Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAF6

SYCN, Syncollin, humanhuman

Predictions only

Length 134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCNQ0VAF6 ZKSCAN7-201ENST00000273320 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
SYCNQ0VAF6 DUSP28-202ENST00000405954 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
SYCNQ0VAF6 CDT1-201ENST00000301019 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
SYCNQ0VAF6 ICE1-201ENST00000296564 7927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
SYCNQ0VAF6 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
SYCNQ0VAF6 MCC-201ENST00000302475 8257 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
SYCNQ0VAF6 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC9.59□□□□□ -0.87
SYCNQ0VAF6 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
SYCNQ0VAF6 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
SYCNQ0VAF6 TMEM168-201ENST00000312814 7470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
SYCNQ0VAF6 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC9.59□□□□□ -0.87
SYCNQ0VAF6 FAM225A-202ENST00000453010 5625 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
SYCNQ0VAF6 STXBP6-202ENST00000396700 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
SYCNQ0VAF6 LINC01782-201ENST00000591212 2908 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
SYCNQ0VAF6 C1orf228-218ENST00000458657 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.88
SYCNQ0VAF6 ST8SIA1-203ENST00000396037 9714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.88
SYCNQ0VAF6 NUTM2A-202ENST00000381707 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
SYCNQ0VAF6 NUTM2B-203ENST00000429828 3292 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
SYCNQ0VAF6 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
SYCNQ0VAF6 CNN2-201ENST00000263097 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
SYCNQ0VAF6 CNN2-205ENST00000562958 2194 ntTSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
SYCNQ0VAF6 PRKCE-201ENST00000306156 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
SYCNQ0VAF6 TRIB2-202ENST00000381465 2778 ntTSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
SYCNQ0VAF6 LRRFIP1-204ENST00000392000 3365 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
SYCNQ0VAF6 ANKRD52-201ENST00000267116 8688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
SYCNQ0VAF6 MUTYH-210ENST00000450313 1929 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
SYCNQ0VAF6 RNF43-201ENST00000407977 5516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
SYCNQ0VAF6 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
SYCNQ0VAF6 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
SYCNQ0VAF6 OGFOD1-209ENST00000568397 1681 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
SYCNQ0VAF6 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
SYCNQ0VAF6 AC125611.4-201ENST00000553259 4166 ntTSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
SYCNQ0VAF6 GRIK4-208ENST00000638419 3593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
SYCNQ0VAF6 GPR84-202ENST00000551809 2041 ntAPPRIS P1 BASIC9.58□□□□□ -0.88
SYCNQ0VAF6 SAMD4B-201ENST00000314471 4519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
SYCNQ0VAF6 RASGEF1C-202ENST00000393371 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
SYCNQ0VAF6 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
SYCNQ0VAF6 ZNF251-201ENST00000292562 2807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
SYCNQ0VAF6 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
SYCNQ0VAF6 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
SYCNQ0VAF6 NUTM2E-201ENST00000429984 3292 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
SYCNQ0VAF6 MLX-202ENST00000346833 2334 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
SYCNQ0VAF6 FGGY-203ENST00000371212 1640 ntTSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
SYCNQ0VAF6 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
SYCNQ0VAF6 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
SYCNQ0VAF6 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
SYCNQ0VAF6 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
SYCNQ0VAF6 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC9.58□□□□□ -0.88
SYCNQ0VAF6 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
SYCNQ0VAF6 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
SYCNQ0VAF6 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
SYCNQ0VAF6 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
SYCNQ0VAF6 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
SYCNQ0VAF6 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC9.58□□□□□ -0.88
SYCNQ0VAF6 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
SYCNQ0VAF6 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
SYCNQ0VAF6 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
SYCNQ0VAF6 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
SYCNQ0VAF6 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
SYCNQ0VAF6 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC9.58□□□□□ -0.88
SYCNQ0VAF6 ANO1-AS2-202ENST00000533327 498 ntTSL 3 BASIC9.58□□□□□ -0.88
SYCNQ0VAF6 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
SYCNQ0VAF6 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
SYCNQ0VAF6 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC9.58□□□□□ -0.88
SYCNQ0VAF6 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
SYCNQ0VAF6 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
SYCNQ0VAF6 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
SYCNQ0VAF6 ITPR3-202ENST00000605930 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
SYCNQ0VAF6 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
SYCNQ0VAF6 ADAMTSL4-201ENST00000271643 4250 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
SYCNQ0VAF6 SNAP91-215ENST00000521743 4263 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
SYCNQ0VAF6 AC011474.4-201ENST00000623523 2076 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
SYCNQ0VAF6 TMPRSS2-202ENST00000398585 3240 ntTSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
SYCNQ0VAF6 GSE1-203ENST00000405402 4366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
SYCNQ0VAF6 MAGEA4-201ENST00000276344 1724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
SYCNQ0VAF6 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
SYCNQ0VAF6 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
SYCNQ0VAF6 PIK3CG-205ENST00000496166 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
SYCNQ0VAF6 SMAD2-212ENST00000591214 1714 ntTSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
SYCNQ0VAF6 SLC19A2-201ENST00000236137 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
SYCNQ0VAF6 CACNB4-210ENST00000539935 8378 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
SYCNQ0VAF6 DLGAP1-203ENST00000400147 5258 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
SYCNQ0VAF6 DLGAP1-206ENST00000400155 5257 ntTSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
SYCNQ0VAF6 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
SYCNQ0VAF6 CDH11-201ENST00000268603 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
SYCNQ0VAF6 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC9.58□□□□□ -0.88
SYCNQ0VAF6 NUMA1-234ENST00000620566 7012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
SYCNQ0VAF6 AFDN-206ENST00000392112 7459 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
SYCNQ0VAF6 NTNG1-204ENST00000370067 4628 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
SYCNQ0VAF6 TPM3-206ENST00000330188 2108 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
SYCNQ0VAF6 NAALADL1-202ENST00000355721 2100 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
SYCNQ0VAF6 AC099548.2-204ENST00000481651 2106 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
SYCNQ0VAF6 LINC00926-202ENST00000502027 2141 ntTSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
SYCNQ0VAF6 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
SYCNQ0VAF6 CAMK2D-204ENST00000394522 2696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
SYCNQ0VAF6 DDC-AS1-201ENST00000454521 1776 ntTSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
SYCNQ0VAF6 AFAP1L1-205ENST00000515000 2319 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
SYCNQ0VAF6 COL6A2-202ENST00000310645 3446 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
SYCNQ0VAF6 KCNMA1-216ENST00000457953 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
SYCNQ0VAF6 TUBB8P4-201ENST00000511806 1324 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.3 ms