Protein–RNA interactions for Protein: P55773

CCL23, C-C motif chemokine 23, humanhuman

Predictions only

Length 120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL23P55773 HIST1H2BF-201ENST00000356530 1196 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCL23P55773 TPM3-211ENST00000368531 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCL23P55773 HLA-DRB5-201ENST00000374975 1260 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCL23P55773 TRBV7-3-201ENST00000390361 397 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCL23P55773 IGHV1-3-201ENST00000390595 395 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCL23P55773 AL121983.2-202ENST00000419983 535 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCL23P55773 OST4-201ENST00000429985 559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCL23P55773 RPL3P5-201ENST00000441645 1232 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CCL23P55773 AL928742.1-201ENST00000497397 548 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCL23P55773 C10orf113-201ENST00000529198 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCL23P55773 ORAOV1-205ENST00000535657 709 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCL23P55773 CES1P2-201ENST00000566467 1242 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CCL23P55773 ANAPC11-221ENST00000584314 559 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCL23P55773 AC017033.1-201ENST00000603720 708 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCL23P55773 AC073578.2-201ENST00000618927 464 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCL23P55773 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCL23P55773 RPF1-201ENST00000370654 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCL23P55773 FKBP4P8-201ENST00000610931 1369 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CCL23P55773 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCL23P55773 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCL23P55773 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CCL23P55773 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CCL23P55773 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCL23P55773 SLC25A31-201ENST00000281154 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCL23P55773 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCL23P55773 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCL23P55773 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCL23P55773 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCL23P55773 TRMT10B-202ENST00000377753 2027 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCL23P55773 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCL23P55773 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCL23P55773 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCL23P55773 RNF34-211ENST00000613529 1449 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCL23P55773 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCL23P55773 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCL23P55773 COQ4-201ENST00000300452 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCL23P55773 TBC1D24-205ENST00000567020 6673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCL23P55773 AC106707.1-201ENST00000475981 1640 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCL23P55773 ZNF556-202ENST00000586426 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCL23P55773 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCL23P55773 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCL23P55773 DAD1-201ENST00000250498 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCL23P55773 FAM163B-201ENST00000356873 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCL23P55773 PIFO-201ENST00000369737 746 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCL23P55773 PLA2G12B-201ENST00000373032 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCL23P55773 AF274858.1-201ENST00000406288 372 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CCL23P55773 ID2-AS1-201ENST00000412712 953 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCL23P55773 RPL3P2-204ENST00000413027 1203 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CCL23P55773 AP000244.1-201ENST00000424582 201 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CCL23P55773 LRRC3-AS1-201ENST00000426578 784 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCL23P55773 RNLS-203ENST00000437752 525 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCL23P55773 AC004540.1-204ENST00000449537 727 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCL23P55773 AL451000.1-201ENST00000451300 1186 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CCL23P55773 S100A2-205ENST00000487430 752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCL23P55773 AL121796.1-201ENST00000505702 466 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCL23P55773 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCL23P55773 AC108471.2-201ENST00000533736 1061 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCL23P55773 NR4A1-209ENST00000548232 1101 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCL23P55773 CR383656.13-201ENST00000550928 563 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCL23P55773 AC008050.1-201ENST00000554926 632 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCL23P55773 AL512310.10-201ENST00000555580 563 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCL23P55773 AC023968.2-201ENST00000560593 1049 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CCL23P55773 RN7SL455P-201ENST00000580629 282 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CCL23P55773 AC005323.2-202ENST00000581304 493 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCL23P55773 RN7SL121P-201ENST00000584223 273 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CCL23P55773 SCGB1B2P-201ENST00000595013 612 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCL23P55773 SELENOW-212ENST00000601048 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCL23P55773 AL138720.1-201ENST00000629853 778 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCL23P55773 LINC01002-234ENST00000633808 848 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCL23P55773 OSMR-AS1-204ENST00000636516 850 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCL23P55773 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCL23P55773 WIPI1-201ENST00000262139 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCL23P55773 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCL23P55773 ATP5A1-201ENST00000282050 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCL23P55773 PAX6-264ENST00000640125 1375 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCL23P55773 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCL23P55773 AADAT-206ENST00000509167 2113 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCL23P55773 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCL23P55773 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCL23P55773 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCL23P55773 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCL23P55773 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCL23P55773 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCL23P55773 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCL23P55773 SLC50A1-203ENST00000368404 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCL23P55773 AC138761.6-201ENST00000583997 1423 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CCL23P55773 FAM96A-203ENST00000557835 1536 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCL23P55773 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCL23P55773 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCL23P55773 GUCY1B2-205ENST00000532104 1912 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCL23P55773 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCL23P55773 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCL23P55773 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCL23P55773 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCL23P55773 OPN1SW-201ENST00000249389 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCL23P55773 RPRD2-201ENST00000369067 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCL23P55773 PRELID3B-202ENST00000371033 943 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCL23P55773 GEMIN8P4-201ENST00000380526 729 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CCL23P55773 S100A13-203ENST00000392623 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCL23P55773 COPS7B-204ENST00000409091 806 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms