Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZ76

CNTNAP3, Contactin-associated protein-like 3, humanhuman

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Length 1,288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTNAP3Q9BZ76 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CNTNAP3Q9BZ76 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CNTNAP3Q9BZ76 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CNTNAP3Q9BZ76 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CNTNAP3Q9BZ76 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CNTNAP3Q9BZ76 CRYL1-201ENST00000298248 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CNTNAP3Q9BZ76 IQCJ-201ENST00000397832 1460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CNTNAP3Q9BZ76 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CNTNAP3Q9BZ76 PTPN13-203ENST00000427191 8487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CNTNAP3Q9BZ76 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CNTNAP3Q9BZ76 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CNTNAP3Q9BZ76 RNF170-202ENST00000319073 1265 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CNTNAP3Q9BZ76 KRTAP2-3-201ENST00000391418 875 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CNTNAP3Q9BZ76 AC112721.1-201ENST00000409162 588 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CNTNAP3Q9BZ76 TISP43-202ENST00000409982 1039 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CNTNAP3Q9BZ76 NRADDP-201ENST00000437305 691 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
CNTNAP3Q9BZ76 LINC01823-204ENST00000438722 794 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CNTNAP3Q9BZ76 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CNTNAP3Q9BZ76 ZMIZ1-AS1-202ENST00000440151 814 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CNTNAP3Q9BZ76 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CNTNAP3Q9BZ76 SNRPD2P2-201ENST00000473818 333 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
CNTNAP3Q9BZ76 C1orf198-207ENST00000523410 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CNTNAP3Q9BZ76 TATDN3-208ENST00000526997 794 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CNTNAP3Q9BZ76 AC024475.1-201ENST00000528480 605 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CNTNAP3Q9BZ76 TATDN3-213ENST00000531963 1291 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CNTNAP3Q9BZ76 TMEM123-208ENST00000532161 743 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CNTNAP3Q9BZ76 ANAPC15-204ENST00000535234 848 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CNTNAP3Q9BZ76 F11R-204ENST00000537746 1245 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CNTNAP3Q9BZ76 LINC02281-201ENST00000549013 375 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CNTNAP3Q9BZ76 C17orf62-234ENST00000584503 584 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CNTNAP3Q9BZ76 AP001462.1-201ENST00000594089 452 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
CNTNAP3Q9BZ76 AC112220.4-201ENST00000604982 1263 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
CNTNAP3Q9BZ76 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CNTNAP3Q9BZ76 LUC7L3-223ENST00000625349 408 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CNTNAP3Q9BZ76 ADAMTS9-AS1-216ENST00000626280 882 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CNTNAP3Q9BZ76 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CNTNAP3Q9BZ76 LGALS12-202ENST00000340246 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CNTNAP3Q9BZ76 PTPRO-201ENST00000281171 5301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CNTNAP3Q9BZ76 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CNTNAP3Q9BZ76 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CNTNAP3Q9BZ76 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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CNTNAP3Q9BZ76 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
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CNTNAP3Q9BZ76 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CNTNAP3Q9BZ76 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CNTNAP3Q9BZ76 OSMR-201ENST00000274276 5539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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CNTNAP3Q9BZ76 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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CNTNAP3Q9BZ76 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
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CNTNAP3Q9BZ76 IQCF4-202ENST00000422896 745 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
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CNTNAP3Q9BZ76 TREX1-203ENST00000456089 629 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CNTNAP3Q9BZ76 AC108462.1-201ENST00000457467 850 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CNTNAP3Q9BZ76 AC025171.3-201ENST00000509036 472 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CNTNAP3Q9BZ76 RPS23-207ENST00000511844 530 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CNTNAP3Q9BZ76 GABARAPL1-213ENST00000544284 531 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CNTNAP3Q9BZ76 AC010183.1-201ENST00000552413 559 ntTSL 4 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CNTNAP3Q9BZ76 FOXN3-AS2-201ENST00000554071 1262 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
CNTNAP3Q9BZ76 TSHR-205ENST00000554263 1184 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CNTNAP3Q9BZ76 MYMX-201ENST00000573382 817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CNTNAP3Q9BZ76 NAT9-204ENST00000578822 839 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CNTNAP3Q9BZ76 FAAP24-203ENST00000589646 836 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CNTNAP3Q9BZ76 AL591424.3-201ENST00000614278 872 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
CNTNAP3Q9BZ76 AC108359.1-201ENST00000616451 1211 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
CNTNAP3Q9BZ76 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CNTNAP3Q9BZ76 LRTM1-201ENST00000273286 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CNTNAP3Q9BZ76 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CNTNAP3Q9BZ76 MKRN2-202ENST00000411987 1436 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CNTNAP3Q9BZ76 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CNTNAP3Q9BZ76 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CNTNAP3Q9BZ76 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CNTNAP3Q9BZ76 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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