Protein–RNA interactions for Protein: P15056

BRAF, Serine/threonine-protein kinase B-raf, humanhuman

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Length 766 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRAFP15056 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
BRAFP15056 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
BRAFP15056 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
BRAFP15056 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
BRAFP15056 DISC1-222ENST00000622252 6927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
BRAFP15056 CAMKV-202ENST00000463537 2818 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
BRAFP15056 ENG-204ENST00000480266 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
BRAFP15056 LRP8-203ENST00000354412 2553 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
BRAFP15056 ABLIM2-213ENST00000514025 2974 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
BRAFP15056 TBC1D3-201ENST00000620215 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
BRAFP15056 TBC1D3C-201ENST00000622206 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
BRAFP15056 SPOCD1-201ENST00000257100 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
BRAFP15056 CFAP74-209ENST00000493964 5247 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
BRAFP15056 NUP98-204ENST00000397004 3923 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
BRAFP15056 TOX2-202ENST00000358131 2605 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
BRAFP15056 SNPH-201ENST00000381867 5533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
BRAFP15056 TMPRSS3-203ENST00000398405 2754 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
BRAFP15056 ALAS1-204ENST00000469224 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
BRAFP15056 SHCBP1-201ENST00000303383 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
BRAFP15056 FBLIM1-203ENST00000375771 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
BRAFP15056 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
BRAFP15056 ADCY6-201ENST00000307885 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
BRAFP15056 NOP58-201ENST00000264279 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
BRAFP15056 RRN3P3-202ENST00000551766 3366 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
BRAFP15056 PCK2-216ENST00000561286 2012 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
BRAFP15056 DPP3-209ENST00000531863 2974 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
BRAFP15056 MAN2C1-216ENST00000563622 2961 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
BRAFP15056 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
BRAFP15056 TINF2-215ENST00000626689 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
BRAFP15056 IGHG4-202ENST00000641978 2597 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
BRAFP15056 HCFC2-201ENST00000229330 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
BRAFP15056 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
BRAFP15056 UBE3A-220ENST00000630424 5075 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
BRAFP15056 HFE-202ENST00000317896 1922 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
BRAFP15056 GRM5-AS1-201ENST00000526448 4821 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
BRAFP15056 MYOM3-202ENST00000374434 5804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
BRAFP15056 BRPF1-205ENST00000433861 4304 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
BRAFP15056 TRPM2-204ENST00000397932 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
BRAFP15056 ZFP36L2-201ENST00000282388 3696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
BRAFP15056 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
BRAFP15056 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
BRAFP15056 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
BRAFP15056 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
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BRAFP15056 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
BRAFP15056 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
BRAFP15056 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
BRAFP15056 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
BRAFP15056 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
BRAFP15056 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
BRAFP15056 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
BRAFP15056 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC14.88□□□□□ -0.03
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BRAFP15056 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
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BRAFP15056 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
BRAFP15056 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
BRAFP15056 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
BRAFP15056 ITGB4-202ENST00000449880 5689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
BRAFP15056 BORCS5-202ENST00000314565 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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BRAFP15056 TMEM130-203ENST00000416379 2881 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
BRAFP15056 ARSH-201ENST00000381130 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
BRAFP15056 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
BRAFP15056 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
BRAFP15056 ZBP1-201ENST00000371173 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
BRAFP15056 IL12RB1-203ENST00000593993 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
BRAFP15056 FHOD3-201ENST00000257209 4967 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
BRAFP15056 FAM189A1-201ENST00000261275 4705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
BRAFP15056 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
BRAFP15056 NFATC1-205ENST00000427363 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
BRAFP15056 SHROOM1-203ENST00000378679 4019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
BRAFP15056 KIAA1614-201ENST00000367587 3309 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
BRAFP15056 TUNAR-201ENST00000503525 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
BRAFP15056 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
BRAFP15056 ZNF135-205ENST00000511556 2253 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
BRAFP15056 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
BRAFP15056 IKBKG-208ENST00000611176 1654 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
BRAFP15056 OTUD4-201ENST00000447906 3829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
BRAFP15056 AGFG1-204ENST00000409315 2912 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
BRAFP15056 RBM6-211ENST00000443081 4010 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
BRAFP15056 LINC00299-202ENST00000442956 2342 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
BRAFP15056 CD99L2-208ENST00000613030 3742 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
BRAFP15056 SDC1-202ENST00000381150 3291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
BRAFP15056 SEPT7-202ENST00000399034 4399 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
BRAFP15056 ADAM17-203ENST00000497134 1873 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
BRAFP15056 LRRFIP2-202ENST00000354379 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
BRAFP15056 AP1B1-201ENST00000317368 3903 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
BRAFP15056 ABCA2-203ENST00000371605 8151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
BRAFP15056 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
BRAFP15056 SMAGP-203ENST00000603798 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
BRAFP15056 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
BRAFP15056 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
BRAFP15056 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
BRAFP15056 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
BRAFP15056 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
BRAFP15056 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
BRAFP15056 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
BRAFP15056 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
BRAFP15056 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
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