Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZL3

SMIM3, Small integral membrane protein 3, humanhuman

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Length 60 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM3Q9BZL3 TMEM130-201ENST00000339375 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
SMIM3Q9BZL3 TRIM3-203ENST00000525074 3044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
SMIM3Q9BZL3 MESD-201ENST00000261758 4264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
SMIM3Q9BZL3 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
SMIM3Q9BZL3 EXOC3-201ENST00000315013 2682 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
SMIM3Q9BZL3 SYNRG-229ENST00000621136 4841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
SMIM3Q9BZL3 GUCY1B3-204ENST00000505154 2316 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
SMIM3Q9BZL3 AC006001.3-201ENST00000449307 7092 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
SMIM3Q9BZL3 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC11.8□□□□□ -0.52
SMIM3Q9BZL3 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
SMIM3Q9BZL3 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
SMIM3Q9BZL3 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
SMIM3Q9BZL3 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
SMIM3Q9BZL3 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
SMIM3Q9BZL3 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
SMIM3Q9BZL3 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
SMIM3Q9BZL3 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
SMIM3Q9BZL3 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
SMIM3Q9BZL3 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
SMIM3Q9BZL3 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
SMIM3Q9BZL3 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
SMIM3Q9BZL3 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC11.8□□□□□ -0.52
SMIM3Q9BZL3 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
SMIM3Q9BZL3 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
SMIM3Q9BZL3 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
SMIM3Q9BZL3 PLAT-203ENST00000429089 2599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
SMIM3Q9BZL3 BCL2L13-214ENST00000543133 4975 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
SMIM3Q9BZL3 BCL2L13-217ENST00000618481 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
SMIM3Q9BZL3 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
SMIM3Q9BZL3 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
SMIM3Q9BZL3 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
SMIM3Q9BZL3 SPACA9-202ENST00000356311 2243 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
SMIM3Q9BZL3 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
SMIM3Q9BZL3 RGL4-202ENST00000401461 2420 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
SMIM3Q9BZL3 WDR5-201ENST00000358625 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
SMIM3Q9BZL3 ZNF747-201ENST00000252799 3936 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
SMIM3Q9BZL3 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
SMIM3Q9BZL3 GRM7-201ENST00000357716 4127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
SMIM3Q9BZL3 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
SMIM3Q9BZL3 PPT1-203ENST00000433473 2267 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
SMIM3Q9BZL3 ASS1-203ENST00000372393 1548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
SMIM3Q9BZL3 MCM2-201ENST00000265056 3622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
SMIM3Q9BZL3 GNG4-202ENST00000366598 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
SMIM3Q9BZL3 MARK2P9-201ENST00000430958 1727 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
SMIM3Q9BZL3 KCNMA1-241ENST00000638606 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
SMIM3Q9BZL3 KCNMA1-279ENST00000640182 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
SMIM3Q9BZL3 IRAK1BP1-201ENST00000369940 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
SMIM3Q9BZL3 ADAMTSL1-205ENST00000380548 8030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
SMIM3Q9BZL3 XIRP1-201ENST00000340369 6460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
SMIM3Q9BZL3 KCNJ10-201ENST00000368089 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
SMIM3Q9BZL3 FAM230C-201ENST00000623511 1970 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
SMIM3Q9BZL3 KCNIP3-202ENST00000360990 2798 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
SMIM3Q9BZL3 APOBR-202ENST00000564831 3792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
SMIM3Q9BZL3 BSDC1-201ENST00000341071 4599 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
SMIM3Q9BZL3 PPP4R3B-203ENST00000611717 5243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
SMIM3Q9BZL3 TMBIM1-202ENST00000396809 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
SMIM3Q9BZL3 AL133387.2-201ENST00000422661 2222 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
SMIM3Q9BZL3 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
SMIM3Q9BZL3 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
SMIM3Q9BZL3 ELK1-201ENST00000247161 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
SMIM3Q9BZL3 AP003969.2-201ENST00000623739 2275 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
SMIM3Q9BZL3 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
SMIM3Q9BZL3 STX3-207ENST00000633708 3111 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
SMIM3Q9BZL3 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
SMIM3Q9BZL3 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
SMIM3Q9BZL3 MOCS1-204ENST00000373188 3358 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
SMIM3Q9BZL3 PDCD6IPP2-206ENST00000566178 3351 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
SMIM3Q9BZL3 MECOM-206ENST00000464456 5732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
SMIM3Q9BZL3 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
SMIM3Q9BZL3 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
SMIM3Q9BZL3 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
SMIM3Q9BZL3 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
SMIM3Q9BZL3 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
SMIM3Q9BZL3 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
SMIM3Q9BZL3 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
SMIM3Q9BZL3 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
SMIM3Q9BZL3 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
SMIM3Q9BZL3 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC11.79□□□□□ -0.52
SMIM3Q9BZL3 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
SMIM3Q9BZL3 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
SMIM3Q9BZL3 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
SMIM3Q9BZL3 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
SMIM3Q9BZL3 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.79□□□□□ -0.52
SMIM3Q9BZL3 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
SMIM3Q9BZL3 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
SMIM3Q9BZL3 SORD2P-201ENST00000558556 1069 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
SMIM3Q9BZL3 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
SMIM3Q9BZL3 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
SMIM3Q9BZL3 C19orf12-208ENST00000614091 4489 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.79□□□□□ -0.52
SMIM3Q9BZL3 ERAL1-201ENST00000254928 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
SMIM3Q9BZL3 NOA1-201ENST00000264230 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
SMIM3Q9BZL3 SLC6A19-201ENST00000304460 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
SMIM3Q9BZL3 TLE3-203ENST00000451782 2356 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
SMIM3Q9BZL3 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
SMIM3Q9BZL3 DIRAS3-201ENST00000370981 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
SMIM3Q9BZL3 RAB42-201ENST00000373826 1950 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
SMIM3Q9BZL3 RP1-207ENST00000637698 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
SMIM3Q9BZL3 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
SMIM3Q9BZL3 HOTTIP-203ENST00000521028 3345 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
SMIM3Q9BZL3 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
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