Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVU3

HERC6, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC6, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC6Q8IVU3 IL17B-201ENST00000261796 696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HERC6Q8IVU3 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HERC6Q8IVU3 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HERC6Q8IVU3 RNVU1-8-201ENST00000364272 125 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
HERC6Q8IVU3 AIF1L-205ENST00000372301 671 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HERC6Q8IVU3 CFAP36-203ENST00000403007 759 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HERC6Q8IVU3 CCL24-202ENST00000416943 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HERC6Q8IVU3 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HERC6Q8IVU3 FTCDNL1-203ENST00000420922 772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HERC6Q8IVU3 AL158166.1-201ENST00000433110 371 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HERC6Q8IVU3 AC063952.3-201ENST00000467756 308 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
HERC6Q8IVU3 RN7SL564P-201ENST00000496309 250 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
HERC6Q8IVU3 LINC02063-201ENST00000503415 566 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HERC6Q8IVU3 AC095040.1-201ENST00000513286 675 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
HERC6Q8IVU3 GSTZ1-210ENST00000554279 795 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HERC6Q8IVU3 AL132801.1-201ENST00000559675 567 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HERC6Q8IVU3 GOLGA2P7-209ENST00000560408 745 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
HERC6Q8IVU3 AC130456.3-201ENST00000561762 633 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HERC6Q8IVU3 BLACE-202ENST00000616210 540 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HERC6Q8IVU3 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HERC6Q8IVU3 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HERC6Q8IVU3 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HERC6Q8IVU3 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HERC6Q8IVU3 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HERC6Q8IVU3 MYH16-204ENST00000452010 1599 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HERC6Q8IVU3 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HERC6Q8IVU3 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HERC6Q8IVU3 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HERC6Q8IVU3 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HERC6Q8IVU3 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HERC6Q8IVU3 LACTB2-201ENST00000276590 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HERC6Q8IVU3 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HERC6Q8IVU3 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HERC6Q8IVU3 LILRA2-203ENST00000391737 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HERC6Q8IVU3 MRM2-201ENST00000242257 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HERC6Q8IVU3 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HERC6Q8IVU3 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HERC6Q8IVU3 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HERC6Q8IVU3 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HERC6Q8IVU3 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HERC6Q8IVU3 CST5-201ENST00000304710 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HERC6Q8IVU3 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HERC6Q8IVU3 OR2V1-201ENST00000329365 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HERC6Q8IVU3 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HERC6Q8IVU3 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HERC6Q8IVU3 MRPL55-205ENST00000366731 1423 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HERC6Q8IVU3 CACNG7-202ENST00000391766 631 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HERC6Q8IVU3 MIR1301-201ENST00000408518 82 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
HERC6Q8IVU3 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HERC6Q8IVU3 NAA60-205ENST00000424546 1149 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HERC6Q8IVU3 KRT18P46-201ENST00000435568 1279 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
HERC6Q8IVU3 TIMM17B-204ENST00000465150 964 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HERC6Q8IVU3 AC026470.1-201ENST00000478038 846 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
HERC6Q8IVU3 C3orf38-204ENST00000486971 1259 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HERC6Q8IVU3 RN7SL767P-201ENST00000493013 295 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
HERC6Q8IVU3 RAMP3-203ENST00000496212 543 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HERC6Q8IVU3 LINC02228-201ENST00000507600 534 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HERC6Q8IVU3 USB1-205ENST00000561743 1135 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HERC6Q8IVU3 AC009163.3-201ENST00000563554 852 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HERC6Q8IVU3 NDUFB10P1-201ENST00000567319 521 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
HERC6Q8IVU3 RPS5-204ENST00000598098 536 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HERC6Q8IVU3 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HERC6Q8IVU3 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HERC6Q8IVU3 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HERC6Q8IVU3 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HERC6Q8IVU3 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HERC6Q8IVU3 MRPS10-201ENST00000053468 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HERC6Q8IVU3 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HERC6Q8IVU3 MS4A15-201ENST00000337911 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HERC6Q8IVU3 ZNF436-AS1-201ENST00000335648 2547 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
HERC6Q8IVU3 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HERC6Q8IVU3 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HERC6Q8IVU3 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HERC6Q8IVU3 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HERC6Q8IVU3 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HERC6Q8IVU3 SRPX-205ENST00000538295 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HERC6Q8IVU3 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HERC6Q8IVU3 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HERC6Q8IVU3 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HERC6Q8IVU3 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HERC6Q8IVU3 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
HERC6Q8IVU3 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HERC6Q8IVU3 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
HERC6Q8IVU3 ZNF174-201ENST00000268655 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HERC6Q8IVU3 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HERC6Q8IVU3 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HERC6Q8IVU3 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HERC6Q8IVU3 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HERC6Q8IVU3 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HERC6Q8IVU3 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HERC6Q8IVU3 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HERC6Q8IVU3 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HERC6Q8IVU3 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HERC6Q8IVU3 SNRPC-201ENST00000244520 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HERC6Q8IVU3 CSAG1-203ENST00000370291 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HERC6Q8IVU3 APOA1-203ENST00000375320 940 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HERC6Q8IVU3 BAX-205ENST00000391871 687 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HERC6Q8IVU3 LINC01022-201ENST00000415652 394 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HERC6Q8IVU3 RPS27L-203ENST00000439025 970 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HERC6Q8IVU3 LINC02435-201ENST00000508291 584 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
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