Protein–RNA interactions for Protein: P13378

HOXD8, Homeobox protein Hox-D8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8P13378 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXD8P13378 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXD8P13378 RHD-209ENST00000568195 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXD8P13378 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
HOXD8P13378 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
HOXD8P13378 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
HOXD8P13378 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
HOXD8P13378 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
HOXD8P13378 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
HOXD8P13378 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
HOXD8P13378 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
HOXD8P13378 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXD8P13378 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXD8P13378 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXD8P13378 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXD8P13378 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXD8P13378 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXD8P13378 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXD8P13378 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXD8P13378 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXD8P13378 MAGEA4-202ENST00000360243 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXD8P13378 MAGEA4-203ENST00000370335 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXD8P13378 MAGEA4-204ENST00000370340 1773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXD8P13378 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXD8P13378 HPGD-201ENST00000296521 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXD8P13378 OR4S1-201ENST00000319988 930 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXD8P13378 S100A3-202ENST00000368713 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXD8P13378 MIR1227-201ENST00000408484 88 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXD8P13378 EIF4E2-205ENST00000409394 604 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXD8P13378 AL590093.1-201ENST00000416119 623 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXD8P13378 SNX3-204ENST00000426155 1072 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXD8P13378 RN7SL582P-201ENST00000491078 279 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXD8P13378 AC010234.1-201ENST00000494599 870 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXD8P13378 AC100858.1-201ENST00000514059 1228 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXD8P13378 C17orf62-216ENST00000578919 841 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXD8P13378 AC055811.3-201ENST00000584952 686 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXD8P13378 AL136982.5-201ENST00000605222 294 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXD8P13378 MYOZ3-209ENST00000615557 1031 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXD8P13378 PFDN5-220ENST00000628881 231 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXD8P13378 ILK-201ENST00000299421 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXD8P13378 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXD8P13378 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXD8P13378 ING4-207ENST00000446105 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXD8P13378 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXD8P13378 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXD8P13378 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXD8P13378 TMEM145-203ENST00000598766 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXD8P13378 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXD8P13378 MAGEH1-201ENST00000342972 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXD8P13378 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXD8P13378 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXD8P13378 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXD8P13378 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXD8P13378 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXD8P13378 OR2A25-202ENST00000641441 1733 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXD8P13378 UBOX5-AS1-201ENST00000446537 1792 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXD8P13378 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXD8P13378 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXD8P13378 FAM124B-201ENST00000243806 2030 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXD8P13378 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXD8P13378 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXD8P13378 PPM1N-205ENST00000401705 771 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXD8P13378 AC016757.1-202ENST00000409376 892 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXD8P13378 AP001628.2-201ENST00000420273 784 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXD8P13378 EFNA4-203ENST00000427683 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXD8P13378 AC106869.1-201ENST00000448713 577 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXD8P13378 AC068057.1-201ENST00000453322 709 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXD8P13378 AP003068.3-201ENST00000527789 175 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXD8P13378 DNAJB13-203ENST00000537753 912 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXD8P13378 ZNF586-204ENST00000598183 603 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXD8P13378 AC008972.2-201ENST00000606587 494 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXD8P13378 LINC00969-257ENST00000625632 898 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXD8P13378 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXD8P13378 PIP4K2A-201ENST00000323883 1319 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXD8P13378 FAM90A21P-201ENST00000510875 1396 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXD8P13378 FAM90A15P-201ENST00000514465 1395 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXD8P13378 FAM90A6P-201ENST00000515148 1394 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXD8P13378 FAM90A16P-201ENST00000526662 1395 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXD8P13378 FAM90A9P-201ENST00000527940 1395 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXD8P13378 FAM90A5P-201ENST00000528738 1395 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXD8P13378 FAM90A14P-201ENST00000530386 1395 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXD8P13378 FAM90A13P-201ENST00000534703 1395 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXD8P13378 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXD8P13378 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXD8P13378 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXD8P13378 SDF2-201ENST00000247020 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXD8P13378 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXD8P13378 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXD8P13378 RFX8-201ENST00000428343 1686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXD8P13378 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXD8P13378 PES1P2-201ENST00000449745 1735 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXD8P13378 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXD8P13378 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXD8P13378 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXD8P13378 RNF167-201ENST00000262482 1915 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXD8P13378 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXD8P13378 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXD8P13378 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXD8P13378 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXD8P13378 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 189.1 ms