Protein–RNA interactions for Protein: Q3B7T1

EDRF1, Erythroid differentiation-related factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDRF1Q3B7T1 SLC9B2-202ENST00000394785 3126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
EDRF1Q3B7T1 GOLIM4-202ENST00000470487 4373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
EDRF1Q3B7T1 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
EDRF1Q3B7T1 LINC00115-201ENST00000473798 1317 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
EDRF1Q3B7T1 LMAN2L-202ENST00000377079 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
EDRF1Q3B7T1 DTD2-201ENST00000310850 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
EDRF1Q3B7T1 MFAP3-201ENST00000322602 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
EDRF1Q3B7T1 RPL13AP3-202ENST00000494676 1473 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
EDRF1Q3B7T1 AC061965.1-201ENST00000560524 1465 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
EDRF1Q3B7T1 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
EDRF1Q3B7T1 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
EDRF1Q3B7T1 AC011899.2-202ENST00000438047 4302 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
EDRF1Q3B7T1 IL20RA-201ENST00000316649 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
EDRF1Q3B7T1 GABRB2-205ENST00000517901 1779 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.1
EDRF1Q3B7T1 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
EDRF1Q3B7T1 KLHL25-201ENST00000337975 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
EDRF1Q3B7T1 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
EDRF1Q3B7T1 RBL1-201ENST00000344359 3225 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
EDRF1Q3B7T1 PTBP1-221ENST00000635647 3691 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
EDRF1Q3B7T1 ALOX15-201ENST00000293761 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
EDRF1Q3B7T1 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
EDRF1Q3B7T1 ACP2-212ENST00000533929 1366 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
EDRF1Q3B7T1 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
EDRF1Q3B7T1 LRRC20-201ENST00000355790 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
EDRF1Q3B7T1 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
EDRF1Q3B7T1 NBPF3-205ENST00000454000 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
EDRF1Q3B7T1 AMT-201ENST00000273588 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
EDRF1Q3B7T1 NBPF26-208ENST00000620612 4602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
EDRF1Q3B7T1 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
EDRF1Q3B7T1 ARVCF-203ENST00000406259 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
EDRF1Q3B7T1 ABCG1-203ENST00000361802 3034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
EDRF1Q3B7T1 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
EDRF1Q3B7T1 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
EDRF1Q3B7T1 ABHD4-201ENST00000216327 716 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
EDRF1Q3B7T1 CHRNB4-201ENST00000261751 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
EDRF1Q3B7T1 ALDH3B1-201ENST00000342456 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
EDRF1Q3B7T1 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
EDRF1Q3B7T1 NPPA-201ENST00000376476 728 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
EDRF1Q3B7T1 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
EDRF1Q3B7T1 AC114488.1-201ENST00000435872 591 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
EDRF1Q3B7T1 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
EDRF1Q3B7T1 DDC-207ENST00000444124 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
EDRF1Q3B7T1 AC104073.2-201ENST00000453737 312 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
EDRF1Q3B7T1 AC106794.1-201ENST00000506935 792 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
EDRF1Q3B7T1 AC022182.2-201ENST00000525556 859 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
EDRF1Q3B7T1 TAGLN-207ENST00000532870 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
EDRF1Q3B7T1 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
EDRF1Q3B7T1 EID1-202ENST00000560490 584 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
EDRF1Q3B7T1 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
EDRF1Q3B7T1 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
EDRF1Q3B7T1 KIF17-203ENST00000400463 3731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
EDRF1Q3B7T1 TMPRSS6-203ENST00000406725 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
EDRF1Q3B7T1 ZW10-201ENST00000200135 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
EDRF1Q3B7T1 GJB4-201ENST00000339480 2840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
EDRF1Q3B7T1 ERICH6-201ENST00000295910 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
EDRF1Q3B7T1 HADH-202ENST00000403312 1752 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
EDRF1Q3B7T1 KAT7-204ENST00000454930 1774 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
EDRF1Q3B7T1 TACC3-212ENST00000612220 1756 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
EDRF1Q3B7T1 CKMT2-203ENST00000437669 1479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
EDRF1Q3B7T1 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
EDRF1Q3B7T1 FOXM1-203ENST00000361953 3370 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
EDRF1Q3B7T1 FLII-201ENST00000327031 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
EDRF1Q3B7T1 RAB6C-201ENST00000410061 3075 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
EDRF1Q3B7T1 RAB40A-201ENST00000304236 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
EDRF1Q3B7T1 ZNF785-201ENST00000395216 3282 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
EDRF1Q3B7T1 RPS6KA4-202ENST00000528057 3121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
EDRF1Q3B7T1 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
EDRF1Q3B7T1 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
EDRF1Q3B7T1 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
EDRF1Q3B7T1 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
EDRF1Q3B7T1 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
EDRF1Q3B7T1 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
EDRF1Q3B7T1 ABCC6P1-201ENST00000546162 2943 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
EDRF1Q3B7T1 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
EDRF1Q3B7T1 ZNF135-205ENST00000511556 2253 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
EDRF1Q3B7T1 VWCE-202ENST00000335613 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
EDRF1Q3B7T1 AMT-256ENST00000638063 1783 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
EDRF1Q3B7T1 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
EDRF1Q3B7T1 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
EDRF1Q3B7T1 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
EDRF1Q3B7T1 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
EDRF1Q3B7T1 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
EDRF1Q3B7T1 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
EDRF1Q3B7T1 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
EDRF1Q3B7T1 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
EDRF1Q3B7T1 CSH2-203ENST00000392886 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
EDRF1Q3B7T1 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
EDRF1Q3B7T1 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
EDRF1Q3B7T1 LINC00431-201ENST00000440735 1189 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
EDRF1Q3B7T1 SERPINA13P-202ENST00000478994 924 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
EDRF1Q3B7T1 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
EDRF1Q3B7T1 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
EDRF1Q3B7T1 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
EDRF1Q3B7T1 CSH2-206ENST00000560142 749 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
EDRF1Q3B7T1 AC025259.3-202ENST00000564363 687 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
EDRF1Q3B7T1 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
EDRF1Q3B7T1 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
EDRF1Q3B7T1 CPSF7-201ENST00000340437 3695 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
EDRF1Q3B7T1 ELP4-228ENST00000640954 1612 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
EDRF1Q3B7T1 ADAM15-206ENST00000368412 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms