Protein–RNA interactions for Protein: Q3B7I2

CNPY1, Protein canopy homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNPY1Q3B7I2 TMCO4-202ENST00000375127 2403 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CNPY1Q3B7I2 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CNPY1Q3B7I2 AC012485.1-201ENST00000456601 2509 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CNPY1Q3B7I2 BTBD3-203ENST00000399006 4826 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CNPY1Q3B7I2 MAN2B1-201ENST00000221363 3170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CNPY1Q3B7I2 SMG9-201ENST00000270066 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CNPY1Q3B7I2 PRKCQ-201ENST00000263125 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CNPY1Q3B7I2 DPYSL5-201ENST00000288699 5209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CNPY1Q3B7I2 REV3L-207ENST00000435970 10943 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CNPY1Q3B7I2 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CNPY1Q3B7I2 LSS-201ENST00000356396 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
CNPY1Q3B7I2 LRTM2-201ENST00000299194 3688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
CNPY1Q3B7I2 SALL4P6-201ENST00000429385 1691 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
CNPY1Q3B7I2 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
CNPY1Q3B7I2 NT5C3A-214ENST00000620705 1704 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
CNPY1Q3B7I2 SMARCA2-254ENST00000636903 2471 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
CNPY1Q3B7I2 TMEM40-205ENST00000435575 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
CNPY1Q3B7I2 AAAS-201ENST00000209873 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
CNPY1Q3B7I2 MUC20-205ENST00000447234 2589 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
CNPY1Q3B7I2 MRPS16-202ENST00000372945 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
CNPY1Q3B7I2 XAB2-201ENST00000358368 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
CNPY1Q3B7I2 GPHN-203ENST00000478722 4297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
CNPY1Q3B7I2 GOLGA8O-201ENST00000509311 1997 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
CNPY1Q3B7I2 AKNA-201ENST00000223791 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
CNPY1Q3B7I2 PAM-204ENST00000348126 3622 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CNPY1Q3B7I2 ARMC1-202ENST00000458464 2849 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
CNPY1Q3B7I2 POFUT2-203ENST00000349485 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CNPY1Q3B7I2 LRFN5-201ENST00000298119 3723 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CNPY1Q3B7I2 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CNPY1Q3B7I2 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CNPY1Q3B7I2 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
CNPY1Q3B7I2 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
CNPY1Q3B7I2 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC13.02□□□□□ -0.33
CNPY1Q3B7I2 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
CNPY1Q3B7I2 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
CNPY1Q3B7I2 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
CNPY1Q3B7I2 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC13.02□□□□□ -0.33
CNPY1Q3B7I2 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
CNPY1Q3B7I2 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
CNPY1Q3B7I2 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
CNPY1Q3B7I2 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
CNPY1Q3B7I2 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
CNPY1Q3B7I2 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
CNPY1Q3B7I2 FAM13B-203ENST00000425075 3098 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CNPY1Q3B7I2 AC064801.2-201ENST00000625052 1303 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
CNPY1Q3B7I2 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
CNPY1Q3B7I2 GSN-205ENST00000373823 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
CNPY1Q3B7I2 RGS9-203ENST00000449996 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CNPY1Q3B7I2 MAGEL2-201ENST00000532292 4298 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
CNPY1Q3B7I2 OPRL1-202ENST00000349451 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CNPY1Q3B7I2 USP11-204ENST00000377107 3515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CNPY1Q3B7I2 GRSF1-201ENST00000254799 6666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
CNPY1Q3B7I2 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CNPY1Q3B7I2 RETREG3-201ENST00000309428 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CNPY1Q3B7I2 ADGRD1-201ENST00000261654 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CNPY1Q3B7I2 DNMT3B-203ENST00000348286 4048 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CNPY1Q3B7I2 FCRLA-206ENST00000367949 1792 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CNPY1Q3B7I2 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
CNPY1Q3B7I2 PRAMENP-201ENST00000337471 3038 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
CNPY1Q3B7I2 AC098934.1-201ENST00000443294 1835 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CNPY1Q3B7I2 BISPR-204ENST00000634675 1806 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
CNPY1Q3B7I2 CCDC88A-214ENST00000621814 3089 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
CNPY1Q3B7I2 ARHGEF33-201ENST00000398800 4300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
CNPY1Q3B7I2 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CNPY1Q3B7I2 PCDHGA5-201ENST00000518069 4602 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CNPY1Q3B7I2 ANKRD27-204ENST00000587352 3301 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CNPY1Q3B7I2 ALDH7A1-201ENST00000409134 4964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CNPY1Q3B7I2 POLR3E-219ENST00000615879 3655 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CNPY1Q3B7I2 MIS12-202ENST00000573759 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CNPY1Q3B7I2 MTUS1-204ENST00000381869 6256 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CNPY1Q3B7I2 FCHO1-221ENST00000597512 2934 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CNPY1Q3B7I2 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CNPY1Q3B7I2 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CNPY1Q3B7I2 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CNPY1Q3B7I2 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CNPY1Q3B7I2 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CNPY1Q3B7I2 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CNPY1Q3B7I2 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CNPY1Q3B7I2 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CNPY1Q3B7I2 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
CNPY1Q3B7I2 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CNPY1Q3B7I2 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CNPY1Q3B7I2 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CNPY1Q3B7I2 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CNPY1Q3B7I2 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CNPY1Q3B7I2 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CNPY1Q3B7I2 BCL2L12-204ENST00000594157 620 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CNPY1Q3B7I2 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CNPY1Q3B7I2 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
CNPY1Q3B7I2 CR392039.2-201ENST00000623182 509 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
CNPY1Q3B7I2 TXNRD1-201ENST00000354940 4082 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CNPY1Q3B7I2 METTL7B-201ENST00000394252 1506 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CNPY1Q3B7I2 KCTD21-AS1-207ENST00000600795 1549 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
CNPY1Q3B7I2 GPR12-202ENST00000405846 4850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CNPY1Q3B7I2 KLF4-206ENST00000610832 1956 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CNPY1Q3B7I2 AC091948.1-201ENST00000501695 2033 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CNPY1Q3B7I2 AC091181.1-201ENST00000623762 2098 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
CNPY1Q3B7I2 BDKRB2-202ENST00000542454 6845 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CNPY1Q3B7I2 ARHGAP36-202ENST00000370921 2447 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CNPY1Q3B7I2 KIF28P-202ENST00000504864 3064 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.4 ms