Protein–RNA interactions for Protein: P26992

CNTFR, Ciliary neurotrophic factor receptor subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTFRP26992 ZFYVE27-204ENST00000370610 2769 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
CNTFRP26992 ITGAM-202ENST00000544665 4718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
CNTFRP26992 STAM2-201ENST00000263904 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
CNTFRP26992 MAPRE2-201ENST00000300249 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
CNTFRP26992 SGCE-204ENST00000428696 1409 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
CNTFRP26992 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
CNTFRP26992 PHACTR2-202ENST00000367582 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
CNTFRP26992 TCAM1P-207ENST00000485295 1537 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
CNTFRP26992 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
CNTFRP26992 C12orf73-201ENST00000378090 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
CNTFRP26992 PGLYRP4-202ENST00000368739 2116 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
CNTFRP26992 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
CNTFRP26992 CRYBG1-201ENST00000369066 7553 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
CNTFRP26992 RPS6KC1-207ENST00000543470 4227 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
CNTFRP26992 TRPM2-204ENST00000397932 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
CNTFRP26992 DHTKD1-201ENST00000263035 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
CNTFRP26992 TBC1D24-207ENST00000627285 4382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
CNTFRP26992 HSP90AA1-201ENST00000216281 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
CNTFRP26992 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
CNTFRP26992 RNF41-202ENST00000394013 2452 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
CNTFRP26992 SMG9-211ENST00000601170 2387 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
CNTFRP26992 PPT2-245ENST00000361568 1759 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
CNTFRP26992 NIPAL3-202ENST00000339255 1676 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
CNTFRP26992 INPPL1-213ENST00000541756 4649 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
CNTFRP26992 CCNJ-201ENST00000265992 4115 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
CNTFRP26992 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
CNTFRP26992 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
CNTFRP26992 PRTFDC1-202ENST00000376376 741 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
CNTFRP26992 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
CNTFRP26992 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
CNTFRP26992 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
CNTFRP26992 AC012441.2-201ENST00000444843 739 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
CNTFRP26992 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
CNTFRP26992 AL392046.1-202ENST00000457255 521 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
CNTFRP26992 AP000696.1-201ENST00000457669 1133 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
CNTFRP26992 AC006122.1-201ENST00000493323 440 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
CNTFRP26992 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC11.6□□□□□ -0.55
CNTFRP26992 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
CNTFRP26992 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
CNTFRP26992 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
CNTFRP26992 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
CNTFRP26992 AL445483.1-201ENST00000568695 736 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
CNTFRP26992 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
CNTFRP26992 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
CNTFRP26992 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
CNTFRP26992 AC008805.1-201ENST00000590892 364 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
CNTFRP26992 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
CNTFRP26992 AC104506.1-201ENST00000609247 429 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
CNTFRP26992 MUC1-226ENST00000614519 1093 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
CNTFRP26992 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
CNTFRP26992 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
CNTFRP26992 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC11.6□□□□□ -0.55
CNTFRP26992 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
CNTFRP26992 AC079325.2-202ENST00000641031 462 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
CNTFRP26992 CSNK1D-202ENST00000314028 3712 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
CNTFRP26992 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
CNTFRP26992 SEPT6-204ENST00000360156 2609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
CNTFRP26992 AXIN2-201ENST00000307078 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
CNTFRP26992 LAT2-205ENST00000460943 2527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
CNTFRP26992 CLEC18B-204ENST00000617101 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
CNTFRP26992 ACER2-201ENST00000340967 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
CNTFRP26992 FASN-201ENST00000306749 8565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
CNTFRP26992 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
CNTFRP26992 NBAT1-201ENST00000566912 1940 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
CNTFRP26992 HYOU1-219ENST00000614711 3057 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
CNTFRP26992 DDC-213ENST00000617822 1809 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
CNTFRP26992 APOF-201ENST00000398189 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
CNTFRP26992 HLA-DPA1-242ENST00000419277 1704 ntAPPRIS P2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
CNTFRP26992 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
CNTFRP26992 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
CNTFRP26992 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
CNTFRP26992 CCDC180-210ENST00000529487 5242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
CNTFRP26992 TUBB8P4-201ENST00000511806 1324 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
CNTFRP26992 GOSR2-203ENST00000415811 2171 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
CNTFRP26992 PRC1-204ENST00000442656 2060 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
CNTFRP26992 SLC19A2-201ENST00000236137 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
CNTFRP26992 DIRAS3-201ENST00000370981 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
CNTFRP26992 LOXHD1-203ENST00000398686 1958 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
CNTFRP26992 AC022007.1-201ENST00000383808 1897 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
CNTFRP26992 SLC9A8-201ENST00000361573 6094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
CNTFRP26992 MAGEA4-202ENST00000360243 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
CNTFRP26992 MAGEA4-203ENST00000370335 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
CNTFRP26992 MAGEA4-204ENST00000370340 1773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
CNTFRP26992 CLN8-204ENST00000519254 1769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
CNTFRP26992 DDN-201ENST00000421952 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
CNTFRP26992 PPFIA4-204ENST00000447715 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
CNTFRP26992 ABCC6-208ENST00000622290 4941 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
CNTFRP26992 GABPA-202ENST00000400075 4814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
CNTFRP26992 MED14-201ENST00000324817 7984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
CNTFRP26992 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
CNTFRP26992 DISC1-222ENST00000622252 6927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
CNTFRP26992 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
CNTFRP26992 AC090643.2-201ENST00000623442 2029 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
CNTFRP26992 MAPKAP1-204ENST00000373498 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
CNTFRP26992 NUDT3-201ENST00000607016 9905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
CNTFRP26992 DCUN1D4-202ENST00000381441 4207 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
CNTFRP26992 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
CNTFRP26992 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
CNTFRP26992 CACNA2D1-202ENST00000356860 7563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
CNTFRP26992 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms