Protein–RNA interactions for Protein: P35638

DDIT3, DNA damage-inducible transcript 3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDIT3P35638 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
DDIT3P35638 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
DDIT3P35638 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
DDIT3P35638 ZNF691-206ENST00000372508 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
DDIT3P35638 SLC1A1-201ENST00000262352 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
DDIT3P35638 KIF17-203ENST00000400463 3731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
DDIT3P35638 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
DDIT3P35638 MYADM-201ENST00000336967 3047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
DDIT3P35638 XKR9-203ENST00000520030 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
DDIT3P35638 AC061965.1-201ENST00000560524 1465 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
DDIT3P35638 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
DDIT3P35638 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
DDIT3P35638 DCAF5-209ENST00000557386 2883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
DDIT3P35638 CCNG2-202ENST00000395640 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
DDIT3P35638 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
DDIT3P35638 JPH3-201ENST00000284262 3985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
DDIT3P35638 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DDIT3P35638 OS9-201ENST00000257966 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
DDIT3P35638 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DDIT3P35638 ERVK13-1-207ENST00000569465 3321 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
DDIT3P35638 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DDIT3P35638 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
DDIT3P35638 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DDIT3P35638 RRM2B-211ENST00000621845 3483 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
DDIT3P35638 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DDIT3P35638 SHMT1P1-201ENST00000419974 1312 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
DDIT3P35638 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
DDIT3P35638 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DDIT3P35638 TOE1-201ENST00000372090 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DDIT3P35638 BX255923.2-202ENST00000620833 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DDIT3P35638 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DDIT3P35638 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DDIT3P35638 FGGY-204ENST00000371218 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DDIT3P35638 FAM219A-207ENST00000379089 3624 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
DDIT3P35638 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DDIT3P35638 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DDIT3P35638 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DDIT3P35638 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
DDIT3P35638 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
DDIT3P35638 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DDIT3P35638 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
DDIT3P35638 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
DDIT3P35638 AP005264.1-201ENST00000586226 733 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
DDIT3P35638 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
DDIT3P35638 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
DDIT3P35638 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
DDIT3P35638 AC009975.2-202ENST00000634539 854 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
DDIT3P35638 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
DDIT3P35638 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DDIT3P35638 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DDIT3P35638 GPR39-201ENST00000329321 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DDIT3P35638 ARID3B-201ENST00000346246 4271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DDIT3P35638 NEU3-204ENST00000531509 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DDIT3P35638 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DDIT3P35638 STAT3-203ENST00000404395 2633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DDIT3P35638 LILRB1-203ENST00000396317 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DDIT3P35638 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DDIT3P35638 SARS-201ENST00000234677 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DDIT3P35638 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DDIT3P35638 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DDIT3P35638 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
DDIT3P35638 VPS36-207ENST00000611132 4607 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
DDIT3P35638 CNTNAP2-225ENST00000639247 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
DDIT3P35638 SS18-201ENST00000269137 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
DDIT3P35638 NEXN-201ENST00000330010 3195 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
DDIT3P35638 TMEM182-201ENST00000409173 3198 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
DDIT3P35638 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
DDIT3P35638 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
DDIT3P35638 CYB5D2-203ENST00000575251 1588 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
DDIT3P35638 TNFRSF11A-205ENST00000616710 3809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
DDIT3P35638 IFT81-201ENST00000242591 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
DDIT3P35638 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
DDIT3P35638 OR2V1-204ENST00000641551 2423 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
DDIT3P35638 UBA5-202ENST00000356232 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
DDIT3P35638 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
DDIT3P35638 CAMSAP3-201ENST00000160298 3889 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
DDIT3P35638 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
DDIT3P35638 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
DDIT3P35638 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
DDIT3P35638 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
DDIT3P35638 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
DDIT3P35638 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
DDIT3P35638 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
DDIT3P35638 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
DDIT3P35638 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
DDIT3P35638 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
DDIT3P35638 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
DDIT3P35638 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
DDIT3P35638 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
DDIT3P35638 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
DDIT3P35638 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
DDIT3P35638 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
DDIT3P35638 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
DDIT3P35638 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
DDIT3P35638 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
DDIT3P35638 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
DDIT3P35638 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
DDIT3P35638 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
DDIT3P35638 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
DDIT3P35638 GTF2IRD2-201ENST00000451013 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms