Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 IGHVIII-5-2-201ENST00000522505 261 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
RTL8BQ17RB0 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
RTL8BQ17RB0 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC11.82□□□□□ -0.52
RTL8BQ17RB0 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
RTL8BQ17RB0 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
RTL8BQ17RB0 ANO1-AS2-202ENST00000533327 498 ntTSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
RTL8BQ17RB0 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
RTL8BQ17RB0 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC11.82□□□□□ -0.52
RTL8BQ17RB0 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
RTL8BQ17RB0 AC007376.2-201ENST00000556271 540 ntTSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
RTL8BQ17RB0 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC11.82□□□□□ -0.52
RTL8BQ17RB0 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
RTL8BQ17RB0 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC11.82□□□□□ -0.52
RTL8BQ17RB0 FMNL3-205ENST00000550488 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
RTL8BQ17RB0 MARVELD2-203ENST00000436532 1563 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
RTL8BQ17RB0 FAM120C-201ENST00000328235 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
RTL8BQ17RB0 CACNA1G-211ENST00000503485 6768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
RTL8BQ17RB0 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
RTL8BQ17RB0 RASSF3-204ENST00000542104 3492 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
RTL8BQ17RB0 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
RTL8BQ17RB0 LPCAT2-201ENST00000262134 5391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
RTL8BQ17RB0 GP1BA-202ENST00000611961 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
RTL8BQ17RB0 BTRC-202ENST00000370187 6134 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
RTL8BQ17RB0 TAB1-201ENST00000216160 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
RTL8BQ17RB0 PREX1-201ENST00000371941 6636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
RTL8BQ17RB0 USP40-208ENST00000450966 5616 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
RTL8BQ17RB0 SUOX-201ENST00000266971 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
RTL8BQ17RB0 SMG9-211ENST00000601170 2387 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
RTL8BQ17RB0 ANKRD42-201ENST00000260047 2514 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
RTL8BQ17RB0 SIGLEC16-202ENST00000602139 2510 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
RTL8BQ17RB0 AC004890.2-205ENST00000416232 2804 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
RTL8BQ17RB0 MAP3K12-205ENST00000547488 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
RTL8BQ17RB0 ZNF717-204ENST00000478296 3875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
RTL8BQ17RB0 EMILIN1-201ENST00000380320 3943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
RTL8BQ17RB0 LINC00882-204ENST00000484698 2718 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
RTL8BQ17RB0 INTS11-248ENST00000545578 2263 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
RTL8BQ17RB0 GATAD2A-203ENST00000404158 5776 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
RTL8BQ17RB0 DDC-213ENST00000617822 1809 ntTSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
RTL8BQ17RB0 INPP5E-201ENST00000371712 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
RTL8BQ17RB0 KCNH6-202ENST00000456941 2928 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
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RTL8BQ17RB0 CLCN7-201ENST00000262318 3717 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
RTL8BQ17RB0 ZBTB7B-202ENST00000368426 3594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
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RTL8BQ17RB0 ADAT1-201ENST00000307921 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
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RTL8BQ17RB0 C12orf73-201ENST00000378090 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
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RTL8BQ17RB0 HPCAL4-201ENST00000372844 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
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RTL8BQ17RB0 TMPRSS9-201ENST00000332578 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
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RTL8BQ17RB0 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
RTL8BQ17RB0 ACSM2A-202ENST00000396104 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
RTL8BQ17RB0 SMTN-223ENST00000619644 3227 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
RTL8BQ17RB0 MAGEA4-202ENST00000360243 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
RTL8BQ17RB0 MAGEA4-203ENST00000370335 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
RTL8BQ17RB0 MAGEA4-204ENST00000370340 1773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
RTL8BQ17RB0 FBXL7-203ENST00000510662 1758 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
RTL8BQ17RB0 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
RTL8BQ17RB0 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
RTL8BQ17RB0 LGALSL-201ENST00000238875 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
RTL8BQ17RB0 BSDC1-203ENST00000419121 1473 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
RTL8BQ17RB0 KIRREL3-202ENST00000525704 2474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
RTL8BQ17RB0 TPO-205ENST00000382201 2956 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
RTL8BQ17RB0 RUNX3-203ENST00000399916 4340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
RTL8BQ17RB0 NCAPG-201ENST00000251496 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
RTL8BQ17RB0 PEX5-207ENST00000455147 2689 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
RTL8BQ17RB0 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
RTL8BQ17RB0 PI4KA-201ENST00000255882 6752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
RTL8BQ17RB0 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
RTL8BQ17RB0 RUSC1-204ENST00000368352 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
RTL8BQ17RB0 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
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