Protein–RNA interactions for Protein: F8W1W9

NPIPB9, Nuclear pore complex-interacting protein family member B9, humanhuman

Predictions only

Length 429 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPIPB9F8W1W9 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
NPIPB9F8W1W9 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
NPIPB9F8W1W9 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
NPIPB9F8W1W9 AC125604.1-201ENST00000496255 707 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
NPIPB9F8W1W9 RCC2P8-201ENST00000502779 1035 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
NPIPB9F8W1W9 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
NPIPB9F8W1W9 AC025259.3-202ENST00000564363 687 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
NPIPB9F8W1W9 AC093752.3-201ENST00000567343 901 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
NPIPB9F8W1W9 AC010754.1-201ENST00000582300 1061 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
NPIPB9F8W1W9 PSENEN-203ENST00000591949 833 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
NPIPB9F8W1W9 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
NPIPB9F8W1W9 NUBPL-201ENST00000281081 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
NPIPB9F8W1W9 MAPT-IT1-201ENST00000624111 3016 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
NPIPB9F8W1W9 SMOC2-201ENST00000354536 3150 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
NPIPB9F8W1W9 TMBIM6-217ENST00000549385 2771 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
NPIPB9F8W1W9 ENO3-202ENST00000518175 1448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
NPIPB9F8W1W9 SP8-203ENST00000617581 3496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
NPIPB9F8W1W9 ARMC5-202ENST00000408912 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
NPIPB9F8W1W9 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
NPIPB9F8W1W9 ZNF576-201ENST00000336564 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
NPIPB9F8W1W9 NAP1L2-201ENST00000373517 2550 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
NPIPB9F8W1W9 AL590824.1-201ENST00000403828 1349 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
NPIPB9F8W1W9 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
NPIPB9F8W1W9 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
NPIPB9F8W1W9 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
NPIPB9F8W1W9 CRYL1-201ENST00000298248 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
NPIPB9F8W1W9 PRKD1-209ENST00000616995 3498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
NPIPB9F8W1W9 TNNI1-201ENST00000336092 1750 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
NPIPB9F8W1W9 AC008429.1-202ENST00000518818 2067 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
NPIPB9F8W1W9 POU2F2-204ENST00000526816 3218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NPIPB9F8W1W9 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NPIPB9F8W1W9 C7orf33-201ENST00000307003 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NPIPB9F8W1W9 AGER-201ENST00000375055 1369 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NPIPB9F8W1W9 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NPIPB9F8W1W9 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NPIPB9F8W1W9 AC013460.1-202ENST00000435062 2253 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
NPIPB9F8W1W9 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NPIPB9F8W1W9 TUNAR-201ENST00000503525 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NPIPB9F8W1W9 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NPIPB9F8W1W9 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
NPIPB9F8W1W9 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NPIPB9F8W1W9 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NPIPB9F8W1W9 ANO10-202ENST00000350459 2039 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NPIPB9F8W1W9 B4GALT3-202ENST00000367998 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NPIPB9F8W1W9 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NPIPB9F8W1W9 HSDL2-202ENST00000398805 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NPIPB9F8W1W9 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
NPIPB9F8W1W9 XG-202ENST00000419513 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NPIPB9F8W1W9 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
NPIPB9F8W1W9 AC087521.1-201ENST00000501541 2045 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
NPIPB9F8W1W9 AC132803.1-201ENST00000504204 493 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
NPIPB9F8W1W9 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
NPIPB9F8W1W9 MTSS1-216ENST00000524090 2166 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
NPIPB9F8W1W9 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
NPIPB9F8W1W9 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
NPIPB9F8W1W9 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
NPIPB9F8W1W9 SKA2-205ENST00000580541 689 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
NPIPB9F8W1W9 LINC00665-205ENST00000585356 1557 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
NPIPB9F8W1W9 TUBB4A-212ENST00000601152 590 ntTSL 4 BASIC13.09□□□□□ -0.31
NPIPB9F8W1W9 AL645939.5-201ENST00000606834 243 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
NPIPB9F8W1W9 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
NPIPB9F8W1W9 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
NPIPB9F8W1W9 AL022334.2-201ENST00000610000 484 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
NPIPB9F8W1W9 ZCCHC4-206ENST00000612982 938 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
NPIPB9F8W1W9 MEF2C-227ENST00000626391 1182 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NPIPB9F8W1W9 MEF2C-231ENST00000628656 1254 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NPIPB9F8W1W9 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NPIPB9F8W1W9 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NPIPB9F8W1W9 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
NPIPB9F8W1W9 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NPIPB9F8W1W9 RSPO3-201ENST00000356698 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NPIPB9F8W1W9 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
NPIPB9F8W1W9 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NPIPB9F8W1W9 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NPIPB9F8W1W9 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NPIPB9F8W1W9 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.09□□□□□ -0.31
NPIPB9F8W1W9 SYNRG-225ENST00000619541 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NPIPB9F8W1W9 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NPIPB9F8W1W9 AP003555.1-202ENST00000511013 1755 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NPIPB9F8W1W9 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NPIPB9F8W1W9 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
NPIPB9F8W1W9 CYP4B1-202ENST00000371919 1494 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NPIPB9F8W1W9 CDH20-202ENST00000536675 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NPIPB9F8W1W9 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
NPIPB9F8W1W9 C17orf53-201ENST00000245382 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NPIPB9F8W1W9 AMT-201ENST00000273588 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NPIPB9F8W1W9 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
NPIPB9F8W1W9 ZFYVE27-202ENST00000357540 2765 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
NPIPB9F8W1W9 ZFYVE27-204ENST00000370610 2769 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
NPIPB9F8W1W9 CPXM2-201ENST00000241305 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NPIPB9F8W1W9 SLC1A7-202ENST00000371494 2637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NPIPB9F8W1W9 ERC1-219ENST00000546231 4390 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
NPIPB9F8W1W9 IKBKG-208ENST00000611176 1654 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.31
NPIPB9F8W1W9 RMDN3-201ENST00000260385 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
NPIPB9F8W1W9 TMBIM4-202ENST00000358230 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
NPIPB9F8W1W9 GPRC5B-209ENST00000569479 2984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
NPIPB9F8W1W9 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
NPIPB9F8W1W9 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
NPIPB9F8W1W9 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
NPIPB9F8W1W9 LIG1-202ENST00000427526 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.4 ms