Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUP7

TRMT13, tRNA:m(4)X modification enzyme TRM13 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 481 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRMT13Q9NUP7 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRMT13Q9NUP7 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
TRMT13Q9NUP7 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRMT13Q9NUP7 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRMT13Q9NUP7 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRMT13Q9NUP7 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRMT13Q9NUP7 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRMT13Q9NUP7 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRMT13Q9NUP7 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRMT13Q9NUP7 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRMT13Q9NUP7 LUC7L2-208ENST00000541170 1525 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRMT13Q9NUP7 TMEM14C-201ENST00000229563 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRMT13Q9NUP7 HIST1H2BJ-201ENST00000339812 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRMT13Q9NUP7 SNRPC-202ENST00000374017 1054 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRMT13Q9NUP7 LINC00892-203ENST00000454385 686 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRMT13Q9NUP7 STK24P1-201ENST00000455035 1291 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TRMT13Q9NUP7 AC026470.1-201ENST00000478038 846 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TRMT13Q9NUP7 PRSS3P1-201ENST00000503996 742 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TRMT13Q9NUP7 LINC02171-201ENST00000508619 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRMT13Q9NUP7 NMNAT3-213ENST00000512391 794 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRMT13Q9NUP7 KRT18P37-201ENST00000520711 1282 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TRMT13Q9NUP7 TROAP-213ENST00000550709 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRMT13Q9NUP7 FOXN3-AS2-201ENST00000554071 1262 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TRMT13Q9NUP7 TNNI1-205ENST00000555948 580 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRMT13Q9NUP7 LOXL1-AS1-207ENST00000565689 735 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRMT13Q9NUP7 AC018761.2-201ENST00000585496 296 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRMT13Q9NUP7 STAT5A-208ENST00000587646 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRMT13Q9NUP7 MCEMP1-202ENST00000597445 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRMT13Q9NUP7 AL009176.1-201ENST00000607876 650 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TRMT13Q9NUP7 C1orf232-202ENST00000635463 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRMT13Q9NUP7 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRMT13Q9NUP7 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRMT13Q9NUP7 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRMT13Q9NUP7 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRMT13Q9NUP7 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRMT13Q9NUP7 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRMT13Q9NUP7 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRMT13Q9NUP7 SVOPL-203ENST00000421622 1653 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRMT13Q9NUP7 SERF1B-204ENST00000506542 1666 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRMT13Q9NUP7 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRMT13Q9NUP7 AC011498.7-201ENST00000624986 2027 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TRMT13Q9NUP7 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRMT13Q9NUP7 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRMT13Q9NUP7 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRMT13Q9NUP7 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRMT13Q9NUP7 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRMT13Q9NUP7 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRMT13Q9NUP7 ALG3-205ENST00000445626 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRMT13Q9NUP7 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRMT13Q9NUP7 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRMT13Q9NUP7 MYH16-204ENST00000452010 1599 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRMT13Q9NUP7 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRMT13Q9NUP7 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRMT13Q9NUP7 TNFSF11-201ENST00000239849 911 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRMT13Q9NUP7 ZNF226-201ENST00000300823 817 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRMT13Q9NUP7 HNRNPA1-201ENST00000330752 1294 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRMT13Q9NUP7 RGR-203ENST00000372092 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRMT13Q9NUP7 AL391839.2-201ENST00000412085 383 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRMT13Q9NUP7 NAA60-205ENST00000424546 1149 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRMT13Q9NUP7 EMP1-203ENST00000431267 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRMT13Q9NUP7 HORMAD2-AS1-202ENST00000432568 727 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRMT13Q9NUP7 AL356218.1-201ENST00000450864 353 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRMT13Q9NUP7 BPIFB5P-201ENST00000457066 1099 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TRMT13Q9NUP7 AC106047.2-201ENST00000511723 743 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TRMT13Q9NUP7 AC113391.2-201ENST00000512245 553 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRMT13Q9NUP7 TNFSF13B-206ENST00000542136 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRMT13Q9NUP7 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRMT13Q9NUP7 AL162632.1-201ENST00000546784 548 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRMT13Q9NUP7 SOCS2-AS1-204ENST00000551626 618 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRMT13Q9NUP7 ABHD17AP9-201ENST00000561925 548 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TRMT13Q9NUP7 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRMT13Q9NUP7 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRMT13Q9NUP7 CYP4F36P-201ENST00000589193 186 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TRMT13Q9NUP7 COQ4-204ENST00000608951 781 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRMT13Q9NUP7 ANKRD20A21P-201ENST00000611282 517 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRMT13Q9NUP7 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRMT13Q9NUP7 UBOX5-AS1-201ENST00000446537 1792 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRMT13Q9NUP7 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRMT13Q9NUP7 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRMT13Q9NUP7 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRMT13Q9NUP7 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRMT13Q9NUP7 CT55-201ENST00000276241 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRMT13Q9NUP7 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRMT13Q9NUP7 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRMT13Q9NUP7 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRMT13Q9NUP7 KRT8P43-201ENST00000406052 1458 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TRMT13Q9NUP7 EFHD1-207ENST00000611312 1490 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRMT13Q9NUP7 LINC00299-202ENST00000442956 2342 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRMT13Q9NUP7 GUCY1B2-205ENST00000532104 1912 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
TRMT13Q9NUP7 NBAT1-201ENST00000566912 1940 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
TRMT13Q9NUP7 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
TRMT13Q9NUP7 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
TRMT13Q9NUP7 IL18BP-205ENST00000393705 1549 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TRMT13Q9NUP7 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TRMT13Q9NUP7 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
TRMT13Q9NUP7 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TRMT13Q9NUP7 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TRMT13Q9NUP7 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRMT13Q9NUP7 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRMT13Q9NUP7 CDK11A-201ENST00000356200 2653 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
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