Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2C8

MED27, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 27, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED27Q6P2C8 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
MED27Q6P2C8 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
MED27Q6P2C8 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
MED27Q6P2C8 PRSS30P-205ENST00000506153 699 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
MED27Q6P2C8 UCHL1-207ENST00000508768 827 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
MED27Q6P2C8 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
MED27Q6P2C8 PGAM1P5-201ENST00000548011 764 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
MED27Q6P2C8 AC140658.4-201ENST00000561990 352 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
MED27Q6P2C8 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
MED27Q6P2C8 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
MED27Q6P2C8 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
MED27Q6P2C8 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
MED27Q6P2C8 AC005324.6-201ENST00000587972 613 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
MED27Q6P2C8 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
MED27Q6P2C8 AP000346.4-201ENST00000614827 381 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
MED27Q6P2C8 BAP1-211ENST00000615113 489 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
MED27Q6P2C8 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
MED27Q6P2C8 ARHGAP45-202ENST00000539243 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
MED27Q6P2C8 ZNF395-201ENST00000344423 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
MED27Q6P2C8 UACA-201ENST00000322954 6939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
MED27Q6P2C8 TTC39A-216ENST00000530004 1780 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
MED27Q6P2C8 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
MED27Q6P2C8 COQ8A-203ENST00000366779 5523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
MED27Q6P2C8 HDAC11-213ENST00000437379 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
MED27Q6P2C8 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
MED27Q6P2C8 RAB11FIP1-206ENST00000524118 1959 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
MED27Q6P2C8 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
MED27Q6P2C8 PSEN2-202ENST00000366783 2306 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
MED27Q6P2C8 SIRT5-203ENST00000379262 2339 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
MED27Q6P2C8 CDK20-202ENST00000336654 2176 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
MED27Q6P2C8 CRCP-203ENST00000395326 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
MED27Q6P2C8 TMEM87B-201ENST00000283206 5212 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
MED27Q6P2C8 KDM2B-202ENST00000377071 4595 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
MED27Q6P2C8 RP1L1-202ENST00000382483 7973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
MED27Q6P2C8 SEMA3F-202ENST00000413852 3212 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
MED27Q6P2C8 STIP1-203ENST00000358794 2743 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
MED27Q6P2C8 PDPR-202ENST00000398122 2734 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
MED27Q6P2C8 GMPR2-204ENST00000420554 1864 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
MED27Q6P2C8 GMPR2-223ENST00000559836 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
MED27Q6P2C8 AGFG1-204ENST00000409315 2912 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
MED27Q6P2C8 NDRG4-217ENST00000562999 2931 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
MED27Q6P2C8 TCOF1-207ENST00000504761 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
MED27Q6P2C8 RTFDC1-201ENST00000023939 1745 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
MED27Q6P2C8 RRAGB-202ENST00000374941 2061 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
MED27Q6P2C8 TPD52L2-206ENST00000358548 2275 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
MED27Q6P2C8 SAR1A-204ENST00000373241 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
MED27Q6P2C8 LINC00905-203ENST00000588838 1414 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
MED27Q6P2C8 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
MED27Q6P2C8 ANK1-205ENST00000347528 8237 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
MED27Q6P2C8 KRT75-201ENST00000252245 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
MED27Q6P2C8 AC011462.1-202ENST00000540732 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
MED27Q6P2C8 XPO7-201ENST00000252512 4861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
MED27Q6P2C8 BCAR1-205ENST00000420641 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
MED27Q6P2C8 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
MED27Q6P2C8 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
MED27Q6P2C8 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
MED27Q6P2C8 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
MED27Q6P2C8 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
MED27Q6P2C8 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
MED27Q6P2C8 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
MED27Q6P2C8 KRTAP2-4-201ENST00000394015 764 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
MED27Q6P2C8 UBE2I-206ENST00000403747 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
MED27Q6P2C8 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
MED27Q6P2C8 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
MED27Q6P2C8 MIR663AHG-201ENST00000427348 1213 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
MED27Q6P2C8 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
MED27Q6P2C8 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
MED27Q6P2C8 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
MED27Q6P2C8 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
MED27Q6P2C8 RPL18P13-201ENST00000478088 569 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
MED27Q6P2C8 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
MED27Q6P2C8 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
MED27Q6P2C8 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
MED27Q6P2C8 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
MED27Q6P2C8 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
MED27Q6P2C8 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
MED27Q6P2C8 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
MED27Q6P2C8 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
MED27Q6P2C8 AP005264.1-201ENST00000586226 733 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
MED27Q6P2C8 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
MED27Q6P2C8 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC13.84□□□□□ -0.19
MED27Q6P2C8 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
MED27Q6P2C8 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
MED27Q6P2C8 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC13.84□□□□□ -0.19
MED27Q6P2C8 CDH3-201ENST00000264012 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
MED27Q6P2C8 POTEM-201ENST00000547889 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
MED27Q6P2C8 SUOX-201ENST00000266971 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
MED27Q6P2C8 MAPKAP1-204ENST00000373498 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
MED27Q6P2C8 OR3A2-205ENST00000641164 2033 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
MED27Q6P2C8 FOXF1-201ENST00000262426 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
MED27Q6P2C8 GAP43-201ENST00000305124 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
MED27Q6P2C8 CCT8L1P-201ENST00000465400 1674 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
MED27Q6P2C8 TFAM-204ENST00000487519 5414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
MED27Q6P2C8 LRRFIP1-204ENST00000392000 3365 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
MED27Q6P2C8 CORO7-222ENST00000574025 2826 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
MED27Q6P2C8 AC148477.2-201ENST00000537762 3039 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
MED27Q6P2C8 ZNF174-201ENST00000268655 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
MED27Q6P2C8 SFSWAP-201ENST00000261674 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
MED27Q6P2C8 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
MED27Q6P2C8 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms