Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
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PGGT1BP53609 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
PGGT1BP53609 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
PGGT1BP53609 LAMA4-209ENST00000453937 645 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
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