Protein–RNA interactions for Protein: P29466

CASP1, Caspase-1, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP1P29466 SCARNA21-201ENST00000517026 139 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CASP1P29466 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CASP1P29466 FAM167A-AS1-202ENST00000533578 1222 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CASP1P29466 AP003065.1-201ENST00000540912 562 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CASP1P29466 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CASP1P29466 AC003686.1-201ENST00000550956 1034 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CASP1P29466 AC124068.2-202ENST00000562356 612 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CASP1P29466 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CASP1P29466 AC124068.2-201ENST00000569473 1109 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CASP1P29466 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CASP1P29466 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CASP1P29466 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CASP1P29466 GPR68-204ENST00000535815 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CASP1P29466 BCAR1-208ENST00000542031 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CASP1P29466 RNF26-201ENST00000311413 2787 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CASP1P29466 PHACTR2-202ENST00000367582 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CASP1P29466 PPP6R2-202ENST00000359139 4035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CASP1P29466 ZMYND15-206ENST00000592813 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CASP1P29466 TP73-205ENST00000378285 2117 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CASP1P29466 SLC35B2-206ENST00000615337 2014 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CASP1P29466 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CASP1P29466 PAPD7-207ENST00000631941 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CASP1P29466 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CASP1P29466 ADAMTS13-205ENST00000371916 4330 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CASP1P29466 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CASP1P29466 MYD88-201ENST00000396334 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CASP1P29466 PDE8A-201ENST00000310298 3984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CASP1P29466 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CASP1P29466 DPEP2-202ENST00000393847 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CASP1P29466 MED22-209ENST00000610888 3867 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CASP1P29466 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CASP1P29466 GDAP1L1-208ENST00000617075 2645 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CASP1P29466 SCARF1-201ENST00000263071 3443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CASP1P29466 MRGPRX4-201ENST00000314254 1444 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CASP1P29466 SGCE-204ENST00000428696 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CASP1P29466 PPT1-213ENST00000641319 2388 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CASP1P29466 UGGT2-201ENST00000376712 2240 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CASP1P29466 ALPL-206ENST00000539907 2241 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CASP1P29466 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CASP1P29466 PNKD-203ENST00000273077 3021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CASP1P29466 MYMK-201ENST00000339996 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CASP1P29466 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CASP1P29466 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CASP1P29466 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CASP1P29466 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CASP1P29466 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CASP1P29466 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CASP1P29466 OR2R1P-201ENST00000441404 914 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CASP1P29466 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CASP1P29466 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CASP1P29466 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CASP1P29466 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CASP1P29466 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CASP1P29466 PCBP2-OT1-201ENST00000634357 590 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CASP1P29466 AC009975.2-202ENST00000634539 854 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CASP1P29466 POMT1-201ENST00000341012 2912 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CASP1P29466 LINC02135-201ENST00000599486 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CASP1P29466 NDUFS7-202ENST00000313408 2818 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CASP1P29466 CICP8-201ENST00000455800 2813 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CASP1P29466 HEPACAM-201ENST00000298251 3602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CASP1P29466 KIAA0895L-201ENST00000290881 3550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CASP1P29466 PADI2-202ENST00000375486 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CASP1P29466 AP4B1-201ENST00000256658 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CASP1P29466 CR382287.2-201ENST00000623370 1942 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CASP1P29466 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CASP1P29466 RRN3P3-202ENST00000551766 3366 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CASP1P29466 USP48-213ENST00000529637 3228 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CASP1P29466 POLG-201ENST00000268124 4500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CASP1P29466 MIR497HG-202ENST00000572453 3838 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CASP1P29466 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CASP1P29466 SLC4A7-214ENST00000455077 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CASP1P29466 PORCN-204ENST00000361988 1672 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CASP1P29466 THEMIS2-201ENST00000328928 2337 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CASP1P29466 CDH16-201ENST00000299752 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CASP1P29466 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CASP1P29466 ARHGEF9-230ENST00000637178 2145 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CASP1P29466 TAF9-202ENST00000328663 1461 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CASP1P29466 TMEM63B-202ENST00000323267 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CASP1P29466 MAN2B1-203ENST00000456935 3184 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CASP1P29466 SPPL3-201ENST00000353487 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CASP1P29466 CNTN1-203ENST00000547702 3033 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CASP1P29466 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CASP1P29466 RREB1-210ENST00000611109 3563 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CASP1P29466 ZNF747-202ENST00000395094 3504 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CASP1P29466 ZFP2-201ENST00000361362 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CASP1P29466 ATXN7L1-207ENST00000477775 2426 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CASP1P29466 PSIP1-203ENST00000380733 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CASP1P29466 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CASP1P29466 UBE2I-206ENST00000403747 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CASP1P29466 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CASP1P29466 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CASP1P29466 VDAC1P1-201ENST00000439229 848 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CASP1P29466 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CASP1P29466 RPL18P13-201ENST00000478088 569 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CASP1P29466 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CASP1P29466 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CASP1P29466 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CASP1P29466 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CASP1P29466 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CASP1P29466 JMJD8-203ENST00000562824 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms