Protein–RNA interactions for Protein: P84550

SKOR1, SKI family transcriptional corepressor 1, humanhuman

Predictions only

Length 965 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKOR1P84550 AC010255.3-203ENST00000509403 1727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SKOR1P84550 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SKOR1P84550 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SKOR1P84550 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SKOR1P84550 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SKOR1P84550 ELAVL4-207ENST00000448907 1951 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SKOR1P84550 CNOT9-201ENST00000273064 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SKOR1P84550 PRKAB1-201ENST00000229328 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SKOR1P84550 PUF60-209ENST00000527197 1559 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SKOR1P84550 TRIM69-206ENST00000559390 2486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SKOR1P84550 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SKOR1P84550 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SKOR1P84550 CBLB-204ENST00000405772 3237 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SKOR1P84550 XPR1-201ENST00000367589 4126 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SKOR1P84550 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SKOR1P84550 TTK-201ENST00000230510 3477 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SKOR1P84550 HMGA2-204ENST00000403681 4473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SKOR1P84550 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SKOR1P84550 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SKOR1P84550 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SKOR1P84550 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SKOR1P84550 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SKOR1P84550 HCG24-202ENST00000414398 717 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SKOR1P84550 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SKOR1P84550 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SKOR1P84550 THRB-AS1-202ENST00000438096 702 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SKOR1P84550 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SKOR1P84550 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SKOR1P84550 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SKOR1P84550 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SKOR1P84550 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SKOR1P84550 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SKOR1P84550 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SKOR1P84550 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SKOR1P84550 AL031670.1-201ENST00000619343 669 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SKOR1P84550 LIMD2-201ENST00000259006 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SKOR1P84550 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SKOR1P84550 TTC14-202ENST00000382584 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SKOR1P84550 RERE-204ENST00000400908 5790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SKOR1P84550 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SKOR1P84550 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SKOR1P84550 CEP295NL-205ENST00000619342 1866 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SKOR1P84550 SLC52A1-203ENST00000512825 2989 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SKOR1P84550 MAGED4B-211ENST00000497164 2482 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SKOR1P84550 CHIT1-202ENST00000367229 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SKOR1P84550 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SKOR1P84550 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SKOR1P84550 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SKOR1P84550 FAM98A-201ENST00000238823 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SKOR1P84550 TOMM40L-209ENST00000545897 2807 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SKOR1P84550 ADAM33-207ENST00000619289 3195 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SKOR1P84550 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SKOR1P84550 CELF4-201ENST00000334919 3542 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SKOR1P84550 GNAO1-214ENST00000638705 3529 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SKOR1P84550 SCARB2-227ENST00000640957 3255 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SKOR1P84550 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SKOR1P84550 ARMC5-201ENST00000268314 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SKOR1P84550 MYLIP-201ENST00000349606 2796 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SKOR1P84550 VRK3-201ENST00000316763 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SKOR1P84550 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SKOR1P84550 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SKOR1P84550 TRAF1-201ENST00000373887 6324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SKOR1P84550 NOP58-201ENST00000264279 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SKOR1P84550 RGS9-201ENST00000262406 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SKOR1P84550 CENPL-202ENST00000356198 2357 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SKOR1P84550 S100PBP-203ENST00000373476 3320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SKOR1P84550 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SKOR1P84550 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SKOR1P84550 CILP2-202ENST00000586018 4234 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SKOR1P84550 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SKOR1P84550 AC022007.1-201ENST00000383808 1897 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SKOR1P84550 KCNV1-201ENST00000297404 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SKOR1P84550 PCNX4-203ENST00000406854 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SKOR1P84550 SACM1L-201ENST00000389061 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SKOR1P84550 NLGN3-201ENST00000358741 3046 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SKOR1P84550 KANK2-205ENST00000589359 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SKOR1P84550 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SKOR1P84550 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SKOR1P84550 NCLP1-201ENST00000445357 1963 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SKOR1P84550 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SKOR1P84550 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SKOR1P84550 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SKOR1P84550 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SKOR1P84550 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SKOR1P84550 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SKOR1P84550 AC092473.1-201ENST00000441098 221 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SKOR1P84550 GUSBP11-206ENST00000455485 3816 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SKOR1P84550 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SKOR1P84550 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SKOR1P84550 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SKOR1P84550 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SKOR1P84550 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SKOR1P84550 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SKOR1P84550 ARHGEF4-217ENST00000611048 3486 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SKOR1P84550 ZFYVE27-202ENST00000357540 2765 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SKOR1P84550 ZFYVE27-204ENST00000370610 2769 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SKOR1P84550 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SKOR1P84550 ADCY3-202ENST00000405392 4397 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SKOR1P84550 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SKOR1P84550 CDK11B-203ENST00000341832 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms