Protein–RNA interactions for Protein: P40425

PBX2, Pre-B-cell leukemia transcription factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PBX2P40425 DPY19L2P4-201ENST00000479881 442 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
PBX2P40425 AC147876.1-201ENST00000504408 322 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
PBX2P40425 USP9YP2-201ENST00000504503 1000 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
PBX2P40425 AC093300.1-201ENST00000510368 1201 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
PBX2P40425 USP9YP1-201ENST00000513521 1002 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
PBX2P40425 AP000920.1-201ENST00000531824 344 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
PBX2P40425 AC005993.1-201ENST00000555581 397 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PBX2P40425 AC010931.3-201ENST00000561647 554 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PBX2P40425 INO80E-209ENST00000567254 625 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PBX2P40425 AC005777.1-201ENST00000588332 187 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
PBX2P40425 HAMP-203ENST00000598398 652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PBX2P40425 AC097655.1-201ENST00000635075 318 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
PBX2P40425 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PBX2P40425 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PBX2P40425 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PBX2P40425 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PBX2P40425 CRYM-202ENST00000543948 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PBX2P40425 CERCAM-214ENST00000613052 1429 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PBX2P40425 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PBX2P40425 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PBX2P40425 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PBX2P40425 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PBX2P40425 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PBX2P40425 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PBX2P40425 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PBX2P40425 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PBX2P40425 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PBX2P40425 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PBX2P40425 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PBX2P40425 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PBX2P40425 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PBX2P40425 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PBX2P40425 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PBX2P40425 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PBX2P40425 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PBX2P40425 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PBX2P40425 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PBX2P40425 SIGLEC6-204ENST00000391797 1391 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PBX2P40425 MSRA-201ENST00000317173 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PBX2P40425 SLC25A31-201ENST00000281154 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PBX2P40425 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PBX2P40425 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PBX2P40425 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PBX2P40425 CRYGB-201ENST00000260988 641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PBX2P40425 CYB5R2-201ENST00000299498 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PBX2P40425 IFNLR1-203ENST00000374418 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PBX2P40425 PCLAF-202ENST00000380258 911 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PBX2P40425 TOMM5-203ENST00000401811 789 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PBX2P40425 AL353658.1-201ENST00000436263 789 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PBX2P40425 CDK4P1-201ENST00000454213 828 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
PBX2P40425 TREX1-203ENST00000456089 629 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PBX2P40425 HFE-209ENST00000461397 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PBX2P40425 AC005486.1-201ENST00000466775 216 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PBX2P40425 TIMMDC1-207ENST00000493694 710 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PBX2P40425 ALG1L7P-201ENST00000502317 768 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
PBX2P40425 HGNC:18790-207ENST00000505246 973 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PBX2P40425 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PBX2P40425 BLOC1S1-202ENST00000548556 525 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PBX2P40425 AL031705.1-201ENST00000566922 682 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PBX2P40425 AC009139.2-201ENST00000569032 566 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PBX2P40425 AC017076.1-201ENST00000607613 578 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
PBX2P40425 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PBX2P40425 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PBX2P40425 AC117503.4-201ENST00000623229 1418 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
PBX2P40425 AC010531.8-201ENST00000623341 685 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
PBX2P40425 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PBX2P40425 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PBX2P40425 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PBX2P40425 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PBX2P40425 ZNF691-201ENST00000372502 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PBX2P40425 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PBX2P40425 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
PBX2P40425 CLEC20A-202ENST00000623247 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PBX2P40425 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PBX2P40425 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PBX2P40425 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
PBX2P40425 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PBX2P40425 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PBX2P40425 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PBX2P40425 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PBX2P40425 TBC1D3P2-201ENST00000339120 1513 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PBX2P40425 MAPK10-379ENST00000642013 1385 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
PBX2P40425 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PBX2P40425 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PBX2P40425 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PBX2P40425 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PBX2P40425 PTGR1-205ENST00000407693 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PBX2P40425 TMEM9B-202ENST00000525069 1433 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PBX2P40425 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PBX2P40425 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PBX2P40425 CLN8-204ENST00000519254 1769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PBX2P40425 FABP5-201ENST00000297258 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PBX2P40425 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PBX2P40425 SIRPB3P-201ENST00000340424 1216 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
PBX2P40425 OLFML2B-202ENST00000367938 1153 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PBX2P40425 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PBX2P40425 AC231533.1-201ENST00000416061 925 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PBX2P40425 AC093581.1-204ENST00000442606 390 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PBX2P40425 NALT1-202ENST00000450304 437 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PBX2P40425 AC078785.1-204ENST00000460707 764 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.8 ms