Protein–RNA interactions for Protein: P51532

SMARCA4, Transcription activator BRG1, humanhuman

Predictions only

Length 1,647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA4P51532 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SMARCA4P51532 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SMARCA4P51532 EPM2A-218ENST00000639465 2203 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SMARCA4P51532 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SMARCA4P51532 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SMARCA4P51532 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SMARCA4P51532 DPH2-202ENST00000396758 1738 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SMARCA4P51532 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SMARCA4P51532 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SMARCA4P51532 MUC1-207ENST00000368392 1032 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SMARCA4P51532 MUC1-208ENST00000368393 937 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SMARCA4P51532 PHACTR1-203ENST00000379335 943 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SMARCA4P51532 TXLNGY-202ENST00000407724 1000 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SMARCA4P51532 RPL38-202ENST00000439590 431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SMARCA4P51532 MUC1-213ENST00000462215 1189 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SMARCA4P51532 CDC37P2-201ENST00000562287 1029 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
SMARCA4P51532 GRAPL-204ENST00000577213 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SMARCA4P51532 SEPT4-AS1-203ENST00000580769 1000 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SMARCA4P51532 CLEC18B-204ENST00000617101 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SMARCA4P51532 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SMARCA4P51532 VRK3-201ENST00000316763 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SMARCA4P51532 AL591806.3-201ENST00000289779 2096 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SMARCA4P51532 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SMARCA4P51532 GTF2A1L-201ENST00000403751 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SMARCA4P51532 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SMARCA4P51532 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SMARCA4P51532 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SMARCA4P51532 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SMARCA4P51532 IGHV3-43-201ENST00000434710 434 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SMARCA4P51532 PRSS46-201ENST00000463091 982 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SMARCA4P51532 C10orf90-207ENST00000480379 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SMARCA4P51532 IGKV3-11-201ENST00000483158 392 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SMARCA4P51532 AC078878.2-201ENST00000543451 286 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SMARCA4P51532 AC007223.1-201ENST00000564076 572 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SMARCA4P51532 AC116025.1-201ENST00000575404 415 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SMARCA4P51532 BIRC5-211ENST00000592734 386 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SMARCA4P51532 CHD1L-211ENST00000639534 1144 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SMARCA4P51532 AC026786.1-201ENST00000540096 1374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SMARCA4P51532 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SMARCA4P51532 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SMARCA4P51532 EEF1G-201ENST00000329251 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SMARCA4P51532 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SMARCA4P51532 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SMARCA4P51532 AL031590.1-202ENST00000641466 1737 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
SMARCA4P51532 SNRPN-205ENST00000400100 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SMARCA4P51532 SEPT10-208ENST00000437928 1782 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SMARCA4P51532 FAM86B1-203ENST00000448228 2096 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SMARCA4P51532 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SMARCA4P51532 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SMARCA4P51532 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SMARCA4P51532 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SMARCA4P51532 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SMARCA4P51532 AL591499.1-201ENST00000307155 1153 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
SMARCA4P51532 NANOS3-201ENST00000339133 581 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SMARCA4P51532 UCN3-201ENST00000380433 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SMARCA4P51532 AIPL1-210ENST00000576307 1077 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SMARCA4P51532 AC095350.1-204ENST00000585405 616 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SMARCA4P51532 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SMARCA4P51532 ANAPC15-203ENST00000502597 1481 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SMARCA4P51532 AC003986.1-201ENST00000452700 1526 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SMARCA4P51532 SFPQP1-201ENST00000446621 1786 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
SMARCA4P51532 LINC01002-209ENST00000631858 1761 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SMARCA4P51532 ZSCAN21-203ENST00000456748 1904 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SMARCA4P51532 EFHB-202ENST00000344838 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SMARCA4P51532 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SMARCA4P51532 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SMARCA4P51532 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SMARCA4P51532 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SMARCA4P51532 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SMARCA4P51532 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SMARCA4P51532 CTRL-205ENST00000574481 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SMARCA4P51532 WNT8A-202ENST00000398754 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SMARCA4P51532 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
SMARCA4P51532 ZCCHC7-201ENST00000322831 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SMARCA4P51532 GAST-201ENST00000329402 470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SMARCA4P51532 AC019205.2-201ENST00000442007 1083 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SMARCA4P51532 AL662797.1-201ENST00000442852 799 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SMARCA4P51532 AL512356.1-201ENST00000548203 535 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SMARCA4P51532 AC254633.1-201ENST00000606790 345 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
SMARCA4P51532 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SMARCA4P51532 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SMARCA4P51532 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SMARCA4P51532 CATSPERE-202ENST00000366533 3019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SMARCA4P51532 CETP-201ENST00000200676 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SMARCA4P51532 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SMARCA4P51532 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SMARCA4P51532 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SMARCA4P51532 CASP2-203ENST00000392925 616 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SMARCA4P51532 ZBTB46-AS1-201ENST00000435912 533 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SMARCA4P51532 RPL35P1-201ENST00000450819 370 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
SMARCA4P51532 HAND2-AS1-208ENST00000504740 837 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SMARCA4P51532 NMNAT3-212ENST00000511444 873 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SMARCA4P51532 SMUG1-220ENST00000513838 2119 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SMARCA4P51532 IDH3A-213ENST00000559205 566 ntTSL 4 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SMARCA4P51532 RN7SL162P-201ENST00000579233 292 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
SMARCA4P51532 AC015922.3-201ENST00000582780 347 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SMARCA4P51532 NRSN2-206ENST00000608736 712 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SMARCA4P51532 MRPS31P4-202ENST00000613769 583 ntTSL 4 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SMARCA4P51532 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SMARCA4P51532 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.8 ms