Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV6

TRIM55, Tripartite motif-containing protein 55, humanhuman

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Length 548 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM55Q9BYV6 KCNJ9-201ENST00000368088 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRIM55Q9BYV6 C11orf87-201ENST00000327419 5884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRIM55Q9BYV6 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRIM55Q9BYV6 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRIM55Q9BYV6 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRIM55Q9BYV6 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRIM55Q9BYV6 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRIM55Q9BYV6 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
TRIM55Q9BYV6 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRIM55Q9BYV6 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
TRIM55Q9BYV6 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRIM55Q9BYV6 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
TRIM55Q9BYV6 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
TRIM55Q9BYV6 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRIM55Q9BYV6 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRIM55Q9BYV6 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRIM55Q9BYV6 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRIM55Q9BYV6 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRIM55Q9BYV6 AC008125.1-201ENST00000548488 1538 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRIM55Q9BYV6 DDC-AS1-201ENST00000454521 1776 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRIM55Q9BYV6 MKL1-201ENST00000355630 4496 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRIM55Q9BYV6 AC011498.7-201ENST00000624986 2027 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
TRIM55Q9BYV6 ARMC5-201ENST00000268314 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRIM55Q9BYV6 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRIM55Q9BYV6 GPR4-201ENST00000323040 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRIM55Q9BYV6 ZBTB47-201ENST00000232974 3781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRIM55Q9BYV6 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRIM55Q9BYV6 ELP4-201ENST00000350638 1907 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRIM55Q9BYV6 GCM2-201ENST00000379491 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRIM55Q9BYV6 ADAM33-207ENST00000619289 3195 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRIM55Q9BYV6 AP1B1-201ENST00000317368 3903 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRIM55Q9BYV6 WDFY1-201ENST00000233055 4660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRIM55Q9BYV6 MIRLET7BHG-201ENST00000360737 4560 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRIM55Q9BYV6 SPATA20-227ENST00000634597 2587 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRIM55Q9BYV6 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRIM55Q9BYV6 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRIM55Q9BYV6 FAM198B-201ENST00000296530 4985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRIM55Q9BYV6 HSPH1-202ENST00000380405 3480 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRIM55Q9BYV6 CPNE5-201ENST00000244751 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRIM55Q9BYV6 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIM55Q9BYV6 HPD-204ENST00000543163 1709 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIM55Q9BYV6 TRAPPC10-201ENST00000291574 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIM55Q9BYV6 MTA3-202ENST00000405592 5832 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIM55Q9BYV6 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIM55Q9BYV6 WDR24-201ENST00000248142 2763 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIM55Q9BYV6 NFKB1-201ENST00000226574 4085 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIM55Q9BYV6 C7orf65-201ENST00000408988 2911 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIM55Q9BYV6 TINF2-215ENST00000626689 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIM55Q9BYV6 ABCG8-201ENST00000272286 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIM55Q9BYV6 TRIT1-214ENST00000537440 2026 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIM55Q9BYV6 NFATC1-205ENST00000427363 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIM55Q9BYV6 UBE3A-209ENST00000625778 3217 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIM55Q9BYV6 VASH2-202ENST00000366964 2960 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIM55Q9BYV6 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIM55Q9BYV6 SMARCA4-202ENST00000413806 5512 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIM55Q9BYV6 IKBKG-208ENST00000611176 1654 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIM55Q9BYV6 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIM55Q9BYV6 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIM55Q9BYV6 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIM55Q9BYV6 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIM55Q9BYV6 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIM55Q9BYV6 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIM55Q9BYV6 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIM55Q9BYV6 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIM55Q9BYV6 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIM55Q9BYV6 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIM55Q9BYV6 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIM55Q9BYV6 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIM55Q9BYV6 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIM55Q9BYV6 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIM55Q9BYV6 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIM55Q9BYV6 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIM55Q9BYV6 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIM55Q9BYV6 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIM55Q9BYV6 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIM55Q9BYV6 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIM55Q9BYV6 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIM55Q9BYV6 CBX6-201ENST00000216083 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIM55Q9BYV6 POTEM-201ENST00000547889 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIM55Q9BYV6 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIM55Q9BYV6 TSN-212ENST00000536142 3328 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIM55Q9BYV6 SPRY1-208ENST00000622283 2352 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIM55Q9BYV6 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIM55Q9BYV6 EMC10-201ENST00000334976 9446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIM55Q9BYV6 ABCC10-204ENST00000372530 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIM55Q9BYV6 SLC16A1-201ENST00000369626 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIM55Q9BYV6 EMILIN1-201ENST00000380320 3943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIM55Q9BYV6 JUN-201ENST00000371222 3540 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIM55Q9BYV6 PDE1C-205ENST00000396191 2952 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIM55Q9BYV6 SLC52A1-203ENST00000512825 2989 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIM55Q9BYV6 ABLIM2-213ENST00000514025 2974 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIM55Q9BYV6 BCKDHB-201ENST00000320393 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIM55Q9BYV6 SMOC2-202ENST00000356284 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIM55Q9BYV6 INMT-201ENST00000013222 2559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIM55Q9BYV6 TMEM130-203ENST00000416379 2881 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIM55Q9BYV6 USP2-201ENST00000260187 3732 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIM55Q9BYV6 CD99L2-208ENST00000613030 3742 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIM55Q9BYV6 ABCC6-201ENST00000205557 5747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIM55Q9BYV6 PBX3-201ENST00000342287 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRIM55Q9BYV6 COL20A1-203ENST00000422202 8097 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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