Protein–RNA interactions for Protein: Q92995

USP13, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 863 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP13Q92995 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
USP13Q92995 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
USP13Q92995 ZKSCAN7-201ENST00000273320 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
USP13Q92995 SIDT1-201ENST00000264852 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
USP13Q92995 UBR2-201ENST00000372899 7857 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
USP13Q92995 UBR2-202ENST00000372901 7857 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
USP13Q92995 SPAG9-201ENST00000262013 8273 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
USP13Q92995 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
USP13Q92995 EDIL3-201ENST00000296591 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
USP13Q92995 ATXN2L-204ENST00000382686 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
USP13Q92995 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
USP13Q92995 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
USP13Q92995 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
USP13Q92995 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
USP13Q92995 ATXN7-201ENST00000295900 7224 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
USP13Q92995 BNIP1-201ENST00000231668 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
USP13Q92995 DLK1-201ENST00000331224 1324 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
USP13Q92995 HIGD1A-202ENST00000418900 1322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
USP13Q92995 PPARGC1B-203ENST00000394320 4803 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
USP13Q92995 DDX21-202ENST00000620315 4829 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
USP13Q92995 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
USP13Q92995 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
USP13Q92995 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
USP13Q92995 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
USP13Q92995 AC015712.6-201ENST00000431060 5068 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
USP13Q92995 OXNAD1-202ENST00000435829 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
USP13Q92995 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
USP13Q92995 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
USP13Q92995 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
USP13Q92995 NRDC-201ENST00000352171 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
USP13Q92995 PLCB3-202ENST00000325234 3946 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
USP13Q92995 SEZ6-201ENST00000317338 4471 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
USP13Q92995 PDE6G-201ENST00000331056 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
USP13Q92995 MBP-201ENST00000354542 575 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
USP13Q92995 CSTF3-202ENST00000431742 715 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
USP13Q92995 ARMCX3-AS1-201ENST00000454228 490 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
USP13Q92995 TMEM218-205ENST00000527271 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
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USP13Q92995 DYRK1B-208ENST00000601972 772 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
USP13Q92995 BX537318.1-201ENST00000608290 1207 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
USP13Q92995 CUTA-215ENST00000611509 1199 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
USP13Q92995 SLC12A5-216ENST00000626701 617 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
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USP13Q92995 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
USP13Q92995 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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USP13Q92995 RPRD1A-202ENST00000399022 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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USP13Q92995 ZC3H4-201ENST00000253048 6119 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
USP13Q92995 STARD8-202ENST00000374597 4820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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USP13Q92995 SMAD2-202ENST00000356825 10445 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
USP13Q92995 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
USP13Q92995 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
USP13Q92995 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
USP13Q92995 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
USP13Q92995 RNA5SP359-201ENST00000364838 113 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
USP13Q92995 Metazoa_SRP.6-201ENST00000366384 298 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
USP13Q92995 FBXO44-203ENST00000376760 822 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
USP13Q92995 TPT1-AS1-203ENST00000412946 744 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
USP13Q92995 AC008267.1-201ENST00000474858 1069 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
USP13Q92995 IQSEC3P1-201ENST00000538799 536 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
USP13Q92995 RN7SL555P-201ENST00000584742 339 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
USP13Q92995 PIN1-207ENST00000588695 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
USP13Q92995 AC103810.10-201ENST00000606504 343 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
USP13Q92995 TOMM7-207ENST00000621567 241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
USP13Q92995 AL805961.1-201ENST00000642026 753 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
USP13Q92995 KIFC3-207ENST00000543930 3018 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
USP13Q92995 GABPA-202ENST00000400075 4814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
USP13Q92995 AC092978.1-201ENST00000474979 1309 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
USP13Q92995 AC092978.1-202ENST00000637590 1327 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
USP13Q92995 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
USP13Q92995 LINC00513-201ENST00000447430 1616 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
USP13Q92995 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
USP13Q92995 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
USP13Q92995 JARID2-202ENST00000397311 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
USP13Q92995 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
USP13Q92995 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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