Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUD4

CCDC12, Coiled-coil domain-containing protein 12, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC12Q8WUD4 COG5-202ENST00000347053 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC12Q8WUD4 LINC02396-202ENST00000550636 2324 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC12Q8WUD4 KCNN3-202ENST00000358505 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC12Q8WUD4 FAM98B-202ENST00000397609 4388 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC12Q8WUD4 CORO7-222ENST00000574025 2826 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC12Q8WUD4 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC12Q8WUD4 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC12Q8WUD4 DUSP13-202ENST00000372700 781 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC12Q8WUD4 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC12Q8WUD4 AC093484.1-201ENST00000441875 477 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC12Q8WUD4 DUSP13-206ENST00000472493 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC12Q8WUD4 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC12Q8WUD4 AC125604.1-201ENST00000496255 707 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC12Q8WUD4 PRSS30P-205ENST00000506153 699 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC12Q8WUD4 AP005264.1-201ENST00000586226 733 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC12Q8WUD4 MEF2C-227ENST00000626391 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC12Q8WUD4 MEF2C-231ENST00000628656 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC12Q8WUD4 DDX5-235ENST00000630471 473 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC12Q8WUD4 AC092299.1-201ENST00000632679 757 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC12Q8WUD4 RUNX1T1-251ENST00000615601 7372 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC12Q8WUD4 LINC00882-204ENST00000484698 2718 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC12Q8WUD4 PRIMPOL-211ENST00000515774 2007 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC12Q8WUD4 CDK17-201ENST00000261211 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC12Q8WUD4 PBXIP1-202ENST00000368463 3212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC12Q8WUD4 TMPRSS2-202ENST00000398585 3240 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC12Q8WUD4 TUBB8P4-201ENST00000511806 1324 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC12Q8WUD4 STK33-203ENST00000396672 2558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC12Q8WUD4 PCBP2-215ENST00000549863 1619 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC12Q8WUD4 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC12Q8WUD4 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC12Q8WUD4 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC12Q8WUD4 POM121-202ENST00000395270 7011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC12Q8WUD4 PITPNM2-201ENST00000280562 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC12Q8WUD4 ZNF34-201ENST00000343459 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC12Q8WUD4 ZNF34-202ENST00000429371 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC12Q8WUD4 ACSM2A-202ENST00000396104 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC12Q8WUD4 PLXNB1-204ENST00000456774 5859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC12Q8WUD4 SLC2A11-223ENST00000611880 3264 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC12Q8WUD4 DAAM2-201ENST00000274867 6194 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC12Q8WUD4 SPPL3-201ENST00000353487 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC12Q8WUD4 ADAM15-206ENST00000368412 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC12Q8WUD4 SSTR2-201ENST00000357585 7683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC12Q8WUD4 AC005899.8-201ENST00000625127 3153 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC12Q8WUD4 PAK1IP1-201ENST00000379568 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC12Q8WUD4 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC12Q8WUD4 NUCB1-201ENST00000405315 2668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC12Q8WUD4 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC12Q8WUD4 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC12Q8WUD4 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC12Q8WUD4 RCC2P8-201ENST00000502779 1035 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC12Q8WUD4 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC12Q8WUD4 DHPS-207ENST00000594424 1172 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC12Q8WUD4 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC12Q8WUD4 AC100757.4-201ENST00000626934 759 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC12Q8WUD4 ZNF541-203ENST00000391901 4580 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC12Q8WUD4 NCBP2-206ENST00000447325 2216 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC12Q8WUD4 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC12Q8WUD4 MAP3K12-205ENST00000547488 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC12Q8WUD4 ELAC2-201ENST00000338034 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC12Q8WUD4 FBXL16-201ENST00000324361 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC12Q8WUD4 TMEM63C-201ENST00000298351 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC12Q8WUD4 GAP43-201ENST00000305124 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC12Q8WUD4 ZBED1-203ENST00000381223 4510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC12Q8WUD4 C12orf73-201ENST00000378090 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC12Q8WUD4 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC12Q8WUD4 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC12Q8WUD4 GCFC2-211ENST00000541687 4318 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC12Q8WUD4 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC12Q8WUD4 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC12Q8WUD4 PELP1-212ENST00000574876 3465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC12Q8WUD4 DLGAP1-204ENST00000400149 5203 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC12Q8WUD4 CDH20-202ENST00000536675 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC12Q8WUD4 RAB11FIP1-201ENST00000287263 6253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC12Q8WUD4 TMEM212-201ENST00000334567 1881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC12Q8WUD4 NMNAT3-202ENST00000339837 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC12Q8WUD4 PHF14-201ENST00000403050 4276 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC12Q8WUD4 GABRG3-208ENST00000615808 10768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC12Q8WUD4 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC12Q8WUD4 ITGA6-202ENST00000409080 5306 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC12Q8WUD4 MBD1-201ENST00000269468 3259 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC12Q8WUD4 ZW10-201ENST00000200135 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC12Q8WUD4 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC12Q8WUD4 AC005252.3-201ENST00000623855 2258 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC12Q8WUD4 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC12Q8WUD4 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC12Q8WUD4 LINC01250-201ENST00000457478 2344 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC12Q8WUD4 IKBKB-217ENST00000520810 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC12Q8WUD4 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC12Q8WUD4 MAP2K3-201ENST00000316920 1246 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC12Q8WUD4 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC12Q8WUD4 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC12Q8WUD4 NRM-202ENST00000376420 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC12Q8WUD4 LCMT1-202ENST00000380966 989 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC12Q8WUD4 USP17L6P-201ENST00000382470 1197 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC12Q8WUD4 FOLR1-202ENST00000393676 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC12Q8WUD4 AL139412.1-202ENST00000452465 675 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC12Q8WUD4 KLK11-204ENST00000453757 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC12Q8WUD4 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC12Q8WUD4 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC12Q8WUD4 AC009065.3-201ENST00000562027 627 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms