Protein–RNA interactions for Protein: P0DO97

CCDC192, Coiled-coil domain-containing protein 192, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC192P0DO97 GUSBP11-206ENST00000455485 3816 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC192P0DO97 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC192P0DO97 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC192P0DO97 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC192P0DO97 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC192P0DO97 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC192P0DO97 KRT18P8-201ENST00000581937 1246 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC192P0DO97 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC192P0DO97 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC192P0DO97 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC192P0DO97 SDC1-202ENST00000381150 3291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC192P0DO97 TJAP1-208ENST00000438588 2716 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC192P0DO97 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC192P0DO97 MICAL1-202ENST00000358807 3645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC192P0DO97 TMEM173-201ENST00000330794 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC192P0DO97 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC192P0DO97 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC192P0DO97 PIK3R3-203ENST00000420542 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC192P0DO97 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC192P0DO97 PFKP-203ENST00000381125 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC192P0DO97 S100PBP-203ENST00000373476 3320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC192P0DO97 DNAJC3-AS1-201ENST00000499499 2908 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC192P0DO97 LIMD2-201ENST00000259006 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC192P0DO97 BRPF1-205ENST00000433861 4304 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC192P0DO97 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC192P0DO97 ZBTB47-201ENST00000232974 3781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC192P0DO97 VGLL3-202ENST00000398399 10400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC192P0DO97 GRIN1-202ENST00000371546 4114 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC192P0DO97 PRC1-204ENST00000442656 2060 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC192P0DO97 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC192P0DO97 PRELP-201ENST00000343110 5747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC192P0DO97 SERPING1-201ENST00000278407 2002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC192P0DO97 ELN-209ENST00000380576 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC192P0DO97 OXA1L-202ENST00000358043 1750 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC192P0DO97 SACM1L-201ENST00000389061 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC192P0DO97 STX16-207ENST00000371141 4937 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC192P0DO97 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC192P0DO97 SYNGR1-204ENST00000381535 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC192P0DO97 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC192P0DO97 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC192P0DO97 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC192P0DO97 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC192P0DO97 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC192P0DO97 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC192P0DO97 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC192P0DO97 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC192P0DO97 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC192P0DO97 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC192P0DO97 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC192P0DO97 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC192P0DO97 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC192P0DO97 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC192P0DO97 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC192P0DO97 MAP7D2-201ENST00000379643 3918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC192P0DO97 HMGCL-203ENST00000374490 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC192P0DO97 ISY1-RAB43-201ENST00000418265 4868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC192P0DO97 RAPGEF3-205ENST00000449771 6061 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC192P0DO97 WARS2-201ENST00000235521 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC192P0DO97 METAP1D-201ENST00000315796 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC192P0DO97 STIM1-220ENST00000616714 4356 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC192P0DO97 AXL-203ENST00000593513 2557 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC192P0DO97 LCMT1-203ENST00000399069 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC192P0DO97 POU2AF1-201ENST00000393067 3295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC192P0DO97 AC010255.3-203ENST00000509403 1727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC192P0DO97 DRD2-201ENST00000346454 2433 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC192P0DO97 CD99L2-208ENST00000613030 3742 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC192P0DO97 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC192P0DO97 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC192P0DO97 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC192P0DO97 TRIM13-202ENST00000378182 7249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC192P0DO97 EHMT2-201ENST00000375528 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC192P0DO97 CPT1A-202ENST00000376618 2635 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC192P0DO97 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC192P0DO97 WASHC5-202ENST00000517845 3667 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC192P0DO97 ABAT-215ENST00000569156 1911 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC192P0DO97 RHOH-224ENST00000622175 2254 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC192P0DO97 MKL1-201ENST00000355630 4496 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC192P0DO97 AGAP12P-201ENST00000585227 2359 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC192P0DO97 GNAO1-214ENST00000638705 3529 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC192P0DO97 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC192P0DO97 FRMD8-201ENST00000317568 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC192P0DO97 LDB3-207ENST00000542786 1889 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC192P0DO97 MTCL1-202ENST00000359865 6093 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC192P0DO97 GLB1L3-201ENST00000389887 3566 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC192P0DO97 THEMIS2-201ENST00000328928 2337 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC192P0DO97 SUOX-202ENST00000356124 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC192P0DO97 LDLRAD2-201ENST00000344642 4012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC192P0DO97 OSBP2-219ENST00000535268 3248 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC192P0DO97 PAX2-202ENST00000361791 3193 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC192P0DO97 ATP6V0A4-202ENST00000353492 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC192P0DO97 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC192P0DO97 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC192P0DO97 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC192P0DO97 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC192P0DO97 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC192P0DO97 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC192P0DO97 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC192P0DO97 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC192P0DO97 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC192P0DO97 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 160.8 ms