBCCD1Q9NVR7 TMEM245-201ENST00000374586 7980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
TBCCD1Q9NVR7 PRDM16-201ENST00000270722 8690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
TBCCD1Q9NVR7 ELN-222ENST00000458204 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
TBCCD1Q9NVR7 ZBTB42-201ENST00000342537 3800 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.27
TBCCD1Q9NVR7 ANKRD30B-202ENST00000358984 4359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
TBCCD1Q9NVR7 ALDH9A1-201ENST00000354775 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
TBCCD1Q9NVR7 TMEM57-201ENST00000374343 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
TBCCD1Q9NVR7 FASN-206ENST00000634990 8407 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
TBCCD1Q9NVR7 BCL2L11-221ENST00000621302 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
TBCCD1Q9NVR7 BCL2L11-222ENST00000622509 5231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
TBCCD1Q9NVR7 FAM212B-201ENST00000357260 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
TBCCD1Q9NVR7 MUC1-223ENST00000611571 4170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
TBCCD1Q9NVR7 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
TBCCD1Q9NVR7 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
TBCCD1Q9NVR7 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
TBCCD1Q9NVR7 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
TBCCD1Q9NVR7 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
TBCCD1Q9NVR7 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
TBCCD1Q9NVR7 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
TBCCD1Q9NVR7 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
TBCCD1Q9NVR7 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
TBCCD1Q9NVR7 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
TBCCD1Q9NVR7 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
TBCCD1Q9NVR7 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC13.33□□□□□ -0.28
TBCCD1Q9NVR7 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
TBCCD1Q9NVR7 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
TBCCD1Q9NVR7 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
TBCCD1Q9NVR7 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
TBCCD1Q9NVR7 GRAMD1B-216ENST00000638157 3849 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
TBCCD1Q9NVR7 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
TBCCD1Q9NVR7 DTX1-201ENST00000257600 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
TBCCD1Q9NVR7 FEM1A-201ENST00000269856 9593 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
TBCCD1Q9NVR7 NFKB1-201ENST00000226574 4085 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
TBCCD1Q9NVR7 ZNF148-205ENST00000484491 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
TBCCD1Q9NVR7 TCHH-201ENST00000368804 6900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
TBCCD1Q9NVR7 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
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