Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSH3

NICN1, Nicolin-1, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NICN1Q9BSH3 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
NICN1Q9BSH3 PRKAR2A-202ENST00000296446 3318 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
NICN1Q9BSH3 SLC26A6-213ENST00000455886 2460 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
NICN1Q9BSH3 REXO1L1P-201ENST00000379010 6598 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
NICN1Q9BSH3 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC12.4□□□□□ -0.42
NICN1Q9BSH3 STIM1-201ENST00000300737 4038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
NICN1Q9BSH3 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
NICN1Q9BSH3 GRIN1-202ENST00000371546 4114 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
NICN1Q9BSH3 FAM122B-201ENST00000298090 2706 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
NICN1Q9BSH3 ATP6V0A4-202ENST00000353492 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
NICN1Q9BSH3 LMAN2L-202ENST00000377079 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
NICN1Q9BSH3 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
NICN1Q9BSH3 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
NICN1Q9BSH3 MAP2K4-201ENST00000353533 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
NICN1Q9BSH3 TMEM25-201ENST00000313236 2409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
NICN1Q9BSH3 RTFDC1-201ENST00000023939 1745 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
NICN1Q9BSH3 GFPT2-201ENST00000253778 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
NICN1Q9BSH3 AL445209.1-201ENST00000607269 3491 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
NICN1Q9BSH3 GSTM4-204ENST00000369836 1412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
NICN1Q9BSH3 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
NICN1Q9BSH3 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
NICN1Q9BSH3 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
NICN1Q9BSH3 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
NICN1Q9BSH3 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
NICN1Q9BSH3 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
NICN1Q9BSH3 SNRPC-202ENST00000374017 1054 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
NICN1Q9BSH3 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
NICN1Q9BSH3 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
NICN1Q9BSH3 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
NICN1Q9BSH3 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
NICN1Q9BSH3 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
NICN1Q9BSH3 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
NICN1Q9BSH3 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
NICN1Q9BSH3 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
NICN1Q9BSH3 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
NICN1Q9BSH3 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
NICN1Q9BSH3 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
NICN1Q9BSH3 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
NICN1Q9BSH3 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC12.4□□□□□ -0.42
NICN1Q9BSH3 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
NICN1Q9BSH3 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
NICN1Q9BSH3 SEC14L3-204ENST00000403066 2474 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
NICN1Q9BSH3 PSAP-202ENST00000394936 2872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
NICN1Q9BSH3 CIPC-201ENST00000361786 4486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
NICN1Q9BSH3 MKL1-203ENST00000402042 4343 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
NICN1Q9BSH3 SLC16A1-201ENST00000369626 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
NICN1Q9BSH3 B3GAT1-202ENST00000392580 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
NICN1Q9BSH3 ABAT-215ENST00000569156 1911 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
NICN1Q9BSH3 CYP51A1-AS1-201ENST00000453068 2957 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
NICN1Q9BSH3 PTK7-205ENST00000352931 4023 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
NICN1Q9BSH3 ARMC5-201ENST00000268314 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
NICN1Q9BSH3 KLHL34-201ENST00000379499 3641 ntAPPRIS P1 BASIC12.4□□□□□ -0.42
NICN1Q9BSH3 PLIN3-207ENST00000592528 2154 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
NICN1Q9BSH3 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
NICN1Q9BSH3 AC004899.2-201ENST00000622993 3860 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
NICN1Q9BSH3 LINC00910-206ENST00000592135 2438 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
NICN1Q9BSH3 BAX-201ENST00000293288 1358 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
NICN1Q9BSH3 TBKBP1-201ENST00000361722 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
NICN1Q9BSH3 NRG1-201ENST00000287842 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
NICN1Q9BSH3 FAM224A-201ENST00000419557 2031 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
NICN1Q9BSH3 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
NICN1Q9BSH3 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
NICN1Q9BSH3 C16orf82-201ENST00000418886 2268 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
NICN1Q9BSH3 SLC6A6P1-201ENST00000413933 1850 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
NICN1Q9BSH3 DDO-202ENST00000368924 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
NICN1Q9BSH3 GTPBP4-202ENST00000360803 5075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
NICN1Q9BSH3 AGAP12P-201ENST00000585227 2359 ntBASIC12.4□□□□□ -0.43
NICN1Q9BSH3 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC12.4□□□□□ -0.43
NICN1Q9BSH3 APOF-201ENST00000398189 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
NICN1Q9BSH3 UQCC1-204ENST00000374384 2201 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
NICN1Q9BSH3 C19orf57-204ENST00000586783 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
NICN1Q9BSH3 ANKMY1-206ENST00000401804 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
NICN1Q9BSH3 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
NICN1Q9BSH3 C14orf39-201ENST00000321731 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
NICN1Q9BSH3 TMCC2-201ENST00000329800 2818 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
NICN1Q9BSH3 ZMYM3-207ENST00000373998 6067 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
NICN1Q9BSH3 ENO2-201ENST00000229277 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
NICN1Q9BSH3 C22orf34-204ENST00000414287 2197 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
NICN1Q9BSH3 SIX4-201ENST00000216513 6285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
NICN1Q9BSH3 MCRS1-201ENST00000343810 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
NICN1Q9BSH3 PNKD-203ENST00000273077 3021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
NICN1Q9BSH3 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
NICN1Q9BSH3 TECPR1-204ENST00000447648 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
NICN1Q9BSH3 AC134312.1-201ENST00000378417 3468 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
NICN1Q9BSH3 AC083964.2-201ENST00000623988 2396 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
NICN1Q9BSH3 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
NICN1Q9BSH3 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
NICN1Q9BSH3 BMF-201ENST00000354670 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
NICN1Q9BSH3 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
NICN1Q9BSH3 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
NICN1Q9BSH3 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
NICN1Q9BSH3 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
NICN1Q9BSH3 AL161932.2-201ENST00000435436 679 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
NICN1Q9BSH3 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
NICN1Q9BSH3 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
NICN1Q9BSH3 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
NICN1Q9BSH3 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
NICN1Q9BSH3 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
NICN1Q9BSH3 AC027237.1-201ENST00000560942 655 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
NICN1Q9BSH3 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
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