Protein–RNA interactions for Protein: P32926

DSG3, Desmoglein-3, humanhuman

Predictions only

Length 999 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSG3P32926 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DSG3P32926 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DSG3P32926 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DSG3P32926 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DSG3P32926 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DSG3P32926 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
DSG3P32926 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DSG3P32926 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DSG3P32926 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
DSG3P32926 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DSG3P32926 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DSG3P32926 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DSG3P32926 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DSG3P32926 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DSG3P32926 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DSG3P32926 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DSG3P32926 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DSG3P32926 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DSG3P32926 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DSG3P32926 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DSG3P32926 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DSG3P32926 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DSG3P32926 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DSG3P32926 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
DSG3P32926 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DSG3P32926 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DSG3P32926 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DSG3P32926 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DSG3P32926 ARF5-201ENST00000000233 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DSG3P32926 CFDP1-201ENST00000283882 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DSG3P32926 CFHR4-203ENST00000367418 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DSG3P32926 FAM204A-202ENST00000369172 872 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DSG3P32926 IGHV3-13-201ENST00000390602 430 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DSG3P32926 GNAT3-201ENST00000398291 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DSG3P32926 GGCT-203ENST00000409144 836 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DSG3P32926 GSTK1-202ENST00000409500 888 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DSG3P32926 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DSG3P32926 AC000123.1-201ENST00000418215 516 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DSG3P32926 AC073188.3-201ENST00000425228 339 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DSG3P32926 DLGAP4-AS1-202ENST00000433238 593 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DSG3P32926 CNTFR-AS1-201ENST00000436360 892 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DSG3P32926 LINC01004-201ENST00000445184 686 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DSG3P32926 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DSG3P32926 RN7SL519P-201ENST00000497925 288 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
DSG3P32926 AC018680.1-202ENST00000500324 525 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DSG3P32926 AC108142.1-201ENST00000505389 286 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DSG3P32926 PRSS30P-205ENST00000506153 699 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DSG3P32926 AC097537.1-201ENST00000514864 1213 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DSG3P32926 GLYAT-203ENST00000529732 1070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DSG3P32926 AP002498.1-201ENST00000530190 568 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DSG3P32926 GGCT-201ENST00000005374 1032 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DSG3P32926 MRPL48-210ENST00000542303 661 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DSG3P32926 AC107958.2-201ENST00000555396 592 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DSG3P32926 AC055855.2-201ENST00000565993 500 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DSG3P32926 ZNF283-207ENST00000593164 1260 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DSG3P32926 AL132994.2-201ENST00000603120 687 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
DSG3P32926 AC079779.3-218ENST00000612487 940 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DSG3P32926 Metazoa_SRP.60-201ENST00000616888 305 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
DSG3P32926 RBMS3-AS3-202ENST00000635847 738 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DSG3P32926 Z98259.2-201ENST00000641583 609 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
DSG3P32926 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DSG3P32926 C9orf57-201ENST00000377024 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DSG3P32926 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DSG3P32926 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
DSG3P32926 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DSG3P32926 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DSG3P32926 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DSG3P32926 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DSG3P32926 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DSG3P32926 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DSG3P32926 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DSG3P32926 JCHAIN-201ENST00000254801 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DSG3P32926 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DSG3P32926 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DSG3P32926 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DSG3P32926 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DSG3P32926 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DSG3P32926 ACMSD-201ENST00000356140 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DSG3P32926 ACMSD-202ENST00000392928 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DSG3P32926 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DSG3P32926 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DSG3P32926 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DSG3P32926 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DSG3P32926 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DSG3P32926 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DSG3P32926 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DSG3P32926 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DSG3P32926 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DSG3P32926 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DSG3P32926 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DSG3P32926 MTND4P23-201ENST00000447723 1363 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
DSG3P32926 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DSG3P32926 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DSG3P32926 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DSG3P32926 AL162425.1-201ENST00000423637 1525 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DSG3P32926 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DSG3P32926 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
DSG3P32926 AC011525.2-202ENST00000590611 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DSG3P32926 NPVF-201ENST00000222674 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DSG3P32926 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.9 ms