Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV7

BCO2, Beta,beta-carotene 9',10'-oxygenase, humanhuman

Predictions only

Length 579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCO2Q9BYV7 ELOF1-202ENST00000586120 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
BCO2Q9BYV7 AC011466.3-201ENST00000596563 852 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
BCO2Q9BYV7 AC103810.10-201ENST00000606504 343 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
BCO2Q9BYV7 CR589904.1-202ENST00000611154 660 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
BCO2Q9BYV7 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
BCO2Q9BYV7 AC011474.4-201ENST00000623523 2076 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
BCO2Q9BYV7 TBL3-208ENST00000615855 2472 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
BCO2Q9BYV7 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
BCO2Q9BYV7 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
BCO2Q9BYV7 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
BCO2Q9BYV7 CSAD-203ENST00000379846 1962 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
BCO2Q9BYV7 CPNE2-204ENST00000565874 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
BCO2Q9BYV7 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
BCO2Q9BYV7 MFAP4-202ENST00000395592 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
BCO2Q9BYV7 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
BCO2Q9BYV7 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
BCO2Q9BYV7 ARHGAP25-216ENST00000497079 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
BCO2Q9BYV7 POTEM-201ENST00000547889 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
BCO2Q9BYV7 MLXIPL-201ENST00000313375 3278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
BCO2Q9BYV7 MLXIPL-206ENST00000434326 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
BCO2Q9BYV7 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
BCO2Q9BYV7 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
BCO2Q9BYV7 AC015909.3-201ENST00000572855 1794 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
BCO2Q9BYV7 CDIP1-205ENST00000563332 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
BCO2Q9BYV7 PPIL3-201ENST00000286175 1370 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
BCO2Q9BYV7 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
BCO2Q9BYV7 SERPING1-201ENST00000278407 2002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
BCO2Q9BYV7 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
BCO2Q9BYV7 DNASE1L1-206ENST00000393638 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
BCO2Q9BYV7 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
BCO2Q9BYV7 RPGRIP1-210ENST00000556336 2955 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
BCO2Q9BYV7 OXNAD1-202ENST00000435829 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
BCO2Q9BYV7 HSD17B4-215ENST00000510025 2589 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
BCO2Q9BYV7 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
BCO2Q9BYV7 CCL19-201ENST00000311925 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
BCO2Q9BYV7 PRIMA1-201ENST00000316227 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
BCO2Q9BYV7 TOMM7-201ENST00000358435 778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
BCO2Q9BYV7 ESD-202ENST00000378720 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
BCO2Q9BYV7 LINC01237-201ENST00000415434 573 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
BCO2Q9BYV7 HMGA1P1-201ENST00000415560 1062 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
BCO2Q9BYV7 RPL7P35-201ENST00000446943 740 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
BCO2Q9BYV7 AC073150.1-201ENST00000450406 1084 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
BCO2Q9BYV7 DUX4L50-201ENST00000455245 715 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
BCO2Q9BYV7 LINC02380-201ENST00000510956 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
BCO2Q9BYV7 AC135983.1-201ENST00000562108 1097 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
BCO2Q9BYV7 LINC00511-205ENST00000578206 908 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
BCO2Q9BYV7 AC087045.2-201ENST00000606279 1003 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
BCO2Q9BYV7 AC092171.5-201ENST00000608012 942 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
BCO2Q9BYV7 AC051619.9-201ENST00000623237 597 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
BCO2Q9BYV7 PEX5L-211ENST00000472994 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
BCO2Q9BYV7 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
BCO2Q9BYV7 CHIT1-201ENST00000255427 1598 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
BCO2Q9BYV7 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
BCO2Q9BYV7 GRHL1-202ENST00000405379 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
BCO2Q9BYV7 ANKRD36BP2-202ENST00000421951 1899 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
BCO2Q9BYV7 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
BCO2Q9BYV7 SERPINF1-201ENST00000254722 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
BCO2Q9BYV7 AL589669.1-201ENST00000639829 1506 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
BCO2Q9BYV7 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
BCO2Q9BYV7 PGLYRP4-202ENST00000368739 2116 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
BCO2Q9BYV7 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
BCO2Q9BYV7 USP39-207ENST00000450066 2086 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
BCO2Q9BYV7 UBL4B-201ENST00000334179 1478 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
BCO2Q9BYV7 ZDHHC4-204ENST00000396709 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
BCO2Q9BYV7 RHD-209ENST00000568195 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
BCO2Q9BYV7 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
BCO2Q9BYV7 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
BCO2Q9BYV7 GAL3ST4-202ENST00000411994 1404 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
BCO2Q9BYV7 TMEM176B-204ENST00000447204 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
BCO2Q9BYV7 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
BCO2Q9BYV7 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
BCO2Q9BYV7 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
BCO2Q9BYV7 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
BCO2Q9BYV7 ARHGEF1-202ENST00000347545 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
BCO2Q9BYV7 DPEP2-202ENST00000393847 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
BCO2Q9BYV7 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
BCO2Q9BYV7 RHD-203ENST00000357542 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
BCO2Q9BYV7 TOB1-AS1-201ENST00000416263 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
BCO2Q9BYV7 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
BCO2Q9BYV7 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
BCO2Q9BYV7 ORC6-201ENST00000219097 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
BCO2Q9BYV7 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
BCO2Q9BYV7 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
BCO2Q9BYV7 DDO-202ENST00000368924 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
BCO2Q9BYV7 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
BCO2Q9BYV7 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
BCO2Q9BYV7 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
BCO2Q9BYV7 PLCXD2-201ENST00000393934 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
BCO2Q9BYV7 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
BCO2Q9BYV7 RPP25L-202ENST00000378959 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
BCO2Q9BYV7 AL627231.1-201ENST00000394467 1125 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
BCO2Q9BYV7 HDDC2-202ENST00000398153 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
BCO2Q9BYV7 TMEM216-202ENST00000398979 908 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
BCO2Q9BYV7 HPGD-203ENST00000422112 805 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
BCO2Q9BYV7 PGAP2-208ENST00000464229 863 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
BCO2Q9BYV7 AC133961.1-201ENST00000503085 762 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
BCO2Q9BYV7 HOXA10-AS-202ENST00000519935 1161 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
BCO2Q9BYV7 KRT8P1-201ENST00000557533 1207 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
BCO2Q9BYV7 AC005901.1-201ENST00000592766 552 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
BCO2Q9BYV7 EXOSC5-204ENST00000596905 826 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.1 ms